| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略词表 | 第8-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1.1 植物病毒卫星RNA研究进展 | 第12-14页 |
| 1.1.1 卫星RNA分类 | 第12-13页 |
| 1.1.2 卫星RNA分子的生物学特性 | 第13页 |
| 1.1.3 卫星RNA对辅助病毒致病性的影响 | 第13-14页 |
| 1.2 甜菜黑色焦枯病毒及其卫星RNA研究进展 | 第14-18页 |
| 1.2.1 甜菜黑色焦枯病毒研究进展 | 第14-17页 |
| 1.2.2 甜菜黑色焦枯病毒的卫星RNA研究进展 | 第17-18页 |
| 1.3 高通量筛选技术及其在植物病毒研究中的应用 | 第18-24页 |
| 1.3.1 基因芯片技术及其在植物病毒研究中的应用 | 第19-21页 |
| 1.3.2 转录组测序技术及其在植物病毒研究中的应用 | 第21-24页 |
| 1.3.3 实时定量PCR技术及内参基因的选择 | 第24页 |
| 1.4 本论文的研究目的及意义 | 第24-26页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-34页 |
| 2.1 材料 | 第26-27页 |
| 2.1.1 菌种 | 第26页 |
| 2.1.2 植物材料 | 第26页 |
| 2.1.3 侵染性克隆及病毒 | 第26页 |
| 2.1.4 酶和化学试剂 | 第26-27页 |
| 2.1.5 转录组芯片杂交与RNA测序 | 第27页 |
| 2.2 方法 | 第27-34页 |
| 2.2.1 常用试剂及培养基的配置 | 第27-29页 |
| 2.2.2 大肠杆菌感受态制备和转化 | 第29页 |
| 2.2.3 重组质粒的快速鉴定 | 第29页 |
| 2.2.4 质粒DNA的小量提取 | 第29页 |
| 2.2.5 农杆菌浸润法注射接种 | 第29-30页 |
| 2.2.6 RNA病毒侵染性cDNA克隆的酶切线性化及体外转录 | 第30页 |
| 2.2.7 寄主植物的机械接种 | 第30页 |
| 2.2.8 BBSV的病毒提纯 | 第30页 |
| 2.2.9 植物总RNA的提取 | 第30-31页 |
| 2.2.10 Northern blot检测 | 第31页 |
| 2.2.11 RT-PCR检测 | 第31页 |
| 2.2.12 实时荧光定量PCR | 第31-32页 |
| 2.2.13 植物总蛋白的提取及检测 | 第32-34页 |
| 第三章 卫星RNA促进BBSV侵染本生烟的转录谱分析 | 第34-65页 |
| 3.1 卫星RNA对BBSV侵染本生烟的影响 | 第34-35页 |
| 3.2 卫星RNA促进BBSV侵染本生烟的转录谱芯片杂交分析 | 第35-53页 |
| 3.2.1 样品的准备 | 第35-36页 |
| 3.2.2 基因芯片数据的获得 | 第36-37页 |
| 3.2.3 内参基因筛选及芯片数据验证 | 第37-49页 |
| 3.2.4 差异表达基因分析 | 第49-53页 |
| 3.3 卫星RNA促进BBSV侵染本生烟的转录谱测序分析 | 第53-63页 |
| 3.3.1 转录组测序原始数据获得及质控分析 | 第53页 |
| 3.3.2 转录组测序数据基本信息分析 | 第53-55页 |
| 3.3.3 转录组测序数据差异表达基因分析 | 第55-63页 |
| 3.4 本章小结 | 第63-65页 |
| 第四章 结论与展望 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-74页 |
| 附录1 BBSV和TNV-AC侵染拟南芥体系探索 | 第74-84页 |
| 附录2 候选基因及验证基因的引物信息 | 第84-87页 |
| 附录3 引物列表 | 第87-92页 |
| 附录4 各候选内参基因Ct值一览表 | 第92-94页 |
| 附录5 卫星RNA影响BBSV侵染本生烟的差异表达基因 | 第94-103页 |
| 致谢 | 第103-104页 |
| 个人简历 | 第104-105页 |
