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小麦苗期干旱、高温和旱热共胁迫转录表达谱及ABD部分同源基因表达分化分析

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
縮略词第13-14页
第一章 :文献综述第14-33页
   ·引言第14页
   ·植物抗旱耐热的生理学基础第14-16页
     ·旱热胁迫对植物光合作用的影响第14-15页
     ·旱热胁迫对植物呼吸作用的影响第15页
     ·旱热胁迫对其他生理代谢过程的影响第15-16页
   ·植物抗旱耐热的分子生物学基础第16-28页
     ·旱热胁迫信号传递途径第16-19页
     ·植物在转录水平对早热胁迫的响应第19-25页
     ·表观遗传机制对植物旱热胁迫响应的调控第25-28页
   ·植物基因组多倍化与抵御非生物逆境胁迫第28-31页
     ·基因组多倍化对植物抗逆性的影响第28-29页
     ·多倍体植物部分同源基因对逆境胁迫响应的分化第29-30页
     ·六倍体普通小麦的起源、分布及基因组测序进展第30-31页
   ·立论依据和研究内容第31-33页
     ·立论依据第31页
     ·研究目标和内容第31-33页
第二章 :TAM107苗期叶片旱热胁迫转录表达谱分析第33-61页
   ·材料和方法第33-39页
     ·供试材料第33页
     ·胁迫处理方法第33-34页
     ·总RNA提取和建库第34页
     ·RNA-Seq数据分析方法第34-37页
     ·序列注释方法第37-38页
     ·转录表达谱分析结果的验证-荧光实时定量PCR第38-39页
   ·分析结果第39-58页
     ·RNA-Seq数据质量统计第39-40页
     ·小麦参考Unigene的构建第40-41页
     ·干旱、高温和早热共胁迫差异表达基因的比较分析第41-43页
     ·干旱、高温和早热共胁迫响应基因功能富集分析第43-47页
     ·表观遗传修饰相关基因对干旱、高温和早热共胁迫的响应第47-50页
     ·干旱、高温和早热共胁迫响应的转录因子基因比较分析第50-52页
     ·HSFs和DREBs转录因子转录调控网络分析第52-55页
     ·旱热胁迫响应基因在小麦不同染色体上的分布分析第55-58页
   ·讨论第58-61页
     ·干旱和高温胁迫同时发生时能激活特异的响应途径第58-59页
     ·胁迫响应基因在染色体上成簇分布可能更有利于植物抗逆第59-61页
第三章 :小麦ABD部分同源基因响应旱热胁迫的表达分化第61-79页
   ·分析方法第61-64页
     ·Triplets的筛选和序列比对第61-62页
     ·基于RNA-Seq的ABD部分同源基因表达定量新算法开发第62-64页
   ·分析结果第64-76页
     ·Triplets统计结果第64-65页
     ·新算法准确性的验证第65-67页
     ·A、B、D部分同源基因表达分化分析第67-71页
     ·A、B、D部分同源基因对旱热胁迫的响应分化分析第71-76页
   ·讨论第76-79页
     ·六倍体小麦A、B、D亚染色体组间基因表达模式发生分化第76-77页
     ·A、B、D部分同源基因对胁迫响应的分化可能有利于小麦适应复杂多变的自然环境第77-79页
第四章 :小麦苗期叶片和旗叶高温胁迫转录表达谱对比分析第79-87页
   ·材料和方法第79-80页
     ·供试材料和胁迫处理方法第79页
     ·芯片杂交实验流程第79页
     ·数据分析方法第79-80页
   ·分析结果第80-86页
     ·芯片杂交质量检验第80-81页
     ·高温胁迫差异表达基因的鉴定第81页
     ·苗期叶片和旗叶高温胁迫响应基因的对比分析第81-85页
     ·苗期叶片和旗叶特异的高温胁迫响应基因第85-86页
   ·讨论第86-87页
     ·苗期叶片和旗叶主要通过激活相同的基因和代谢途径对抗高温胁迫第86-87页
第五章 :结论第87-88页
参考文献第88-101页
致谢第101-102页
附录第102-108页
作者简历第108页

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