| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第12-20页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第12-14页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第14-17页 |
| 1.2.1 基因的功能相似性 | 第14-15页 |
| 1.2.2 人类miRNA之间的功能相似性 | 第15-17页 |
| 1.3 本文主要工作 | 第17-18页 |
| 1.4 本文结构安排 | 第18-20页 |
| 第2章 人类miRNA之间功能相似性计算方法概述 | 第20-27页 |
| 2.1 引言 | 第20-21页 |
| 2.2 基于GO的基因功能相似性计算方法 | 第21-23页 |
| 2.3 人类miRNA之间功能相似性计算方法 | 第23-26页 |
| 2.4 小结 | 第26-27页 |
| 第3章 基于基因本体的人类miRNA之间功能相似性计算方法 | 第27-40页 |
| 3.1 引言 | 第27-28页 |
| 3.2 基因的功能相似性 | 第28页 |
| 3.3 功能关联强度 | 第28-29页 |
| 3.3.1 单个miRNA的功能关联强度 | 第28-29页 |
| 3.3.2 miRNA对的功能关联强度 | 第29页 |
| 3.4 miRNA之间的功能相似性 | 第29页 |
| 3.5 MFS_GO方法 | 第29-31页 |
| 3.6 实验结果与分析 | 第31-38页 |
| 3.6.1 实验数据 | 第31-32页 |
| 3.6.2 人类miRNA之间家族与集群的功能相似性 | 第32-33页 |
| 3.6.3 人类miRNA之间功能相似性与表达相似性的关系 | 第33-34页 |
| 3.6.4 miRNA-disease关联 | 第34-37页 |
| 3.6.5 案例分析 | 第37-38页 |
| 3.7 小结 | 第38-40页 |
| 第4章 基于网络连通性的人类miRNA之间功能相似性计算方法 | 第40-51页 |
| 4.1 引言 | 第40页 |
| 4.2 重启随机游走(RWR)算法 | 第40-41页 |
| 4.3 MFS_NC方法 | 第41-43页 |
| 4.4 实验结果与分析 | 第43-49页 |
| 4.4.1 实验数据 | 第43-44页 |
| 4.4.2 人类miRNA之间家族与集群的功能相似性 | 第44-45页 |
| 4.4.3 人类miRNA之间功能相似性与表达相似性的关系 | 第45-46页 |
| 4.4.4 miRNA-disease关联 | 第46-48页 |
| 4.4.5 案例分析 | 第48-49页 |
| 4.5 小结 | 第49-51页 |
| 结论 | 第51-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 附录A 攻读学位期间参与的研究项目 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
