| 中文摘要 | 第1-16页 |
| Abstract | 第16-20页 |
| 资源家系测定性状的英文缩写 | 第20-21页 |
| 第一章 文献综述 | 第21-41页 |
| 1 引言 | 第21-22页 |
| 2 动物育种方法的进展 | 第22-32页 |
| ·表型选择育种 | 第22-23页 |
| ·估计育种值方法育种 | 第23-25页 |
| ·遗传参数估计的方法 | 第23-24页 |
| ·育种值估计的方法 | 第24-25页 |
| ·分子育种 | 第25-32页 |
| ·标记辅助选择 | 第25-28页 |
| ·标记辅助渗入 | 第28-29页 |
| ·转基因育种 | 第29-32页 |
| 3 猪肉质性状相关基因的研究进展 | 第32-34页 |
| 4 候选基因Six1的研究进展 | 第34-37页 |
| ·Six1基因家族的结构特征与生物学特性 | 第34-35页 |
| ·Six1基因的生物学功能 | 第35-37页 |
| ·Six1基因在肌肉发育方面的研究 | 第35-36页 |
| ·Six1基因在疾病方面的研究 | 第36-37页 |
| ·Six1基因在其它组织器官发育方面的研究 | 第37页 |
| 5 候选基因Pitx2c的研究进展 | 第37-39页 |
| ·Pitx2c基因家族的结构特征与生物学特性 | 第37-38页 |
| ·Pitx2c基因的生物学功能 | 第38-39页 |
| 6 研究的目的与意义 | 第39-41页 |
| 第二章 猪Six1基因的分离鉴定、表达模式及功能分析 | 第41-165页 |
| 1 引言 | 第41-42页 |
| 2 材料与方法 | 第42-90页 |
| ·材料 | 第42-50页 |
| ·试验材料 | 第42-43页 |
| ·主要仪器设备 | 第43-45页 |
| ·主要试剂与试剂盒 | 第45-49页 |
| ·分子生物学软件与生物信息学网站 | 第49-50页 |
| ·猪Six1基因序列的生物信息学分析软件与生物信息学网站 | 第49-50页 |
| ·猪Six1基因启动子的生物信息学分析软件与生物信息学网站 | 第50页 |
| ·猪Six1蛋白亚细胞定位生物信息学分析软件与生物信息学网站 | 第50页 |
| ·方法 | 第50-90页 |
| ·猪Six1基因的克隆及生物信息学分析 | 第50-54页 |
| ·引物的设计 | 第50-52页 |
| ·PCR产物的扩增 | 第52页 |
| ·PCR产物的回收纯化 | 第52页 |
| ·连接反应 | 第52页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第52-53页 |
| ·转化 | 第53页 |
| ·阳性克隆子的鉴定及测序 | 第53页 |
| ·分离基因序列的生物信息学分析 | 第53-54页 |
| ·猪Six1基因组织表达谱分析 | 第54-56页 |
| ·总RNA的提取 | 第54-55页 |
| ·cDNA的合成 | 第55页 |
| ·猪Six1基因的组织表达分析 | 第55-56页 |
| ·猪Six1基因表达模式分析 | 第56页 |
| ·PCR反应体系 | 第56页 |
| ·PCR反应程序 | 第56页 |
| ·统计分析方法 | 第56页 |
| ·猪Six1基因遗传多样性与遗传效应分析 | 第56-58页 |
| ·猪Six1基因SNP的寻找 | 第56-57页 |
| ·PCR-RFLP诊断方法的建立 | 第57页 |
| ·不同猪种的多态性分析 | 第57页 |
| ·F_2代资源家系中的多态性分析 | 第57-58页 |
| ·猪Six1基因启动子活性分析 | 第58-65页 |
| ·融合PCR获取猪Six1基因近端启动子片段 | 第58-59页 |
| ·含AD启动子序列的pGEM-T easy vector载体的构建 | 第59页 |
