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一种高原鳅及其寄生三代虫全线粒体基因组的研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 前言第9-17页
    1.1 三代虫以及三代虫科概况第9-10页
        1.1.1 三代虫研究现状第9页
        1.1.2 三代虫科研究现状第9-10页
    1.2 线粒体基因组及其研究现状第10-13页
        1.2.1 线粒体基因组第10-11页
        1.2.2 蛋白质编码基因第11-12页
        1.2.3 转运RNA第12页
        1.2.4 核糖体RNA第12-13页
    1.3 DNA条形码第13-15页
    1.4 本研究的目的及意义第15-17页
第2章 材料与方法第17-27页
    2.1 实验材料第17-18页
        2.1.1 实验标本的采集与保存第17页
        2.1.2 实验标本的鉴定第17页
        2.1.3 实验主要仪器和试剂第17-18页
    2.2 实验方法第18-24页
        2.2.1 总DNA提取和检测第18-19页
        2.2.2 PCR引物设计、扩增和测序第19-24页
        2.2.3 数据处理及分析第24页
    2.3 系统发育分析第24-27页
        2.3.1 数据来源及处理第25页
        2.3.2 系统发育信号检验、模型选择以及建树方法第25-27页
第3章 高原鳅及其寄生三代虫的分子鉴定第27-33页
    3.1 高原鳅的COI基因测序结果以及分子鉴定第27页
    3.2 三代虫ITS片段的测序结果以及分子鉴定第27-33页
第4章 4种新测定种全线粒体基因组组成分析第33-53页
    4.1 高原鳅Triplophysa sp.的线粒体基因组第33-39页
        4.1.1 基因组结构及其碱基组成特征第33-35页
        4.1.2 蛋白编码基因的密码子使用情况和氨基酸组成统计第35-37页
        4.1.3 tRNA基因及其二级结构预测和rRNA基因第37页
        4.1.4 控制区第37-39页
    4.2 三代虫线粒体基因组比较第39-53页
        4.2.1 三代虫线粒体基因组的共同特征第39-41页
        4.2.2 碱基组成特征第41-44页
        4.2.3 蛋白质编码基因和密码子的使用第44-48页
        4.2.4 tRNA基因和rRNA基因第48-50页
        4.2.5 主非编码区第50-51页
        4.2.6 遗传距离第51-53页
第5章 系统发育关系的探讨第53-59页
    5.1 基于线粒体全基因组对Triplophysa sp.系统地位的探讨第53-54页
        5.1.1 数据来源第53页
        5.1.2 Triplophysa sp.系统地位分析第53-54页
    5.2 基于18S rRNA基因构建三代虫科的系统发生关系第54-59页
        5.2.1 数据来源第54-55页
        5.2.2 系统发育分析第55-59页
第6章 讨论第59-61页
参考文献第61-71页
致谢第71-73页
攻读硕士学位期间的研究成果第73页

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