基于Web的生物大分子3D结构局部观察的可视化系统
摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-8页 |
1 前言 | 第12-34页 |
1.1 研究背景 | 第12-31页 |
1.2 本研究的主要内容 | 第31-34页 |
2 案例研究环境及其初始化 | 第34-51页 |
2.1 案例研究环境的选择 | 第34-41页 |
2.2 案例研究界面设计 | 第41-43页 |
2.3 PDB文件数据获取 | 第43-47页 |
2.4 3D场景初始化 | 第47-48页 |
2.5 序列信息的获取和解析 | 第48-49页 |
2.6 本章小结 | 第49-51页 |
3 分子局部3D交互观察 | 第51-62页 |
3.1 分子局部对象表达式 | 第51-52页 |
3.2 分子局部对象的选择 | 第52-55页 |
3.3 分子局部鼠标操作 | 第55-57页 |
3.4 传统分子局部外观改变 | 第57-59页 |
3.5 利用闪烁进行分子局部观察的新方法 | 第59-61页 |
3.6 本章小结 | 第61-62页 |
4 序列文本动态参照 | 第62-75页 |
4.1 被参照序列文本的基本编排 | 第62-63页 |
4.2 动态参照的界面效果 | 第63-67页 |
4.3 不同文本样式的叠加显示 | 第67-68页 |
4.4 文本样式变化的控制响应 | 第68-73页 |
4.5 序列文本中多个局部对象的集中显示 | 第73页 |
4.6 本章小结 | 第73-75页 |
5 历史操作状态的树形结构组织 | 第75-99页 |
5.1 树形结构组织的界面效果 | 第75-77页 |
5.2 历史操作状态数据保存形式 | 第77-86页 |
5.3 操作状态的保存 | 第86-91页 |
5.4 当前状态的切换 | 第91-94页 |
5.5 历史操作状态的删除 | 第94-96页 |
5.6 本章小结 | 第96-99页 |
6 历史操作状态的服务器保存和恢复 | 第99-114页 |
6.1 服务器保存和恢复的界面效果 | 第99-100页 |
6.2 历史操作状态数据的扩展 | 第100-101页 |
6.3 服务器端历史操作状态数据的保存形式 | 第101-104页 |
6.4 历史操作状态的服务器保存 | 第104-109页 |
6.5 浏览器端以前案例历史操作状态的恢复 | 第109-112页 |
6.6 本章小结 | 第112-114页 |
7 其他辅助分子3D结构局部观察研究的技术路线 | 第114-122页 |
7.1 场景状态复制和Jmol原始完整功能的使用 | 第114-115页 |
7.2 针对3D场景状态的文本注释 | 第115-117页 |
7.3 网页手动刷新机制的改进 | 第117-118页 |
7.4 浏览器端运行环境条件的检测及提示 | 第118-119页 |
7.5 用户管理 | 第119-121页 |
7.6 本章小结 | 第121-122页 |
8 全文总结及主要创新点 | 第122-128页 |
8.1 总结与展望 | 第122-127页 |
8.2 主要创新点 | 第127-128页 |
致谢 | 第128-129页 |
参考文献 | 第129-138页 |
附录Ⅰ 攻读博士学位期间发表的论文 | 第138-139页 |
附录Ⅱ 简写和缩略词 | 第139页 |