| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 引言 | 第11-19页 |
| 1.1 放逸短沟蜷概述 | 第11-13页 |
| 1.1.1 繁殖与发育研究 | 第11页 |
| 1.1.2 寄生虫研究 | 第11-12页 |
| 1.1.3 生态学研究 | 第12页 |
| 1.1.4 系统发育研究 | 第12-13页 |
| 1.2 鄱阳湖流域简介 | 第13-15页 |
| 1.2.1 鄱阳湖流域五河水系 | 第13-14页 |
| 1.2.2 鄱阳湖流域贝类生物多样性 | 第14页 |
| 1.2.3 鄱阳湖流域贝类生物多样性面临的威胁 | 第14-15页 |
| 1.3 软体动物 mtDNA 基因组 | 第15-18页 |
| 1.3.1 线粒体概述 | 第15页 |
| 1.3.2 软体动物 mtDNA 基因组全序列研究概况 | 第15-16页 |
| 1.3.3 软体动物 mtDNA 基因组结构组成 | 第16-17页 |
| 1.3.4 软体动物 mtDNA 基因组特性 | 第17-18页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章 基于线粒体 COI 序列的鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传结构分析 | 第19-37页 |
| 2.1 材料与方法 | 第19-25页 |
| 2.1.1 放逸短沟蜷标本采集 | 第19-22页 |
| 2.1.2 放逸短沟蜷样品形态学鉴定 | 第22页 |
| 2.1.3 实验试剂与仪器 | 第22页 |
| 2.1.4 基因组 DNA 提取 | 第22-23页 |
| 2.1.5 基因组 DNA 浓度测定 | 第23页 |
| 2.1.6 COI 基因片段的 PCR 扩增 | 第23-24页 |
| 2.1.7 PCR 扩增产物的检测及测序 | 第24页 |
| 2.1.8 数据分析 | 第24-25页 |
| 2.2 实验结果 | 第25-35页 |
| 2.2.1 放逸短沟蜷基因组 DNA 浓度 | 第25-26页 |
| 2.2.2 PCR 产物电泳结果 | 第26页 |
| 2.2.3 序列比对结果 | 第26-27页 |
| 2.2.4 COI 序列特征 | 第27页 |
| 2.2.5 遗传多样性分析 | 第27-29页 |
| 2.2.6 遗传距离 | 第29页 |
| 2.2.7 系统发育树 | 第29-31页 |
| 2.2.8 群体间的遗传分化 | 第31-32页 |
| 2.2.9 种群历史动态 | 第32-35页 |
| 2.3 讨论 | 第35-36页 |
| 2.3.1 样本代表性 | 第35页 |
| 2.3.2 鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传多样性 | 第35页 |
| 2.3.3 鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传分化 | 第35-36页 |
| 2.4 小结 | 第36-37页 |
| 第三章 放逸短沟蜷 mtDNA 基因组全序列分析 | 第37-48页 |
| 3.1 材料与方法 | 第37-40页 |
| 3.1.1 放逸短沟蜷样本来源 | 第37页 |
| 3.1.2 实验试剂与仪器 | 第37页 |
| 3.1.3 基因组 DNA 提取 | 第37-38页 |
| 3.1.4 基因组 DNA 的 PCR 扩增及测序 | 第38-40页 |
| 3.1.5 序列拼接和组装 | 第40页 |
| 3.1.6 基因注释和序列分析 | 第40页 |
| 3.2 实验结果 | 第40-45页 |
| 3.2.1 放逸短沟蜷 mtDNA 基因组结构和排列方式 | 第40-43页 |
| 3.2.2 放逸短沟蜷 mtDNA 基因组核苷酸组成 | 第43页 |
| 3.2.3 蛋白质编码基因及密码子使用情况 | 第43-44页 |
| 3.2.4 tRNA 和 rRNA 基因 | 第44-45页 |
| 3.3 讨论 | 第45-46页 |
| 3.3.1 放逸短沟蜷 mtDNA 基因组结构特点及基因排列方式 | 第45页 |
| 3.3.2 蟹守螺超科 mtDNA 基因组扩增存在的问题及解决方法 | 第45-46页 |
| 3.4 小结 | 第46-48页 |
| 第四章 结论与展望 | 第48-51页 |
| 4.1 结论 | 第48-49页 |
| 4.2 展望 | 第49-51页 |
| 致谢 | 第51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 附录 | 第57-59页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第59页 |
