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猪脂肪沉积关键基因的筛选及锌指蛋白KLF13的功能研究

摘要第1-13页
ABSTRACT第13-19页
缩略语表第19-20页
第一章 文献综述第20-46页
 1 前言第20-21页
 2 猪脂肪组织沉积第21-23页
   ·猪脂肪组织沉积部位的分布第21-22页
   ·皮下脂肪与肌内脂肪的比较第22-23页
 3 脂肪细胞生成第23-30页
   ·动物体内脂肪细胞的来源第23-24页
   ·脂肪生成过程第24-25页
   ·调控脂肪分化的主要信号通路第25-26页
   ·调控脂肪分化的主要转录因子第26-30页
     ·转录因子在脂肪分化过程中的作用第26页
     ·脂肪分化的核心转录因子-PPARγ第26-29页
     ·脂肪分化的关键转录因子-C/EBPs家族第29-30页
 4 KLFs家族调控脂肪分化的研究进展第30-39页
   ·KLFs家族成员的结构和功能第30-31页
   ·KLFs在脂肪分化过程中的作用及方式第31-38页
     ·促进脂肪分化的KLFs第33-36页
     ·抑制脂肪分化的KLFs第36-38页
   ·KLF13研究进展第38-39页
     ·KLF13结构及特点第38页
     ·KLF13的功能研究第38-39页
 5 从转录水平筛选和鉴定猪脂肪分化过程中重要转录因子第39-44页
   ·高通量筛选差异表达基因的技术第40-42页
     ·表达谱芯片第40-41页
     ·RNA-Seq技术第41-42页
   ·从差异表达基因到转录因子第42-43页
   ·生物信息学分析和靶定与猪脂肪分化相关的转录因子第43-44页
   ·鉴定猪脂肪分化过程中新转录因子的研究策略第44页
 6 课题研究的目的意义第44-46页
第二章 猪皮下和肌内脂肪前体细胞成脂分化过程中基因表达水平的比较与分析第46-70页
 1 前言第46-47页
 2 材料与方法第47-51页
   ·分离猪皮下脂肪和肌肉中SV细胞第47页
   ·皮下脂肪和肌肉内SV细胞的成脂诱导以及样品收集第47-48页
   ·总RNA抽提第48页
   ·cDNA文库的构建和HiSeq 2000平台的测序第48-49页
   ·差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的筛选第49-50页
   ·Q-PCR分析第50页
   ·基因的功能注释第50-51页
   ·基因表达模式的聚类分析第51页
 3 结果与分析第51-68页
   ·Illumina HiSeq2000高通量测序结果的数据统计分析第51-52页
   ·注释基因的分析第52-53页
   ·在成脂分化过程中比较ASVC和MSVC的基因表达第53-55页
   ·Q-PCR验证DEGs的表达第55-56页
   ·ASVC和MSVC之间DEGs的功能注释第56-62页
   ·ASVC和MSVC之间DEGs在成脂分化中表达模式的聚类分析第62-68页
 4 讨论第68-70页
   ·比较ASVC和MSVC在成脂分化过程中基因表达水平的差异第68页
   ·ASVC和MSVC之间DEGs的功能注释第68-70页
第三章 猪皮下和肌内脂肪前体细胞成脂分化过程中差异表达基因的筛选与分析第70-85页
 1 前言第70页
 2 材料与方法第70-72页
   ·分离猪皮下脂肪和肌肉中SV细胞第70-71页
   ·皮下脂肪和肌肉内SV细胞的成脂诱导以及样品收集第71页
   ·总RNA抽提第71页
   ·差异表达基因的筛选第71页
   ·基因表达模式的聚类分析第71页
   ·基因的功能注释第71页
   ·转录因子结合位点的分析第71-72页
 3 结果与分析第72-81页
   ·ASVC和MSVC成脂分化过程中DEGs的筛选第72页
   ·ASVC和MSVC成脂分化过程中DEGs表达模式的聚类分析第72-74页
   ·显著性表达模式中DEGs的功能注释第74-79页
   ·ASVC和MSVC成脂分化过程中候选转录因子基因的筛选第79-81页
 4 讨论第81-85页
   ·ASVC和MSVC成脂分化过程中的DEGs第81页
   ·ASVC和MSVC成脂分化过程中DEGs的表达模式聚类分析第81-82页
   ·显著性表达模式中DEGs的功能注释第82-83页
   ·ASVC和MSVC成脂分化过程中的候选转录因子第83-85页
第四章 KLF13特异性调控猪脂肪分化的机制第85-126页
