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卤醇脱卤酶HheC卤离子结合区域氨基酸的功能探究

摘要第5-7页
abstract第7-8页
第一章 绪论第14-22页
    1.1 卤醇脱卤酶简介及研究现状第14页
    1.2 卤醇脱卤酶的晶体结构及催化机制第14-16页
    1.3 卤醇脱卤酶催化反应的动力学特性第16-18页
        1.3.1 稳态动力学第16页
        1.3.2 瞬态动力学第16-17页
        1.3.3 停流荧光和快速淬灭方法第17页
        1.3.4 蛋白质的内源荧光在动力学研究中的应用第17-18页
    1.4 蛋白质的重新设计及其在生物催化中的应用第18-20页
        1.4.1 蛋白质工程在酶底物特异性以及活性提高中的应用第18-19页
        1.4.2 提高或者逆转酶的对映体选择性第19页
        1.4.3 提高酶的稳定性第19页
        1.4.4 有机溶剂的耐受性第19-20页
    1.5 论文的研究内容第20-22页
第二章 HheC卤离子结合区氨基酸的丙氨酸扫描第22-30页
    2.1 实验材料和方法第22-23页
        2.1.1 实验材料第22页
        2.1.2 实验仪器及设备第22-23页
        2.1.3 试剂配制第23页
    2.2 实验方法第23-25页
        2.2.1 丙氨酸突变体的构建第23-24页
        2.2.2 丙氨酸突变体表达的优化第24页
        2.2.3 丙氨酸突变体的催化活性检测第24-25页
        2.2.4 丙氨酸突变体的动力学拆分第25页
    2.3 实验结果和讨论第25-28页
        2.3.1 丙氨酸突变体表达效果的优化第25-26页
        2.3.2 丙氨酸突变体活性检测第26-27页
        2.3.3 丙氨酸突变体对映体选择性的检测第27-28页
    2.4 本章总结第28-30页
第三章 关键位点饱和突变体文库构建、筛选及分析第30-42页
    3.1 实验材料第30页
    3.2 实验方法第30-31页
        3.2.1 突变体文库的构建第30页
        3.2.2 饱和突变体文库的筛选第30-31页
        3.2.3 突变体的催化活性检测第31页
        3.2.4 突变体的动力学拆分第31页
    3.3 实验结果和讨论第31-40页
        3.3.1 关键位点文库构建及筛选第31-32页
        3.3.2 关键位点文库的活性检测结果及分析第32-38页
            3.3.2.1 P175位点的活性检测分析结果第32-33页
            3.3.2.2 N176位点的活性检测分析结果第33页
            3.3.2.3 Y177位点的活性检测分析结果第33-34页
            3.3.2.4 L178位点的活性检测分析结果第34-35页
            3.3.2.5 Y185位点的活性检测分析结果第35页
            3.3.2.6 F186位点的活性检测分析结果第35-36页
            3.3.2.7 Y187位点的活性检测分析结果第36-37页
            3.3.2.8 S180、S183、P188位点的活性检测分析结果第37-38页
        3.3.3 关键位点文库的动力学拆分第38-40页
            3.3.3.1 HheC以及突变体脱卤反应对映体选择性的测定第38-39页
            3.3.3.2 HheC以及突变体开环反应对映体选择性的测定第39-40页
    3.4 本章总结第40-42页
第四章 优势突变体的性质分析第42-52页
    4.1 实验材料第42页
    4.2 实验方法第42-44页
        4.2.1 酶的纯化第42-43页
        4.2.2 PNSHH的活性检测第43页
        4.2.3 稳态动力学常数的测定第43页
        4.2.4 HheC的荧光测量—稳态配体的结合第43-44页
        4.2.5 亲和试剂与酶结合能力的检测第44页
        4.2.6 停流荧光检测第44页
    4.3 实验结果和讨论第44-51页
        4.3.1 PNSHH的活性检测第44-45页
        4.3.2 亲和力的测定第45-46页
        4.3.3 HheC以及突变体的荧光测定第46-47页
        4.3.4 突变体的动力学常数测定第47-49页
        4.3.5 卤离子结合前后的分子动力学模拟第49页
        4.3.6 优势突变体突变体F12Y和L178V停流荧光测定第49-51页
    4.4 本章总结第51-52页
第五章 卤离子结合区域氨基酸的结构基础分析第52-66页
    5.1 实验材料第52页
    5.2 实验方法第52-53页
        5.2.1 凝胶过滤第52页
        5.2.2 凝胶过滤标准曲线的制备第52-53页
    5.3 实验结果和讨论第53-65页
        5.3.1 H179、E181、D182和P184热稳定性分析第53-54页
        5.3.2 S180、S183和P188结构稳定性分析第54-58页
        5.3.3 疏水相互作用的结构分析第58-63页
            5.3.3.1 Y177位点的结构分析第59页
            5.3.3.2 L178位点的结构分析第59-61页
            5.3.3.3 Y185位点的结构分析第61-62页
            5.3.3.4 F186位点的结构分析第62页
            5.3.3.5 Y187位点的结构分析第62-63页
        5.3.4 突变体对映体选择性偏好的结构分析第63-65页
    5.4 本章总结第65-66页
第六章 总结与展望第66-70页
    6.1 全文总结第66-67页
    6.2 后续工作展望第67-70页
        6.2.1 卤醇脱卤酶疏水相互作用的探究第67-69页
        6.2.2 卤醇脱卤酶卤HheC卤离子释放通道的研究第69-70页
致谢第70-71页
参考文献第71-76页
攻读硕士学位期间取得的成果第76页

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