| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略语表 | 第12-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-29页 |
| 1 克氏原螯虾概述 | 第13-15页 |
| ·克氏原螯虾分类地位 | 第13页 |
| ·克氏原螯虾地理分布 | 第13页 |
| ·克氏原螯虾形态特征 | 第13-14页 |
| ·克氏原螯虾产业发展格局 | 第14页 |
| ·克氏原螯虾群体遗传学研究现状 | 第14-15页 |
| 2 微卫星标记在水产动物中的研究应用 | 第15-22页 |
| ·微卫星标记产生机理 | 第16页 |
| ·微卫星标记的特点 | 第16页 |
| ·水产动物微卫星序列的主要来源 | 第16-17页 |
| ·直接克隆所需位点 | 第16-17页 |
| ·从网上公布的序列中获得 | 第17页 |
| ·借用其他物种的标记 | 第17页 |
| ·微卫星的检测 | 第17-18页 |
| ·微卫星标记与其他DNA分子标记的比较 | 第18-19页 |
| ·微卫星标记在水产动物研究中的应用 | 第19-22页 |
| ·微卫星标记在遗传连锁图上的应用 | 第19-20页 |
| ·微卫星标记在性状分析方面的应用 | 第20页 |
| ·微卫星标记在群体遗传学方面的应用 | 第20-21页 |
| ·微卫星标记在进化方面的应用 | 第21页 |
| ·微卫星标记在水产动物种质鉴定方面的应用 | 第21-22页 |
| ·微卫星标记在遗传育种方面的应用 | 第22页 |
| 3 线粒体DNA在水产动物中的研究应用 | 第22-27页 |
| ·水产动物线粒体DNA的结构组成 | 第22-23页 |
| ·线粒体DNA的特性 | 第23-24页 |
| ·线粒体DNA多态性的研究方法 | 第24页 |
| ·限制性片段长度多态法 | 第24页 |
| ·测序法 | 第24页 |
| ·线粒体DNA在水产动物分子系统学中的应用 | 第24-27页 |
| ·系统发生关系和分类方面 | 第25页 |
| ·地理种群间的划分和遗传分化方面 | 第25-26页 |
| ·起源与进化方面 | 第26页 |
| ·动物种间、种内亲缘关系方面 | 第26-27页 |
| ·分子钟 | 第27页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第27-29页 |
| 第二章 长江中下游地区克氏原螯虾群体遗传多样性的微卫星分析 | 第29-48页 |
| 1 材料与方法 | 第29-37页 |
| ·实验材料 | 第29页 |
| ·主要仪器设备、试剂及配制方法 | 第29-32页 |
| ·主要仪器设备 | 第29页 |
| ·主要试剂 | 第29-31页 |
| ·试剂配制 | 第31-32页 |
| ·DNA提取所需试剂的配制 | 第31页 |
| ·电泳所用的有关试剂 | 第31-32页 |
| ·实验方法 | 第32-33页 |
| ·样品DNA提取 | 第32-33页 |
| ·样品DNA的琼脂糖凝胶电泳检测 | 第33页 |
| ·微卫星PCR | 第33-36页 |
| ·微卫星位点 | 第33页 |
| ·微卫星PCR扩增条件及产物检测 | 第33-34页 |
| ·PCR产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测 | 第34-36页 |
| ·12%聚丙烯酰胺凝胶的制备 | 第34页 |
| ·银染检测 | 第34-36页 |
| ·数据分析 | 第36-37页 |
| ·有效等位基因数(Effective number of alleles,Ne) | 第36页 |
| ·杂合度(Heterozygosity,H) | 第36页 |
| ·遗传距离(Genetic distance,D) | 第36页 |
| ·遗传相似系数(Genetic identity,I) | 第36-37页 |
| ·固定指数(Fixation index,F) | 第37页 |
| ·基因流(Gene flow,Nm) | 第37页 |
| ·多态信息含量(Polymorphism Information Content,PIC) | 第37页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡偏离指数 | 第37页 |
| 2.结果与分析 | 第37-45页 |
| ·电泳结果 | 第37-39页 |
| ·遗传多样性分析 | 第39-43页 |
| ·等位基因数 | 第39页 |
| ·遗传杂合度 | 第39-40页 |
| ·平均多态信息含量 | 第40-43页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡偏离指数 | 第43页 |
| ·群体遗传结构 | 第43-45页 |
| ·基因流和种群分化指数 | 第43-44页 |
| ·遗传相似系数和遗传距离 | 第44-45页 |
| ·聚类分析 | 第45页 |
| 3.讨论 | 第45-48页 |
| ·克氏原螯虾群体的遗传多样性 | 第45-46页 |
| ·克氏原螯虾群体遗传结构 | 第46-47页 |
| ·克氏原螯虾资源保护及利用 | 第47-48页 |
| 第三章 长江中下游地区克氏原螯虾群体线粒体DNA COI基因序列变异分析 | 第48-58页 |
| 1 材料与方法 | 第48-50页 |
| ·实验材料 | 第48-49页 |
| ·实验方法 | 第49-50页 |
| ·引物 | 第49页 |
| ·PCR扩增条件及产物检测 | 第49-50页 |
| ·数据处理 | 第50页 |
| 2.结果与分析 | 第50-55页 |
| ·序列特征 | 第50页 |
| ·遗传多样性 | 第50-51页 |
| ·群体遗传结构 | 第51页 |
| ·分子系统进化 | 第51-55页 |
| ·种群扩张 | 第55页 |
| 3.讨论 | 第55-58页 |
| ·序列特征 | 第55-56页 |
| ·遗传多样性 | 第56页 |
| ·群体遗传结构 | 第56-57页 |
| ·mtDNA COI基因与微卫星标记结果的比较 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 附录 | 第70页 |