 1 前言第85-86页
 2 材料和方法第86-96页
   ·试验材料第86页
     ·动物、细胞和细菌材料第86页
     ·载体和质粒第86页
   ·主要仪器、试剂和溶液的配制第86-89页
     ·主要仪器第86-87页
     ·主要试剂和试剂盒第87-88页
     ·主要溶液的配制第88-89页
   ·试验方法第89-96页
     ·猪脂肪和肌肉SV细胞的分离同第二章2.1第89页
     ·猪成熟脂肪细胞的分离和DFAT细胞的获得第89-90页
     ·成脂诱导的方式第90页
     ·油红O染色第90页
     ·总RNA抽提及反转录第90-91页
     ·基因组DNA的抽提第91页
     ·基因的克隆和表达质粒的构建第91页
     ·Real-time PCR第91-93页
     ·Western Blot第93-94页
     ·启动子的突变和删除第94-95页
     ·细胞转染第95页
     ·双荧光素酶活性检测第95页
     ·染色质免疫沉淀第95-96页
     ·统计分析第96页
 3 结果与分析第96-122页
   ·KLF13对猪脂肪SV细胞成脂分化的影响第96-101页
     ·KLF13在猪脂肪SV细胞成脂分化过程中的表达模式第96-97页
     ·siRNA干涉KLF13的表达对猪脂肪SV细胞成脂分化的影响第97-99页
     ·超表达KLF13对猪脂肪SV细胞成脂分化的影响第99-101页
   ·KLF13对猪肌肉SV细胞成脂分化的影响第101-103页
     ·KLF13在猪肌肉SV细胞成脂分化过程中的表达模式第101-102页
     ·干涉KLF13对猪肌肉SV细胞成脂分化的影响第102-103页
   ·KLF13对猪DFAT细胞成脂分化的影响第103-105页
     ·KLF13在猪DFAT细胞成脂分化过程中的表达模式第103-104页
     ·干涉KLF13对猪DFAT细胞成脂分化的影响第104-105页
   ·KLF13调控猪脂肪分化所介导的靶基因的筛选第105-112页
     ·干涉KLF13对猪脂肪SV细胞成脂分化关键基因表达的影响第105-106页
     ·超表达KLF13对猪脂肪SV细胞成脂分化关键基因表达的影响第106-107页
     ·在成脂诱导条件下干涉KLF13对猪脂肪SV细胞成脂分化关键基因表达的影响第107-108页
     ·在成脂诱导条件下超表达KLF13对猪脂肪SV细胞成脂分化关键基因表达的影响第108-109页
     ·在成脂诱导条件下干涉KLF13对猪DFAT细胞成脂分化关键基因表达的影响第109-110页
     ·候选靶基因启动子上KLF13结合位点的预测第110-111页
     ·在成脂诱导条件下干涉和超表达KLF13对猪脂肪SV细胞PPARγ蛋白水平的影响第111-112页
   ·KLF13调控猪脂肪分化的机制第112-115页
     ·KLF13对截短的猪源PPARγ启动子活性的影响第112-113页
     ·KLF13对突变和删除KLF13结合位点的PPARγ启动子活性的影响第113-114页
     ·ChIP试验验证KLF13与猪源PPARγ启动子的结合第114-115页
   ·KLF13对鼠脂肪分化的影响第115-122页
     ·KLF13对鼠源前脂肪细胞系3T3-L1成脂分化过程中的表达模式第115-116页
     ·干涉KLF13对鼠源前脂肪细胞系3T3-L1成脂分化的影响第116-117页
     ·在成脂诱导条件下干涉KLF13对鼠成脂分化关键基因表达的影响第117-119页
     ·在成脂诱导条件下超表达KLF13对鼠成脂分化关键基因表达的影响第119-121页
     ·KLF13对鼠源PPARγ2启动子活性的影响第121-122页
 4 讨论第122-126页
   ·KLF13可以影响猪脂肪前体细胞成脂分化第122-123页
   ·KLF13通过PPARγ介导来影响猪脂肪分化第123-124页
   ·KLF13调控猪和鼠脂肪分化存在种属特异性第124-126页
第五章 结语第126-127页
 1 研究结论第126页
 2 创新点第126页
 3 本研究不足之处第126-127页
参考文献第127-141页
研究生在读期间发表论文第141-142页
致谢第142页

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