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黄胫小车蝗成虫和若虫的miRNA与转录组的研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略词表第9-11页
第1章 绪论第11-21页
    1.1 microRNA的研究第11-16页
        1.1.1 microRNA的发现第11页
        1.1.2 miRNA的产生和调节第11-12页
        1.1.3 miRNA数据库第12-13页
        1.1.4 miRNA的特征与进化第13-14页
        1.1.5 miRNA的研究方法第14-16页
    1.2 转录组概述第16-19页
        1.2.1 转录组第16-17页
        1.2.2 转录组学第17页
        1.2.3 转录组的研究方法第17-19页
    1.3 研究目的和意义第19-21页
第2章 材料和方法第21-29页
    2.1 实验材料第21-23页
        2.1.1 实验标本第21页
        2.1.2 实验仪器与试剂第21-23页
    2.2 黄胫小车蝗的雄性、雌性成虫和若虫三个样本总RNA的提取第23-29页
        2.2.1 实验前准备第23-25页
        2.2.2 超微量核酸分析仪检测第25-26页
        2.2.3 Agilent 2100 Bioanalyzer检测第26页
        2.2.4 sRNA测序文库的构建第26-27页
        2.2.5 生物信息学分析第27-29页
第3章 实验结果第29-47页
    3.1 总RNA样品质量检测第29-31页
        3.1.1 琼脂糖凝胶电泳检测结果第29页
        3.1.2 超微量核酸分析仪检测结果第29-30页
        3.1.3 Agilent 2100 Bioanalyzer检测结果第30-31页
    3.2 黄胫小车蝗miRNA的生物信息学分析第31-45页
        3.2.1 数据统计第31-32页
        3.2.2 序列长度分布第32-33页
        3.2.3 参考基因比对和分类注释第33-35页
        3.2.4 与已知miRNA比对第35页
        3.2.5 新miRNA的预测第35-37页
        3.2.6 保守miRNA的差异表达分析第37-39页
        3.2.7 已知miRNA的靶基因位点的预测第39页
        3.2.8 差异表达的新MiRNA的GO富集分析第39-43页
        3.2.9 差异表达的已知miRNA的KEGG代谢通路分析第43-45页
    3.3 讨论第45-47页
第4章 黄胫小车蝗的转录组分析第47-61页
    4.1 实验方法第47-52页
        4.1.1 cDNA文库的构建第47-48页
        4.1.2 cDNA文库的数据处理第48-49页
        4.1.3 生物信息学分析过程第49-52页
    4.2 结果和分析第52-59页
        4.2.1 原始测序数据统计第52页
        4.2.2 测序数据的组装第52-54页
        4.2.3 Unigene的功能注释第54页
        4.2.4 Unigene的COG分类第54-55页
        4.2.5 Unigene的Nr注释第55-56页
        4.2.6 GO功能分类第56-58页
        4.2.7 表达基因的KEGG代谢通路分析第58-59页
    4.3 讨论第59-61页
总结第61-63页
参考文献第63-71页
致谢第71-73页
攻读硕士学位期间研究成果第73页

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