摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第1章 前言 | 第9-17页 |
1.1 三代虫以及三代虫科概况 | 第9-10页 |
1.1.1 三代虫研究现状 | 第9页 |
1.1.2 三代虫科研究现状 | 第9-10页 |
1.2 线粒体基因组及其研究现状 | 第10-13页 |
1.2.1 线粒体基因组 | 第10-11页 |
1.2.2 蛋白质编码基因 | 第11-12页 |
1.2.3 转运RNA | 第12页 |
1.2.4 核糖体RNA | 第12-13页 |
1.3 DNA条形码 | 第13-15页 |
1.4 本研究的目的及意义 | 第15-17页 |
第2章 材料与方法 | 第17-27页 |
2.1 实验材料 | 第17-18页 |
2.1.1 实验标本的采集与保存 | 第17页 |
2.1.2 实验标本的鉴定 | 第17页 |
2.1.3 实验主要仪器和试剂 | 第17-18页 |
2.2 实验方法 | 第18-24页 |
2.2.1 总DNA提取和检测 | 第18-19页 |
2.2.2 PCR引物设计、扩增和测序 | 第19-24页 |
2.2.3 数据处理及分析 | 第24页 |
2.3 系统发育分析 | 第24-27页 |
2.3.1 数据来源及处理 | 第25页 |
2.3.2 系统发育信号检验、模型选择以及建树方法 | 第25-27页 |
第3章 高原鳅及其寄生三代虫的分子鉴定 | 第27-33页 |
3.1 高原鳅的COI基因测序结果以及分子鉴定 | 第27页 |
3.2 三代虫ITS片段的测序结果以及分子鉴定 | 第27-33页 |
第4章 4种新测定种全线粒体基因组组成分析 | 第33-53页 |
4.1 高原鳅Triplophysa sp.的线粒体基因组 | 第33-39页 |
4.1.1 基因组结构及其碱基组成特征 | 第33-35页 |
4.1.2 蛋白编码基因的密码子使用情况和氨基酸组成统计 | 第35-37页 |
4.1.3 tRNA基因及其二级结构预测和rRNA基因 | 第37页 |
4.1.4 控制区 | 第37-39页 |
4.2 三代虫线粒体基因组比较 | 第39-53页 |
4.2.1 三代虫线粒体基因组的共同特征 | 第39-41页 |
4.2.2 碱基组成特征 | 第41-44页 |
4.2.3 蛋白质编码基因和密码子的使用 | 第44-48页 |
4.2.4 tRNA基因和rRNA基因 | 第48-50页 |
4.2.5 主非编码区 | 第50-51页 |
4.2.6 遗传距离 | 第51-53页 |
第5章 系统发育关系的探讨 | 第53-59页 |
5.1 基于线粒体全基因组对Triplophysa sp.系统地位的探讨 | 第53-54页 |
5.1.1 数据来源 | 第53页 |
5.1.2 Triplophysa sp.系统地位分析 | 第53-54页 |
5.2 基于18S rRNA基因构建三代虫科的系统发生关系 | 第54-59页 |
5.2.1 数据来源 | 第54-55页 |
5.2.2 系统发育分析 | 第55-59页 |
第6章 讨论 | 第59-61页 |
参考文献 | 第61-71页 |
致谢 | 第71-73页 |
攻读硕士学位期间的研究成果 | 第73页 |