摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
缩略词 | 第10-11页 |
第1章 引言 | 第11-23页 |
1.1 扁蚜亚科简介 | 第11-12页 |
1.2 蚜虫线粒体基因组的特点及其研究现状 | 第12-16页 |
1.2.1 蚜虫线粒体基因组大小及组成 | 第14-15页 |
1.2.2 蚜虫线粒体基因组的蛋白质编码基因 | 第15页 |
1.2.3 蚜虫线粒体基因组的RNA | 第15-16页 |
1.2.4 蚜虫线粒体基因组的非编码区 | 第16页 |
1.3 扁蚜亚科系统发育关系的研究进展 | 第16-18页 |
1.4 本研究的主要内容和意义 | 第18-19页 |
1.4.1 主要内容 | 第18页 |
1.4.2 研究意义 | 第18-19页 |
附表 | 第19-23页 |
第2章 研究材料与方法 | 第23-35页 |
2.1 标本的采集、保存与鉴定 | 第23页 |
2.2 主要实验仪器 | 第23-25页 |
2.3 主要实验试剂 | 第25-26页 |
2.4 实验方法 | 第26-32页 |
2.4.1 总DNA提取 | 第26-27页 |
2.4.2 线粒体全基因组PCR的扩增 | 第27-30页 |
2.4.3 目的片段的克隆 | 第30-32页 |
2.5 序列测定 | 第32页 |
2.6 数据处理 | 第32-33页 |
2.7 系统发育分析方法 | 第33-35页 |
第3章 蚜虫线粒体基因组的注释与分析 | 第35-65页 |
3.1 桦扁蚜Hormaphis betulae(Mordvilko)线粒体基因组分析 | 第36-43页 |
3.1.1 线粒体基因组的基本特征 | 第36-38页 |
3.1.2 核苷酸组成与密码子使用 | 第38-41页 |
3.1.3 蛋白质编码基因 | 第41-42页 |
3.1.4 RNA基因 | 第42-43页 |
3.1.5 非编码区 | 第43页 |
3.2 瘿裂扁蚜Schizoneuraphis gallarum(van der Goot)线粒体基因组分析 | 第43-50页 |
3.2.1 线粒体基因组的基本特征 | 第44-46页 |
3.2.2 核苷酸组成与密码子使用 | 第46-48页 |
3.2.3 蛋白质编码基因 | 第48-49页 |
3.2.4 RNA基因 | 第49页 |
3.2.5 非编码区 | 第49-50页 |
3.3 巴西坚蚜Cerataphis brasiliensis(Hempel)线粒体基因组分析 | 第50-58页 |
3.3.1 线粒体基因组的基本特征 | 第51-53页 |
3.3.2 核苷酸组成与密码子使用 | 第53-56页 |
3.3.3 蛋白质编码基因 | 第56页 |
3.3.4 RNA基因 | 第56-57页 |
3.3.5 非编码区 | 第57-58页 |
3.4 肿胀网扁蚜Reticulaphis inflata(Yeh & Hsu)线粒体基因组分析 | 第58-59页 |
3.5 寡毛真胸蚜Euthoracaphis oligostricha(Chen,Fang & Qiao)线粒体基因组分析 | 第59页 |
3.6 米甘草粉虱蚜Aleurodaphis mikaniae(Takahashi)线粒体基因组分析 | 第59-60页 |
3.7 竹舞蚜Astegopteryx bambusae(Buckton)线粒体基因组分析 | 第60-61页 |
3.8 甘蔗粉角蚜Ceratovacuna lanigera(Zehntner)线粒体基因组分析 | 第61-62页 |
3.9 竹密角蚜Glyphinaphis bambusae(van der Goot)线粒体基因组分析 | 第62-63页 |
3.10 拟桦五节扁蚜Hamamelistes similibetulae(Qiao & Zhang)线粒体基因组分析 | 第63页 |
3.11 小结 | 第63-65页 |
第4章 线粒体比较基因组学研究 | 第65-79页 |
4.1 扁蚜亚科线粒体基因组的蛋白质编码基因 | 第65-68页 |
4.1.1 蛋白编码基因的长度 | 第65-66页 |
4.1.2 蛋白编码基因的起始密码子和终止密码子 | 第66-67页 |
4.1.3 氨基酸使用频率与序列变异度 | 第67-68页 |
4.2 扁蚜亚科线粒体基因组的RNA | 第68-72页 |
4.3 扁蚜亚科线粒体基因组的控制区 | 第72页 |
4.4 扁蚜亚科线粒体基因组中的AT含量 | 第72-73页 |
4.5 扁蚜亚科线粒体基因组中各蛋白质编码基因的进化速率 | 第73-74页 |
4.6 扁蚜亚科线粒体基因组的基因重叠与间隔 | 第74-76页 |
4.7 讨论 | 第76页 |
4.7.1 巴西坚蚜中基因缺失事件 | 第76页 |
4.7.2 巴西坚蚜中基因“nad3”存在与否 | 第76页 |
4.8 小结 | 第76-79页 |
4.8.1 扁蚜亚科与已报道的蚜虫线粒体基因组的比较 | 第76-77页 |
4.8.2 扁蚜亚科3个族的蚜虫线粒体基因组 | 第77-79页 |
第5章 系统发育关系的分析 | 第79-85页 |
5.1 数据集概述 | 第79-80页 |
5.2 结果 | 第80-83页 |
5.3 讨论 | 第83-84页 |
5.3.1 扁蚜亚科单系性 | 第83页 |
5.3.2 各族的单系性 | 第83-84页 |
5.4 小结 | 第84-85页 |
结论 | 第85-87页 |
参考文献 | 第87-95页 |
致谢 | 第95-99页 |
攻读学位论文期间研究成果 | 第99页 |