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痢疾杆菌效应蛋白调节宿主蛋白质泛素化信号途径的结构生物学研究

致谢第5-7页
摘要第7-8页
Abstract第8-9页
目录第10-13页
第1章 绪论第13-24页
    1.1 痢疾杆菌第13-17页
        1.1.1 痢疾杆菌的发现及其致病性第13-14页
        1.1.2 痢疾杆菌的感染过程第14页
        1.1.3 痢疾杆菌的毒性质粒第14-15页
        1.1.4 痢疾杆菌的三型分泌系统第15-16页
        1.1.5 痢疾杆菌效应蛋白第16-17页
    1.2 泛素化系统第17-21页
        1.2.1 什么是蛋白泛素化途径第17-18页
        1.2.2 蛋白泛素化途径的基本成分第18-21页
            1.2.2.1 泛素(Ub)第18-19页
            1.2.2.2 泛素激活酶(E1)第19页
            1.2.2.3 泛素结合酶(E2)第19-21页
            1.2.2.4 泛素连接酶(E3)第21页
    1.3 痢疾杆菌效应蛋白对蛋白泛素化途径的调控第21-24页
        1.3.1 痢疾杆菌效应蛋白OspI第21-22页
        1.3.2 痢疾杆菌效应蛋白IpaH3第22-24页
第2章 材料和方法第24-43页
    2.1 材料第24-26页
        2.1.1 实验材料第24页
        2.1.2 实验试剂第24-25页
        2.1.3 实验仪器第25-26页
    2.2 方法第26-43页
        2.2.1 常用试剂的配置第26页
        2.2.2 分子克隆第26-32页
        2.2.3 目的基因的鉴定第32-34页
        2.2.4 蛋白的表达与纯化第34-38页
        2.2.5 蛋白之间相互作用的检测第38-39页
        2.2.6 E2~Ub的制备第39页
        2.2.7 蛋白结晶第39-41页
        2.2.8 数据的收集和处理第41-43页
第3章 结果和讨论第43-70页
    3.1 效应蛋白OspI和Ubc13复合物的结构生物学研究第43-54页
        3.1.1 OspI C62A突变体的表达纯化第43-45页
            3.1.1.1 OspI C62A的亲和纯化结果第43页
            3.1.1.2 OspI C62A的进一步纯化结果第43-45页
        3.1.2 Ubc13的表达纯化第45-47页
            3.1.2.1 Ubc13的亲和纯化结果第45页
            3.1.2.2 Ubc13的进一步纯化结果第45-47页
        3.1.3 OspI-Ubc13复合物晶体的筛选、优化与衍射第47-50页
            3.1.3.1 OspI-Ubc13复合物晶体的初步筛选及晶体优化第47-48页
            3.1.3.2 OspI-Ubc13复合物晶体的衍射结果第48-50页
        3.1.4 OspI-Ubc13复合物的结构解析第50-54页
            3.1.4.1 OspI-Ubc13复合物的整体结构第50-51页
            3.1.4.2 OspI与Ubc13间的相互作用面第51-52页
            3.1.4.3 OspI的催化机制第52-53页
            3.1.4.4 OspI催化口袋的构象变化第53-54页
    3.2 效应蛋白IpaH3和UbcH5c~Ub复合物的结构生物学研究第54-70页
        3.2.1 IpaH3的表达纯化第54-56页
        3.2.2 UbcH5C~Ub的合成与纯化第56-61页
        3.2.3 IpaH3 CTD与UbcH5c~Ub间的相互作用检测第61-63页
        3.2.4 IpaH3与UbcH5c~Ub的结晶与优化第63-70页
            3.2.4.1 IpaH3 CTD与UbcH5c~Ub复合物晶体的初步筛选第63-65页
            3.2.4.2 非复合物晶体的排除第65-67页
            3.2.4.3 全长IpaH3与UbcH5c-Ub复合物晶体的筛选及优化第67-70页
结论第70-72页
    OspI与Ubc13的复合物的结构生物学研究第70页
    IpaH3与UbcH5c~Ub的复合物的结构生物学研究第70-72页
参考文献第72-77页
个人简历第77页

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