基于MicroRNA调控网络的功能模块识别算法研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第12-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第12-14页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第14-17页 |
| 1.2.1 miRNA调控网络构建的研究现状 | 第14-16页 |
| 1.2.2 功能模块识别方法的研究现状 | 第16-17页 |
| 1.3 本文主要研究内容及工作 | 第17-18页 |
| 1.4 论文组织结构 | 第18-20页 |
| 第2章 功能模块识别算法研究概述 | 第20-28页 |
| 2.1 引言 | 第20页 |
| 2.2 不同生物网络中的功能模块识别算法 | 第20-25页 |
| 2.2.1 基于蛋白质互作网络的功能模块识别算法 | 第20-23页 |
| 2.2.2 基于基因调控网络的功能模块识别算法 | 第23-24页 |
| 2.2.3 基于其他网络的功能模块识别算法 | 第24-25页 |
| 2.3 功能模块评价指标 | 第25-26页 |
| 2.4 本章小结 | 第26-28页 |
| 第3章 基于因果关系的功能模块识别算法 | 第28-41页 |
| 3.1 引言 | 第28-29页 |
| 3.2 CALM算法描述 | 第29-34页 |
| 3.2.1 算法框架 | 第29页 |
| 3.2.2 算法步骤 | 第29-34页 |
| 3.3 实验及结果分析 | 第34-39页 |
| 3.3.1 实验数据来源 | 第34页 |
| 3.3.2 实验结果及分析 | 第34-39页 |
| 3.4 本章小结 | 第39-41页 |
| 第4章 基于网络流的功能模块识别算法 | 第41-52页 |
| 4.1 引言 | 第41-42页 |
| 4.2 相关定义 | 第42页 |
| 4.2.1 流网络(flood network) | 第42页 |
| 4.2.2 essential walk | 第42页 |
| 4.3 FLDM算法描述 | 第42-46页 |
| 4.3.1 算法框架图 | 第42-43页 |
| 4.3.2 算法步骤 | 第43-46页 |
| 4.4 实验及结果分析 | 第46-51页 |
| 4.4.1 实验数据来源 | 第46页 |
| 4.4.2 实验结果及分析 | 第46-51页 |
| 4.5 本章小结 | 第51-52页 |
| 结论 | 第52-55页 |
| 参考文献 | 第55-63页 |
| 附录A 攻读学位期间参加的科研项目 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
