| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-10页 |
| 第一部 一年生野生大豆（G.soja）和栽培大豆（G.max）的DNA甲基化多样性和遗传多样性研究 | 第10-41页 |
| 引言 | 第11-19页 |
| 一、野生大豆研究现状 | 第11-13页 |
| 野生大豆资源的应用 | 第11-13页 |
| 二、栽培大豆研究现状 | 第13-15页 |
| 三、DNA甲基化和转座子的研究对于野生大豆和栽培大豆多样性研究的相关性 | 第15-18页 |
| 四、本文选材和选题依据以及目的和意义 | 第18-19页 |
| 材料和方法 | 第19-30页 |
| 材料来源与实验方法 | 第19-30页 |
| 1、材料来源 | 第19-20页 |
| 2、实验方法 | 第20-30页 |
| ·植物基因组DNA的提取与纯化 | 第20-21页 |
| ·AFLP反应体系的建立 | 第21-26页 |
| ·MSAP反应体系的建立 | 第26-27页 |
| ·目的片断的克隆和测序分析 | 第27-30页 |
| 结果与分析 | 第30-38页 |
| 讨论 | 第38-40页 |
| 结论 | 第40-41页 |
| 第二部分 一年生野生大豆（G.soja）中反转录转座子反转录酶的克隆和分析 | 第41-67页 |
| 引言 | 第42页 |
| 1、反转录转座子及其研究进展 | 第42-50页 |
| ·反转录转座子的结构与分类 | 第42页 |
| ·反转录转座子活性 | 第42-44页 |
| ·反转录转座子的传递、起源和进化 | 第44-45页 |
| ·反转录转座子普遍存在于高等植物基因组中及其在基因组进化过程中的作用 | 第45-47页 |
| ·反转录转座子对基因表达的影响 | 第47页 |
| ·反转录转座子的应用 | 第47-48页 |
| ·大豆转座子研究进展 | 第48-50页 |
| 材料和方法 | 第50-55页 |
| 1、目的片断的克隆和测序分析 | 第50页 |
| ·PCR 扩增 | 第50页 |
| ·目的片段的回收和纯化 | 第50页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备和序列的连接转化同第一部分 | 第50页 |
| 2、测序及序列分析 | 第50-52页 |
| ·序列分析 | 第50-51页 |
| ·进化树重构 | 第51页 |
| ·转座子分组 | 第51页 |
| ·计算组内遗传距离和组间遗传距离 | 第51页 |
| ·同义替换和非同义替换计算 | 第51-52页 |
| ·目的序列在大豆染色体上的定位 | 第52页 |
| 3、转膜和杂交 | 第52-55页 |
| ·DNA酶切后电泳 | 第52页 |
| ·转膜 | 第52页 |
| ·探针标记 | 第52页 |
| ·杂交 | 第52-53页 |
| ·信号检测 | 第53-54页 |
| ·杂交信号的去除 | 第54-55页 |
| 结果与分析 | 第55-64页 |
| 1、一年生野生大豆中copia-like反转录转座子反转录酶序列的PCR扩增产物及其序列分析 | 第55-56页 |
| ·PCR扩增产物 | 第55页 |
| ·重组质粒中片段的筛选与回收 | 第55-56页 |
| 2. DNA测序分析 | 第56-60页 |
| ·测序结果的分析与系统树的构建 | 第56页 |
| ·序列分组 | 第56-60页 |
| 3、Southern 杂交结果分析 | 第60-64页 |
| ·杂交结果 | 第60-62页 |
| ·甲基化分析 | 第62-64页 |
| 讨论 | 第64-66页 |
| 结论 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 在学期间公开发表论文和著作情况 | 第80页 |
