| 第一部分 基于新一代测序技术的三种髓系血液细胞系转录组研究 | 第1-82页 |
| 摘要 | 第9-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 引言 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-32页 |
| ·血液分化简述 | 第12-19页 |
| ·造血干细胞 | 第12页 |
| ·分化过程 | 第12-13页 |
| ·分化调控 | 第13-16页 |
| ·血液细胞特性及功能 | 第16-19页 |
| ·白血病发生 | 第19-23页 |
| ·急性髓系白血病 | 第19-21页 |
| ·慢性髓系白血病 | 第21-23页 |
| ·白血病的转录组学研究 | 第23-26页 |
| ·RNA-Seq技术 | 第26-30页 |
| ·几种转录组学研究技术之间的比较 | 第30-32页 |
| 第二章 材料与方法 | 第32-40页 |
| ·实验材料 | 第32页 |
| ·实验试剂与耗材 | 第32-33页 |
| ·主要试剂 | 第32页 |
| ·常用溶液和培养基 | 第32-33页 |
| ·试剂盒 | 第33页 |
| ·实验方法 | 第33-38页 |
| ·Ribo-minus文库构建 | 第33-37页 |
| ·总RNA提取 | 第33-34页 |
| ·核糖体RNA的去除 | 第34-35页 |
| ·SOLID试剂盒构建文库 | 第35-37页 |
| ·库检 | 第37页 |
| ·上机测序 | 第37-38页 |
| ·数据分析方法 | 第38-40页 |
| ·数据注释 | 第38-39页 |
| ·基因表达谱分析 | 第39页 |
| ·差异表达分析及功能分类 | 第39-40页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第40-79页 |
| ·转录组文库构建 | 第40-41页 |
| ·数据产生与注释 | 第41-45页 |
| ·基因表达谱分析 | 第45-50页 |
| ·基因表达数量与种类 | 第45-46页 |
| ·mRNA的表达谱分析 | 第46-47页 |
| ·不同表达丰度的基因功能分析 | 第47-50页 |
| ·差异表达分析 | 第50-73页 |
| ·K562上调于其它两个样本的基因表达分析 | 第50-56页 |
| ·HL-60上调于其它两个样本的基因表达分析 | 第56-60页 |
| ·THP1上调于其它两个样本的基因表达分析 | 第60-65页 |
| ·白血病差异分析 | 第65-73页 |
| ·慢性髓系白血病特征分析 | 第65-68页 |
| ·急性髓系白血病特征分析 | 第68-70页 |
| ·原癌基因表达情况分析 | 第70-73页 |
| ·血液细胞分化过程中的基因表达变化 | 第73-79页 |
| 第四章 总结 | 第79-82页 |
| 第二部分 杂色鲍微卫星富集文库构建及多态性验证 | 第82-118页 |
| 摘要 | 第83-84页 |
| Abstract | 第84-85页 |
| 引言 | 第85-86页 |
| 第一章 文献综述 | 第86-97页 |
| ·分子标记概述 | 第86-89页 |
| ·基于DNA分子杂交技术的分子标记 | 第86-87页 |
| ·基于PCR技术的分子标记 | 第87-88页 |
| ·基于限制酶和PCR相结合的分子标记 | 第88-89页 |
| ·基于单个核苷酸多态性的分子标记 | 第89页 |
| ·微卫星标记研究进展 | 第89-97页 |
| ·微卫星的发展简史 | 第89-90页 |
| ·微卫星标记的应用 | 第90-92页 |
| ·微卫星标记的分离方法 | 第92-94页 |
| ·微卫星搜寻程序和分析软件 | 第94-97页 |
| 第二章 材料与方法 | 第97-111页 |
| ·实验材料 | 第97页 |
| ·试剂与仪器设备 | 第97-100页 |
| ·主要试剂及耗材 | 第97页 |
| ·主要仪器与设备 | 第97-99页 |
| ·主要试剂的配制 | 第99-100页 |
| ·实验方法 | 第100-111页 |
| ·提取基因组DNA | 第100-101页 |
| ·超声打碎基因组DNA | 第101页 |
| ·DNA末端补平 | 第101页 |
| ·沉淀浓缩DNA | 第101-102页 |
| ·凝胶配制与胶回收 | 第102-103页 |
| ·连接接头 | 第103页 |
| ·杂交 | 第103-104页 |
| ·富集 | 第104-105页 |
| ·PCR扩增 | 第105页 |
| ·插入片段与载体的连接 | 第105页 |
| ·Millipore膜纯化 | 第105页 |
| ·电转化与涂板 | 第105-106页 |
| ·挑克隆培养与质粒提取 | 第106页 |
| ·测序 | 第106-107页 |
| ·拼接与设计引物 | 第107页 |
| ·初步多态性验证 | 第107-109页 |
| ·荧光标记多态性好的引物并上机扫描 | 第109-110页 |
| ·数据处理 | 第110-111页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第111-117页 |
| ·基因组超声结果 | 第111-112页 |
| ·超声片段回收纯化结果 | 第112-113页 |
| ·文库质量 | 第113-114页 |
| ·杂色鲍微卫星多态性分析 | 第114-117页 |
| 第四章 总结 | 第117-118页 |
| 参考文献 | 第118-129页 |
| 附录 | 第129-134页 |
| 发表文章 | 第134-135页 |
| 致谢 | 第135-136页 |