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初情期前和初情期山羊松果体全基因组DNA甲基化分析

基金资助第4-5页
致谢第5-6页
摘要第6-7页
Abstract第7-8页
英文略缩词表第11-13页
文献综述第13-24页
引言第24-26页
1.材料与方法第26-34页
    1.1 试验材料第26-27页
        1.1.1 试验动物第26页
        1.1.2 主要试剂和试剂盒第26页
        1.1.3 主要仪器第26-27页
    1.2 试验方法第27-31页
        1.2.1 样品采集和DNA准备第27页
        1.2.2 软件支持第27页
        1.2.3 总RNA的提取与质量检测第27-28页
        1.2.4 RNA逆转录第28页
        1.2.5 荧光定量PCR第28-31页
        1.2.6 Illumina Hiseq 2500 DNA甲基化分析第31页
        1.2.7 GO和KEGG富集分析第31页
    1.3 试验数据处理方法第31-34页
        1.3.1 DNA甲基化测序错误率分布第31页
        1.3.2 原始数据处理方法第31页
        1.3.3 参考序列比对分析第31-32页
        1.3.4 甲基化位点检测第32-33页
        1.3.5 C位点甲基化水平分析第33页
        1.3.6 数据统计分析第33-34页
2.结果第34-43页
    2.1 松果体全基因组甲基化分析第34-36页
    2.2 初情期与初情期前差异甲基化区域(DMRs)第36-40页
    2.3 基因体DNA甲基化和基因表达第40-43页
3.讨论第43-46页
    3.1 DNA甲基化与基因表达关系第43-44页
    3.2 DNA甲基化变化与DMRs第44页
    3.3 CG双核苷酸胞嘧啶上DNA甲基化变化第44-46页
4.结论第46-47页
参考文献第47-52页
附录第52页

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