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中国人参(Panax ginseng C.A.Meyer)野生和栽培类型的遗传多样性和DNA甲基化多态性研究

Abstract第1-6页
摘要第6-10页
General introduction第10-22页
   ·Background on Panax ginseng第10-13页
     ·Etymology, botanical position, and history of Panax ginseng第10-12页
     ·Classifications of Panax第12页
     ·Reproductive system, growth, and cultivation of ginseng第12-13页
     ·Importance of Panax ginseng第13-15页
     ·Medicinal importance of Panax ginseng第13-15页
     ·Bioactive compounds of Panax ginseng C.A. Meyer第15页
     ·Economic importance of ginseng第15页
   ·Genomic analyses of ginseng第15-17页
   ·Genetic diversity among and between plant populations第17-18页
   ·DNA methylation polymorphisms among and between plant populations第18-19页
   ·Aims and scope of the present work第19-22页
Materials and Methods第22-28页
   ·Plant material第22页
   ·Methods第22-28页
     ·Total genomic DNA extraction and purification第22-23页
     ·AFLP analysis第23-25页
     ·MSAP analysis第25-26页
     ·Band scoring and statistical data analysis第26-27页
     ·Isolation, cloning, and sequencing of AFLP and MSAP variable bands第27页
     ·Bisulfite conversion and sequencing第27-28页
Results analysis第28-47页
   ·AFLP polymorphisms第28-31页
     ·AFLP-based genetic structure of ginseng groups第30-31页
   ·MSAP analysis第31-41页
     ·Methylation levels in the studied groups of ginseng plants第31-35页
     ·Methylation-insensitive polymorphisms第35-36页
     ·MIP-based genetic structure of ginseng groups第36-38页
     ·Methylation-sensitive polymorphisms (MSP)第38-39页
     ·Epigenetic structure of ginseng groups第39-41页
   ·Summary of the indices of genetic and epigenetic diversity between wild and cultivated ginseng第41页
   ·Mantel test for correlations between genetic and epigenetic polymorphisms第41-42页
   ·Sequences of the AFLP and MSAP variants indicative of genetic and epigenetic polymorphisms第42-43页
   ·Validation of cytosine methylation alteration by bisulfite sequencing第43-47页
Discussion第47-51页
   ·Absence of clear genetic difference between wild and cultivated ginseng plants第47-48页
   ·Epigenetic distinctness between wild and cultivated ginseng plants第48-51页
Conclusions第51-52页
References第52-65页
Acknowledgements第65-66页
List of Publications第66页

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