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拟南芥SPO11基因的生物信息学分析

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
1 引言第12-24页
    1.1 拟南芥的研究进展第12-14页
        1.1.1 拟南芥的生物学特性第12页
        1.1.2 拟南芥的分子生物学特性第12-13页
        1.1.3 拟南芥的遗传学特性第13页
        1.1.4 拟南芥的基因组数据库第13-14页
    1.2 减数分裂中同源重组的研究进展第14-17页
        1.2.1 同源重组的机理第14-16页
        1.2.2 DSB的产生及调控机制第16-17页
    1.3 生物信息学分析的研究进展第17-20页
        1.3.1 生物信息学产生的背景第17页
        1.3.2 生物数据库介绍第17-18页
        1.3.3 生物信息学数据分析工具第18-19页
        1.3.4 生物信息学研究的主要内容第19-20页
    1.4 电子克隆的研究进展第20-23页
        1.4.1 EST的概念第20-21页
        1.4.2 电子克隆的原理第21-22页
        1.4.3 电子克隆的应用第22-23页
    1.5 本研究的目的和意义第23-24页
2 拟南芥SPO11基因的生物信息学分析第24-69页
    2.1 材料第24-25页
        2.1.1 生物信息学数据库第24页
        2.1.2 分析工具第24页
        2.1.3 本地生物信息学分析软件第24-25页
        2.1.4 序列来源第25页
    2.2 方法第25-28页
        2.2.1 拟南芥SPO11基因序列的基本分析第25-26页
        2.2.2 拟南芥SPO11基因编码蛋白的结构分析及功能预测第26-27页
        2.2.3 拟南芥SPO11基因的同源性分析第27-28页
    2.3 结果与分析第28-66页
        2.3.1 拟南芥SPO11基因序列的基本分析第28-38页
        2.3.2 拟南芥SPO11基因编码蛋白的理化性质曲线分析第38-47页
        2.3.3 拟南芥SPO11 基因编码蛋白结构和折叠类型预测第47-51页
        2.3.4 拟南芥SPO11 基因编码蛋白的功能预测第51-62页
        2.3.5 SPO11蛋白序列的同源性分析第62-66页
    2.4 小结第66-69页
3 拟南芥SPO11基因在玉米和油菜中的电子克隆第69-77页
    3.1 材料与方法第69-70页
        3.1.1 材料第69页
        3.1.2 第一轮检索第69页
        3.1.3 第一轮组装第69-70页
        3.1.4 第二轮检索与EST装配第70页
    3.2 结果与分析第70-76页
        3.2.1 电子克隆结果与分析第70-76页
    3.3 小结与讨论第76-77页
4 不同物种中SPO11基因的分析第77-84页
    4.1 方法第77页
        4.1.1 基因编码蛋白的功能结构域分析第77页
        4.1.2 蛋白超家族(Superfamily)的分析第77页
        4.1.3 保守位点分析第77页
    4.2 结果与分析第77-82页
        4.2.1 基因编码蛋白的功能结构域分析第77-78页
        4.2.2 蛋白质超家族(Superfamily)的分析第78-81页
        4.2.3 保守位点分析第81-82页
    4.3 小结与讨论第82-84页
5 结论与展望第84-86页
参考文献第86-90页
个人简历第90-91页
致谢第91页

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