| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-36页 |
| 第一节 常用分子标记及其在水生动物遗传育种的应用 | 第19-24页 |
| 1 常用分子标记的种类和特点 | 第19-21页 |
| 2 分子标记在水生动物遗传育种中的应用 | 第21-24页 |
| 第二节 家系鉴定的原理和方法 | 第24-30页 |
| 第三节 有效繁殖群体大小的估算方法和意义 | 第30-36页 |
| 第二章 海湾扇贝分子标记开发与有效繁殖群体研究 | 第36-76页 |
| 第一节 海湾扇贝EST-SSRs 标记的分离及特性 | 第36-43页 |
| 0 引言 | 第36-37页 |
| 1 材料与方法 | 第37-39页 |
| ·海湾扇贝ESTs 中微卫星序列的筛选及引物设计 | 第37页 |
| ·实验材料与DNA 提取 | 第37-38页 |
| ·PCR 扩增条件优化与多态性检测 | 第38-39页 |
| ·种间通用性的检测及家系分析模拟 | 第39页 |
| 2 结果 | 第39-42页 |
| ·海湾扇贝EST-SSRs 筛选结果 | 第39-41页 |
| ·引物种间通用性检测结果 | 第41页 |
| ·EST-SSRs 在海湾扇贝家系鉴定中的模拟 | 第41-42页 |
| 3 讨论 | 第42-43页 |
| ·EST-SSRs 的开发及其应用前景 | 第42-43页 |
| 第二节 海湾扇贝EST-SNPs 标记的分离及特性 | 第43-65页 |
| 0 引言 | 第43-44页 |
| 1 材料与方法 | 第44-53页 |
| ·海湾扇贝ESTs 序列中SNPs 的筛选 | 第44页 |
| ·实验材料与DNA 提取 | 第44页 |
| ·引物设计优化和多态性检测 | 第44-47页 |
| ·数据统计分析 | 第47-52页 |
| ·EST-SNPs 在海湾扇贝家系鉴定中的模拟 | 第52页 |
| ·密码子偏性分析 | 第52-53页 |
| 2 结果 | 第53-61页 |
| ·海湾扇贝ESTs 序列中SNPs 的筛选结果 | 第53-55页 |
| ·SNPs 多态性检测和BLAST 比对 | 第55-58页 |
| ·EST-SNPs 在海湾扇贝家系鉴定中的模拟 | 第58-59页 |
| ·海湾扇贝密码子使用偏性分析 | 第59-61页 |
| 3 讨论 | 第61-65页 |
| ·SNPs 标记的分型方法 | 第61页 |
| ·海湾扇贝ESTs 中SNPs 标记特征分析 | 第61-62页 |
| ·EST-SNPs 在海湾扇贝家系鉴定中的应用前景 | 第62-63页 |
| ·海洋贝类密码子的使用偏好 | 第63-65页 |
| 第三节 海湾扇贝有效繁殖群体研究 | 第65-76页 |
| 0 引言 | 第65-66页 |
| 1 材料与方法 | 第66-68页 |
| ·样品采集 | 第66页 |
| ·DNA 提取和SSRs 分析 | 第66-67页 |
| ·数据分析 | 第67-68页 |
| 2 结果 | 第68-72页 |
| ·家系鉴定成功率 | 第68-70页 |
| ·海湾扇贝交配系统和个体的繁殖成功 | 第70-72页 |
| ·有效繁殖群体的估算 | 第72页 |
| ·个体亲缘关系对繁殖成功的影响 | 第72页 |
| 3 讨论 | 第72-76页 |
| ·EST-SSRs 在海湾扇贝家系鉴定中的应用 | 第72-73页 |
| ·雌雄同体贝类交配系统的研究 | 第73页 |
| ·有效群体大小和个体繁殖成功 | 第73-74页 |
| ·个体亲缘关系对繁殖成功的影响 | 第74-76页 |
| 第三章 太平洋牡蛎多重 PCRs 开发与有效繁殖群体研究 | 第76-99页 |
| 第一节 太平洋牡蛎EST-SSRs 多重PCRs 的开发 | 第76-86页 |
| 0 引言 | 第76-77页 |
| 1 材料与方法 | 第77-78页 |
| ·样品采集和DNA 提取 | 第77页 |
| ·太平洋牡蛎EST-SSRs 的筛选 | 第77页 |
| ·PCR 扩增及反应条件优化 | 第77-78页 |
| ·数据统计分析 | 第78页 |
| 2 结果 | 第78-84页 |
| ·多重PCR 标记的优化组合 | 第78-79页 |
| ·EST-SSRs 多重PCRs 在家系鉴定中的应用 | 第79-81页 |
| ·EST-SSRs 的遗传分离模式 | 第81-84页 |
| 3 讨论 | 第84-86页 |
| ·EST-SSRs 多重PCRs 在家系鉴定中的应用 | 第84-85页 |
| ·EST-SSRs 的无效等位基因 | 第85-86页 |
| 第二节 太平洋牡蛎有效繁殖群体研究 | 第86-99页 |
| 0 引言 | 第86-87页 |
| 1 材料与方法 | 第87-89页 |
| ·样品采集 | 第87页 |
| ·DNA 提取和SSRs 分析 | 第87页 |
| ·数据分析 | 第87-89页 |
| 2 结果 | 第89-95页 |
| ·家系鉴定成功率 | 第89-91页 |
| ·亲本和子代遗传多样性的比较 | 第91-92页 |
| ·亲本个体的繁殖成功比较 | 第92-95页 |
| ·近交率和有效繁殖群体的估算 | 第95页 |
| 3 讨论 | 第95-99页 |
| ·家系分析在水产动物遗传育种中的应用 | 第95-96页 |
| ·有效群体大小和个体繁殖成功对子代群体的影响 | 第96-97页 |
| ·实际生产中降低近交的方法 | 第97-99页 |
| 第四章 虾夷扇贝和魁蚶的有效繁殖群体研究 | 第99-115页 |
| 第一节 虾夷扇贝有效繁殖群体研究 | 第99-107页 |
| 0 引言 | 第99-100页 |
| 1 材料与方法 | 第100-101页 |
| ·样品采集 | 第100页 |
| ·DNA 提取和SSRs 分析 | 第100页 |
| ·数据分析 | 第100-101页 |
| 2 结果 | 第101-105页 |
| ·家系鉴定成功率 | 第101-103页 |
| ·亲本个体繁殖成功的比较和相关因素的分析 | 第103-105页 |
| ·有效繁殖群体和近交率的估算 | 第105页 |
| 3 讨论 | 第105-107页 |
| ·个体繁殖成功与形态统计量的相关性比较 | 第105-106页 |
| ·常规苗种繁育方法对群体遗传多样性的影响 | 第106-107页 |
| 第二节 魁蚶有效繁殖群体研究 | 第107-115页 |
| 0 引言 | 第107-108页 |
| 1 材料与方法 | 第108-109页 |
| ·样品采集 | 第108页 |
| ·DNA 提取和SSRs 分析 | 第108页 |
| ·数据分析 | 第108-109页 |
| 2 结果 | 第109-113页 |
| ·个体亲缘关系的划分 | 第109页 |
| ·子代不同生长阶段遗传多样性的比较 | 第109-110页 |
| ·亲本繁殖成功和有效繁殖群体的估算 | 第110-113页 |
| 3 讨论 | 第113-115页 |
| 参考文献 | 第115-134页 |
| 致谢 | 第134-135页 |
| 学术成果 | 第135页 |
