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扁蚜亚科线粒体基因组学研究(半翅目:蚜科)

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略词第10-11页
第1章 引言第11-23页
    1.1 扁蚜亚科简介第11-12页
    1.2 蚜虫线粒体基因组的特点及其研究现状第12-16页
        1.2.1 蚜虫线粒体基因组大小及组成第14-15页
        1.2.2 蚜虫线粒体基因组的蛋白质编码基因第15页
        1.2.3 蚜虫线粒体基因组的RNA第15-16页
        1.2.4 蚜虫线粒体基因组的非编码区第16页
    1.3 扁蚜亚科系统发育关系的研究进展第16-18页
    1.4 本研究的主要内容和意义第18-19页
        1.4.1 主要内容第18页
        1.4.2 研究意义第18-19页
    附表第19-23页
第2章 研究材料与方法第23-35页
    2.1 标本的采集、保存与鉴定第23页
    2.2 主要实验仪器第23-25页
    2.3 主要实验试剂第25-26页
    2.4 实验方法第26-32页
        2.4.1 总DNA提取第26-27页
        2.4.2 线粒体全基因组PCR的扩增第27-30页
        2.4.3 目的片段的克隆第30-32页
    2.5 序列测定第32页
    2.6 数据处理第32-33页
    2.7 系统发育分析方法第33-35页
第3章 蚜虫线粒体基因组的注释与分析第35-65页
    3.1 桦扁蚜Hormaphis betulae(Mordvilko)线粒体基因组分析第36-43页
        3.1.1 线粒体基因组的基本特征第36-38页
        3.1.2 核苷酸组成与密码子使用第38-41页
        3.1.3 蛋白质编码基因第41-42页
        3.1.4 RNA基因第42-43页
        3.1.5 非编码区第43页
    3.2 瘿裂扁蚜Schizoneuraphis gallarum(van der Goot)线粒体基因组分析第43-50页
        3.2.1 线粒体基因组的基本特征第44-46页
        3.2.2 核苷酸组成与密码子使用第46-48页
        3.2.3 蛋白质编码基因第48-49页
        3.2.4 RNA基因第49页
        3.2.5 非编码区第49-50页
    3.3 巴西坚蚜Cerataphis brasiliensis(Hempel)线粒体基因组分析第50-58页
        3.3.1 线粒体基因组的基本特征第51-53页
        3.3.2 核苷酸组成与密码子使用第53-56页
        3.3.3 蛋白质编码基因第56页
        3.3.4 RNA基因第56-57页
        3.3.5 非编码区第57-58页
    3.4 肿胀网扁蚜Reticulaphis inflata(Yeh & Hsu)线粒体基因组分析第58-59页
    3.5 寡毛真胸蚜Euthoracaphis oligostricha(Chen,Fang & Qiao)线粒体基因组分析第59页
    3.6 米甘草粉虱蚜Aleurodaphis mikaniae(Takahashi)线粒体基因组分析第59-60页
    3.7 竹舞蚜Astegopteryx bambusae(Buckton)线粒体基因组分析第60-61页
    3.8 甘蔗粉角蚜Ceratovacuna lanigera(Zehntner)线粒体基因组分析第61-62页
    3.9 竹密角蚜Glyphinaphis bambusae(van der Goot)线粒体基因组分析第62-63页
    3.10 拟桦五节扁蚜Hamamelistes similibetulae(Qiao & Zhang)线粒体基因组分析第63页
    3.11 小结第63-65页
第4章 线粒体比较基因组学研究第65-79页
    4.1 扁蚜亚科线粒体基因组的蛋白质编码基因第65-68页
        4.1.1 蛋白编码基因的长度第65-66页
        4.1.2 蛋白编码基因的起始密码子和终止密码子第66-67页
        4.1.3 氨基酸使用频率与序列变异度第67-68页
    4.2 扁蚜亚科线粒体基因组的RNA第68-72页
    4.3 扁蚜亚科线粒体基因组的控制区第72页
    4.4 扁蚜亚科线粒体基因组中的AT含量第72-73页
    4.5 扁蚜亚科线粒体基因组中各蛋白质编码基因的进化速率第73-74页
    4.6 扁蚜亚科线粒体基因组的基因重叠与间隔第74-76页
    4.7 讨论第76页
        4.7.1 巴西坚蚜中基因缺失事件第76页
        4.7.2 巴西坚蚜中基因“nad3”存在与否第76页
    4.8 小结第76-79页
        4.8.1 扁蚜亚科与已报道的蚜虫线粒体基因组的比较第76-77页
        4.8.2 扁蚜亚科3个族的蚜虫线粒体基因组第77-79页
第5章 系统发育关系的分析第79-85页
    5.1 数据集概述第79-80页
    5.2 结果第80-83页
    5.3 讨论第83-84页
        5.3.1 扁蚜亚科单系性第83页
        5.3.2 各族的单系性第83-84页
    5.4 小结第84-85页
结论第85-87页
参考文献第87-95页
致谢第95-99页
攻读学位论文期间研究成果第99页

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