摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
缩略词表 | 第9-11页 |
第1章 绪论 | 第11-21页 |
1.1 microRNA的研究 | 第11-16页 |
1.1.1 microRNA的发现 | 第11页 |
1.1.2 miRNA的产生和调节 | 第11-12页 |
1.1.3 miRNA数据库 | 第12-13页 |
1.1.4 miRNA的特征与进化 | 第13-14页 |
1.1.5 miRNA的研究方法 | 第14-16页 |
1.2 转录组概述 | 第16-19页 |
1.2.1 转录组 | 第16-17页 |
1.2.2 转录组学 | 第17页 |
1.2.3 转录组的研究方法 | 第17-19页 |
1.3 研究目的和意义 | 第19-21页 |
第2章 材料和方法 | 第21-29页 |
2.1 实验材料 | 第21-23页 |
2.1.1 实验标本 | 第21页 |
2.1.2 实验仪器与试剂 | 第21-23页 |
2.2 黄胫小车蝗的雄性、雌性成虫和若虫三个样本总RNA的提取 | 第23-29页 |
2.2.1 实验前准备 | 第23-25页 |
2.2.2 超微量核酸分析仪检测 | 第25-26页 |
2.2.3 Agilent 2100 Bioanalyzer检测 | 第26页 |
2.2.4 sRNA测序文库的构建 | 第26-27页 |
2.2.5 生物信息学分析 | 第27-29页 |
第3章 实验结果 | 第29-47页 |
3.1 总RNA样品质量检测 | 第29-31页 |
3.1.1 琼脂糖凝胶电泳检测结果 | 第29页 |
3.1.2 超微量核酸分析仪检测结果 | 第29-30页 |
3.1.3 Agilent 2100 Bioanalyzer检测结果 | 第30-31页 |
3.2 黄胫小车蝗miRNA的生物信息学分析 | 第31-45页 |
3.2.1 数据统计 | 第31-32页 |
3.2.2 序列长度分布 | 第32-33页 |
3.2.3 参考基因比对和分类注释 | 第33-35页 |
3.2.4 与已知miRNA比对 | 第35页 |
3.2.5 新miRNA的预测 | 第35-37页 |
3.2.6 保守miRNA的差异表达分析 | 第37-39页 |
3.2.7 已知miRNA的靶基因位点的预测 | 第39页 |
3.2.8 差异表达的新MiRNA的GO富集分析 | 第39-43页 |
3.2.9 差异表达的已知miRNA的KEGG代谢通路分析 | 第43-45页 |
3.3 讨论 | 第45-47页 |
第4章 黄胫小车蝗的转录组分析 | 第47-61页 |
4.1 实验方法 | 第47-52页 |
4.1.1 cDNA文库的构建 | 第47-48页 |
4.1.2 cDNA文库的数据处理 | 第48-49页 |
4.1.3 生物信息学分析过程 | 第49-52页 |
4.2 结果和分析 | 第52-59页 |
4.2.1 原始测序数据统计 | 第52页 |
4.2.2 测序数据的组装 | 第52-54页 |
4.2.3 Unigene的功能注释 | 第54页 |
4.2.4 Unigene的COG分类 | 第54-55页 |
4.2.5 Unigene的Nr注释 | 第55-56页 |
4.2.6 GO功能分类 | 第56-58页 |
4.2.7 表达基因的KEGG代谢通路分析 | 第58-59页 |
4.3 讨论 | 第59-61页 |
总结 | 第61-63页 |
参考文献 | 第63-71页 |
致谢 | 第71-73页 |
攻读硕士学位期间研究成果 | 第73页 |