| 致谢 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第11-15页 |
| 引言 | 第15-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-47页 |
| ·椰枣 | 第17-28页 |
| ·椰枣树 | 第17-18页 |
| ·椰枣基因组和转录组研究现状 | 第18-28页 |
| ·miRNA | 第28-47页 |
| ·miRNA的生物学特点 | 第28-29页 |
| ·miRNA的生物合成 | 第29-30页 |
| ·miRNA~*的生物合成及其功能 | 第30-31页 |
| ·miRNA与其靶基因的作用方式 | 第31-34页 |
| ·miRNA的靶位点区域 | 第31页 |
| ·miRNA的作用机制 | 第31-34页 |
| ·miRNA的生物学功能 | 第34-38页 |
| ·动物miRNA的生物学功能 | 第34页 |
| ·植物miRNA的生物学功能 | 第34-38页 |
| ·miRNA的研究方法 | 第38-47页 |
| ·miRNA检测的实验方法 | 第39-44页 |
| ·miRNA的生物信息学方法 | 第44-47页 |
| 第二章 椰枣microRNA鉴定及其在果实发育过程中的表达谱研究 | 第47-79页 |
| ·材料和方法 | 第47-58页 |
| ·实验材料 | 第47页 |
| ·小RNA SOLiD文库的构建及上机测序 | 第47-53页 |
| ·CTAB方法提取果实中的总RNA | 第48-49页 |
| ·DNase Ⅰ处理总RNA样本 | 第49-50页 |
| ·小RNA片段的分离 | 第50页 |
| ·小RNA文库的构建 | 第50-51页 |
| ·SOLiD测序模板磁珠的制备及上机测序 | 第51-53页 |
| ·数据分析流程 | 第53-55页 |
| ·生物信息学方法预测椰枣保守miRNA | 第53-54页 |
| ·高通量测序数据分析 | 第54-55页 |
| ·差异表达分析 | 第55页 |
| ·Stem-loop RT-PCR验证分析 | 第55-58页 |
| ·总RNA的提取和处理 | 第55页 |
| ·反转录成cDNA | 第55-56页 |
| ·实时定量荧光PCR | 第56-58页 |
| ·靶基因预测和功能分析 | 第58页 |
| ·结果 | 第58-73页 |
| ·椰枣全基因组中保守miRNA的预测 | 第58-61页 |
| ·高通量测序数据结果分析 | 第61-65页 |
| ·测序数据概况及分析 | 第61-62页 |
| ·椰枣中保守miRNA的表达 | 第62-64页 |
| ·椰枣果实发育过程中新miRNA的预测和验证 | 第64-65页 |
| ·椰枣miRNA的靶基因预测和分析 | 第65-67页 |
| ·椰枣果实发育过程中miRNA的表达模式分析 | 第67-69页 |
| ·椰枣miRNA与其靶基因表达之间的相关性分析 | 第69-73页 |
| ·讨论 | 第73-77页 |
| ·椰枣基因组中保守miRNA的鉴定 | 第73-75页 |
| ·椰枣miRNA的保守和非保守靶基因的预测 | 第75-76页 |
| ·椰枣miRNA在果实发育过程中的作用 | 第76-77页 |
| ·小结 | 第77-79页 |
| ·本研究的主要结果 | 第77页 |
| ·本研究的创新点 | 第77-78页 |
| ·本研究的不足之处 | 第78页 |
| ·下一步的工作计划 | 第78-79页 |
| 参考文献 | 第79-95页 |
| 附录 | 第95-109页 |
| 附表一 利用生物信息学方法预测的椰枣中保守的miRNA | 第95-101页 |
| 附表二 在椰枣果实发育和成熟过程中鉴定的新的miRNA | 第101-109页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第109-111页 |
| 作者简历 | 第109页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第109-111页 |
