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斑节对虾miR-7562介导下ATG5-ATG12共轭系统应答哈维弧菌胁迫的作用机制研究

摘要第3-6页
ABSTRACT第6-8页
第一章 引言第12-16页
    1.1 斑节对虾简介第12页
    1.2 细胞自噬及免疫第12-13页
    1.3 自噬相关基因ATG5-ATG12的研究进展第13-14页
    1.4 miRNA简介第14-15页
    1.5 miRNA调控自噬相关基因研究进展第15页
    1.6 本研究的目的和意义第15-16页
第二章 自噬相关基因的克隆和组织表达第16-36页
    2.1 实验材料第16-18页
        2.1.1 实验研究动物第16页
        2.1.2 实验仪器第16-17页
        2.1.3 实验试剂与配制第17-18页
    2.2 实验方法第18-28页
        2.2.1 斑节对虾总RNA提取和cDNA的合成第18-19页
        2.2.2 斑节对虾基因cDNA全长的克隆第19-26页
        2.2.3 序列分析与系统进化树的构建第26页
        2.2.4 组织表达分析第26-28页
    2.3 实验结果第28-34页
        2.3.1 PmATG5和PmATG12基因的鉴定与特征第28-29页
        2.3.2 PmATG5和PmATG12进化树分析第29-33页
        2.3.3 斑节对虾PmATG5和PmATG12的组织分布第33-34页
    2.4 讨论第34-36页
第三章 斑节对虾中靶向沉默ATG5-ATG12共轭系统的MICRORNAS及SIRNAS的筛选第36-53页
    3.1 实验材料第36-37页
        3.1.1 实验动物第36页
        3.1.2 实验仪器第36页
        3.1.3 实验试剂与配制第36-37页
    3.2 实验方法第37-40页
        3.2.1 调控基因的miRNA的筛选第37页
        3.2.2 哈维弧菌和无乳链球菌胁迫实验第37页
        3.2.3 siRNA的合成及注射第37-38页
        3.2.4 双荧光素报告第38页
        3.2.5 Small RNA 的提取和逆转录第38-40页
    3.3 实验结果第40-49页
        3.3.1 靶向沉默ATG5-ATG12共轭系统的microRNAs的筛选第40-46页
        3.3.2 靶向沉默ATG5-ATG12共轭系统的siRNA的筛选第46-47页
        3.3.3 菌应激下其他免疫相关基因的表达模式第47-49页
    3.4 讨论第49-53页
第四章 MIRNA与ATG5-ATG12共轭系统的调控关系研究第53-61页
    4.1 实验材料第53-54页
        4.1.1 实验动物第53页
        4.1.2 实验试剂与配制第53-54页
    4.2 实验方法第54-56页
        4.2.1 样品总RNA的提取与cDNA的合成第54页
        4.2.2 miRNA的注射第54页
        4.2.3 总蛋白的提取第54-55页
        4.2.4 SDS-PAGE蛋白跑胶及蛋白免疫印迹(Western Blotting)第55-56页
    4.3 实验结果第56-59页
        4.3.1 miR-7562对PmATG5和PmATG12转录水平的调控第56-58页
        4.3.2 蛋白浓度测定标准曲线第58页
        4.3.3 miR-7562介导细胞自噬的发生第58-59页
    4.4 讨论第59-61页
第五章 斑节对虾MIR-7562介导下ATG5-ATG12共轭系统应答哈维弧菌胁迫的作用机制研究第61-69页
    5.1 实验材料第61页
        5.1.1 实验仪器第61页
        5.1.2 实验试剂与配制第61页
    5.2 实验方法第61-63页
        5.2.1 PmATG5和PmATG12基因的体外重组、蛋白纯化及抗体制备第61-63页
        5.2.2 miRNA、siRNA的注射第63页
    5.3 实验结果第63-67页
        5.3.1 哈维弧菌刺激下miR-7562通过调控ATG5-ATG12共轭系统影响细胞自噬发生第63-66页
        5.3.2 哈维弧菌刺激下ATG5-ATG12共轭系统与细胞自噬发生密切相关第66-67页
    5.4 讨论第67-69页
结论第69-71页
参考文献第71-78页
附录第78-79页
致谢第79页

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