| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 引言 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-20页 |
| 1.1 雌雄花分化 | 第11-13页 |
| 1.1.1 单性花类型 | 第11页 |
| 1.1.2 影响植物性别决定及分化的因素 | 第11-13页 |
| 1.1.2.1 性染色体 | 第11-12页 |
| 1.1.2.2 性别分化基因 | 第12页 |
| 1.1.2.3 表观遗传 | 第12-13页 |
| 1.1.2.4 激素调控 | 第13页 |
| 1.2 MADS-box基因家族的研究进展 | 第13-19页 |
| 1.2.1 MADS-box基因的结构与分类 | 第13-14页 |
| 1.2.2 Ⅰ型MADS-box基因的功能 | 第14页 |
| 1.2.3 ABCDE模型及相关MADS-box基因的功能 | 第14-17页 |
| 1.2.4 其他MADS-box基因的功能 | 第17-18页 |
| 1.2.5 MADS-box基因家族的进化 | 第18-19页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第19-20页 |
| 第二章 MADS-box基因家族在被子植物中与花器官发育的关系 | 第20-31页 |
| 2.1 材料和方法 | 第20-22页 |
| 2.1.1 基因数据来源 | 第20页 |
| 2.1.2 MADS-box基因鉴定和亚组分类 | 第20-21页 |
| 2.1.3 转录组数据来源 | 第21页 |
| 2.1.4 转录组数据处理 | 第21-22页 |
| 2.2 结果与分析 | 第22-29页 |
| 2.2.1 MADS-box基因家族的分类 | 第22-23页 |
| 2.2.2 物种花器官与MADS-box基因家族的关系 | 第23-26页 |
| 2.2.3 转录组数据质量评估 | 第26页 |
| 2.2.4 花器官形成相关基因分析 | 第26-29页 |
| 2.3 本章小结 | 第29-31页 |
| 第三章 山核桃MADS-box基因家族生物信息学分析 | 第31-46页 |
| 3.1 材料和方法 | 第31-32页 |
| 3.1.1 山核桃MADS-box基因的鉴定 | 第31页 |
| 3.1.2 MADS-box基因家族的分类与进化树构建 | 第31页 |
| 3.1.3 山核桃MADS蛋白的理化性质分析 | 第31页 |
| 3.1.4 MADS-box基因结构分析与顺势作用元件预测 | 第31-32页 |
| 3.1.5 山核桃与核桃之间MADS-box基因的进化选择压力分析 | 第32页 |
| 3.2 结果与分析 | 第32-44页 |
| 3.2.1 MADS-box基因序列鉴定 | 第32-34页 |
| 3.2.2 MADS-box进化树分析和分组鉴定 | 第34-35页 |
| 3.2.3 山核桃MADS蛋白的理化性质分析 | 第35-38页 |
| 3.2.4 山核桃MADS蛋白的跨膜结构域及磷酸化位点预测分析 | 第38-40页 |
| 3.2.5 山核桃MADS家族基因结构分析 | 第40-42页 |
| 3.2.6 山核桃MADS家族基因启动子顺势作用元件预测分析 | 第42-43页 |
| 3.2.7 山核桃MADS-box基因家族与核桃间的进化选择压力分析 | 第43-44页 |
| 3.3 本章小结 | 第44-46页 |
| 第四章 山核桃雌雄花转录组分析 | 第46-69页 |
| 4.1 材料和方法 | 第46-47页 |
| 4.1.1 样品采取 | 第46页 |
| 4.1.1.1 二代测序材料 | 第46页 |
| 4.1.1.2 三代测序材料 | 第46页 |
| 4.1.2 体视显微镜下花器官的形态观察 | 第46页 |
| 4.1.3 转录组的高通量测序 | 第46-47页 |
| 4.1.3.1 测序数据处理 | 第46-47页 |
| 4.2 结果与分析 | 第47-63页 |
| 4.2.1 山核桃雌花分化形态学特征 | 第47-48页 |
| 4.2.2 山核桃雄花分化形态学特征 | 第48-50页 |
| 4.2.3 二代测序转录组数据分析 | 第50-59页 |
| 4.2.3.1 测序质量评估 | 第50页 |
| 4.2.3.2 雌花分化关键基因分析 | 第50-53页 |
| 4.2.3.3 雄花分化关键基因分析 | 第53-55页 |
| 4.2.3.4 植物激素相关基因的表达特征 | 第55-58页 |
| 4.2.3.5 MADS-box基因的表达分析 | 第58-59页 |
| 4.2.4 三代测序转录组数据分析 | 第59-63页 |
| 4.2.4.1 测序结果 | 第59-61页 |
| 4.2.4.2 激素合成代谢相关基因的转录本异构体 | 第61-62页 |
| 4.2.4.3 MADS-box基因转录本异构体 | 第62-63页 |
| 4.3 讨论 | 第63-69页 |
| 4.3.1 植物激素与山核桃雌雄花分化 | 第63-66页 |
| 4.3.2 MADS-box基因家族与山核桃雌雄花分化 | 第66-69页 |
| 第五章 结论与展望 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-75页 |
| 个人简介 | 第75-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
