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甘蓝型油菜自交不亲和分子恢复机理研究及应用

摘要第7-10页
Abstract第10-12页
缩略语表第13-14页
1 文献综述第14-31页
    1.1 自交不亲和性概述第14-16页
    1.2 芸薹属自交不亲和的分子机理第16-22页
        1.2.1 自交不亲和识别基因的鉴定第16-18页
        1.2.2 S单倍型及其显隐性关系第18-19页
        1.2.3 芸薹属植物自交不亲和反应机制第19-22页
    1.3 以拟南芥作模式的自交不亲和研究第22-23页
    1.4 十字花科植物中花粉-柱头的互作研究第23-27页
    1.5 甘蓝型油菜中自交(不)亲和性的研究和应用第27-30页
    1.6 研究目的与意义第30-31页
2 材料与方法第31-44页
    2.1 实验材料第31-32页
        2.1.1 植物材料第31页
        2.1.2 载体和菌株第31-32页
    2.2 研究方法第32-42页
        2.2.1 油菜DNA提取第32页
        2.2.2 PCR反应及片段的克隆,测序第32-34页
        2.2.3 油菜各组织总RNA的抽提及检测第34页
        2.2.4 RT-PCR及Real time-PCR第34-35页
        2.2.5 表达载体构建第35-36页
        2.2.6 农杆菌介导的油菜遗传转化第36-38页
        2.2.7 农杆菌介导的拟南芥遗传转化及阳性植株的筛选第38-39页
        2.2.8 GUS分析第39-40页
        2.2.9 花药半薄切片的制作第40-41页
        2.2.10 自交不亲和表型鉴定第41页
        2.2.11 花粉萌发观察第41-42页
        2.2.12 S单倍型与S位点基因的命名第42页
    2.3 数据分析第42页
        2.3.1 遗传分析第42页
        2.3.2 生物信息相关分析第42页
    2.4 转录组测序第42-44页
        2.4.1 cDNA文库构建和Solexa/Illumina测序第42-43页
        2.4.2 RNA-seq数据处理第43页
        2.4.3 DEGs(差异表达基因)的分析与注释第43-44页
3 结果第44-84页
    3.1 自交不亲和系‘S-1300’的遗传特征第44-52页
        3.1.1 自交不亲和系‘S-1300’与恢复系‘10-9-10-9-8400’中S单倍型的组成第44-46页
        3.1.2 自交不亲和系‘S-1300’的遗传分析第46-47页
        3.1.3 BnSP11-1300与BnSRK-1300基因的克隆第47-50页
        3.1.4 BnSP11-1300与BnSRK-1300基因的表达分析第50-52页
    3.2 自交不亲和分子标记体系的建立第52-57页
        3.2.1 分析恢复系‘10-9-8400’中BnSRK-1与BnSP11-1基因的核酸序列第52-53页
        3.2.2 建立自交不亲和分子标记体系第53-54页
        3.2.3 调查父本的基因型及其与F_1表型的关系第54-57页
    3.3 ‘10-9-8400’与‘Westar’自交亲和性的研究第57-71页
        3.3.1 油菜中Helitron类转座子的发现及进化分析第57-60页
        3.3.2 BnSP11-1基因启动子分析第60-66页
        3.3.3 BnSP11-1基因的功能互补第66-71页
    3.4 基于RNA-seq技术的亲和/不亲和分子机理初探第71-84页
        3.4.1 差异表达基因的鉴定第71-73页
        3.4.2 差异表达基因的注释第73-81页
        3.4.3 RNA-seq数据的验证第81-84页
4 讨论第84-97页
    4.1 ‘S-1300’的自交不亲和性第84-85页
    4.2 芸薹属S单倍型互作及显隐性关系第85-86页
    4.3 ‘S-1300’的遗传基础及在SI分子标记体系在育种中的应用第86-88页
    4.4 Helitrons在甘蓝型油菜的进化中起着关键的作用第88-90页
    4.5 BnSP11-1基因启动子的顺式元件第90-91页
    4.6 野生型‘Westar’柱头的授粉特性第91页
    4.7 亲和/不亲和的花粉-柱头互作具有一些共同的信号传导路径第91-93页
    4.8 亲和/不亲和授粉中一些可能的信号传导路径第93-95页
    4.9 总结与展望第95-97页
参考文献第97-113页
致谢第113-114页
附录1第114-122页
附录2第122-126页
附录3第126-127页
附录4第127-131页
附录5第131-132页

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