| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 引言 | 第10-30页 |
| 1. 植物杂交及远缘杂交的研究历史 | 第10-13页 |
| ·早期对植物杂交的认识 | 第10-12页 |
| ·近代对植物杂交的研究 | 第12-13页 |
| 2. 远缘杂交和新物种形成 | 第13-18页 |
| ·异源多倍体与物种形成 | 第13-17页 |
| ·重组及同倍体物种形成（Recombinational and homoploid hybrid speciation） | 第17-18页 |
| 3. 远缘杂交和育种 | 第18-22页 |
| ·远缘杂交和育种工作中常见问题及解决方法 | 第18-20页 |
| ·两种重要的远缘杂交育种方法 | 第20-22页 |
| 4. 远缘杂交和基因组进化 | 第22-27页 |
| 5.D NA 甲基化研究 | 第24页 |
| ·DNA 甲基化酶控制的DNA 甲基化机制 | 第24-25页 |
| ·DNA 转葡糖基酶的去甲基化作用 | 第25-26页 |
| ·RNA 介导的植物DNA 甲基化（RNAdirected DNA Methylation , | 第26-27页 |
| 6. 微卫星研究 | 第27-30页 |
| 本研究的背景、目的和意义 | 第30-33页 |
| 实验材料与方法 | 第33-44页 |
| 1. 实验材料 | 第33-34页 |
| 2. 实验方法 | 第34-44页 |
| ·植物基因组DNA 的提取与纯化 | 第34页 |
| ·MSAP（methylation-sensitive amplified polymorphism, 甲基化敏感扩增多态性）分析 | 第34-38页 |
| ·微卫星分析 | 第38-39页 |
| ·特异片段的回收及克隆 | 第39-41页 |
| ·Southern 杂交 | 第41-43页 |
| ·反转录和 Real-Time PCR | 第43-44页 |
| 结果与分析 | 第44-61页 |
| 1. MSAP 全基因组检测渐渗系DNA 甲基化变异程度及模式 | 第44-50页 |
| ·渐渗系基因组胞嘧啶甲基化修饰水平较亲本呈明显升高趋势 | 第44-45页 |
| ·从亲本松前到渐渗杂交系特定位点胞嘧啶甲基化模式的遗传和变异检测研究 | 第45-48页 |
| ·Southern 杂交验证渐渗系基因组胞嘧啶甲基化变异和减数分裂过程变异稳定性检测 | 第48-49页 |
| ·CCGG 位点甲基化变异在渐渗系中是稳定遗传的 | 第49页 |
| ·渐渗系中胞嘧啶甲基化变异是全基因组范围的而且变异区域包括基因和转座子/反转座子序列 | 第49-50页 |
| 2. 渐渗系微卫星多态性检测及其功能分析 | 第50-61页 |
| ·在渐渗系核基因组，非编码区位点发生了广泛的变异而编码区微卫星位点则相当保守 | 第50-53页 |
| ·渐渗系细胞质DNA 同样产生了不同程度的变异，而这些变异甚至发生在编码区 | 第53页 |
| ·微卫星变异在渐渗系后代是稳定遗传的 | 第53-54页 |
| ·根据微卫星多态性的聚类分析 | 第54页 |
| ·在序列水平上渐渗系微卫星变异的特征 | 第54-56页 |
| ·在渐渗系MMR 同源基因表达发生了变化，同时MMR 基因胞嘧啶甲基化修饰发生了变化 | 第56-58页 |
| ·微卫星可能是基因表达的一个调节因子 | 第58-61页 |
| 讨论 | 第61-66页 |
| 1. 渐渗系基因组胞嘧啶甲基化修饰模式变异及其可能机制 | 第61-63页 |
| 2. 渐渗系微卫星变异特征及机制 | 第63-66页 |
| 结论 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-86页 |
| 附表 | 第86-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 在学期间公开发表论文及著作情况 | 第98页 |