| ·猪Six1基因近端启动子生物信息学分析 | 第59-60页 |
| ·猪Six1基因启动子不同缺失片段的获取 | 第60页 |
| ·猪Six1基因启动子缺失片段转染载体的构建 | 第60-61页 |
| ·启动子在三种不同真核细胞中的活性分析 | 第61-64页 |
| ·Six1基因在小鼠成肌细胞(C2C12)分化前后表达及启动子活性比较 | 第64-65页 |
| ·共转染试验 | 第65页 |
| ·猪Six1基因启动子甲基化分析 | 第65-71页 |
| ·体外甲基化模拟试验 | 第65-66页 |
| ·Six1基因启动子与第一外显子区在不同组织与不同肌肉中的甲基化分析 | 第66-71页 |
| ·猪Six1基因亚细胞定位分析 | 第71-74页 |
| ·猪Six1基因亚细胞定位生物信息学分析 | 第71页 |
| ·亚细胞定位缺失载体构建 | 第71-73页 |
| ·细胞转染 | 第73-74页 |
| ·细胞固定与基因亚细胞定位检测 | 第74页 |
| ·过表达试验 | 第74-88页 |
| ·小鼠过表达载体构建 | 第74-80页 |
| ·Six1基因瞬时转染试验 | 第80-84页 |
| ·Six1基因稳筛选试验 | 第84-88页 |
| ·MTT与细胞周期试验 | 第88-90页 |
| ·MTT试验 | 第88-89页 |
| ·细胞周期试验 | 第89-90页 |
| 3 结果与分析 | 第90-140页 |
| ·猪Six1基因的克隆与生物信息学分析结果 | 第90-96页 |
| ·猪Six1基因CDS序列克隆结果 | 第90页 |
| ·猪Six1基因5’末端与3’末端克隆结果 | 第90-91页 |
| ·猪Six1基因内含子克隆结果 | 第91页 |
| ·猪Six1基因结构特征分析结果 | 第91-92页 |
| ·猪Six1基因生物信息学分析结果 | 第92-96页 |
| ·猪Six1基因组织表达谱分析结果 | 第96-97页 |
| ·组织总RNA提取结果 | 第96页 |
| ·第一链cDNA检测结果 | 第96-97页 |
| ·猪Six1基因在猪不同组织中的表达结果 | 第97页 |
| ·猪Six1基因表达模式分析结果 | 第97-99页 |
| ·猪Six1基因在大白猪与梅山猪背最长肌不同发育阶段表达模式比较 | 第97-98页 |
| ·猪Six1基因在大白猪背最长肌不同发育阶段的表达模式 | 第98页 |
| ·猪Six1基因在梅山猪不同肌肉组织中的表达模式 | 第98-99页 |
| ·猪Six1基因多态性与遗传效应分析结果 | 第99-105页 |
| ·猪Six1基因多态性检测结果 | 第99-101页 |
| ·猪Six1基因内含子1595(A/G)转换突变多态性与生产性状关联分析 | 第101-102页 |
| ·猪Six1基因启动子136(C/T)转换突变多态性与生产性状关联分析 | 第102-104页 |
| ·猪Six1基因启动子1363(C/T)转换突变多态性与生产性状关联分析 | 第104-105页 |
| ·猪Six1基因启动子活性分析结果 | 第105-114页 |
| ·融合PCR获得猪Six1基因近端启动子结果 | 第105-106页 |
| ·启动子生物信息学分析结果 | 第106-108页 |
| ·启动子缺失载体构建结果 | 第108页 |
| ·启动子在三种不同真核细胞中活性分析结果 | 第108-111页 |
| ·小鼠成肌细胞分化前后Six1基因启动子活性与表达的相关分析 | 第111-112页 |
| ·启动子共转染活性比较分析 | 第112-113页 |
| ·体外甲基化模拟试验分析启动子活性 | 第113-114页 |
| ·猪Six1基因启动子与第一外显子区在不同组织与不同肌肉中的甲基化分析结果 | 第114-118页 |
| ·启动子区域1在不同组织的甲基化分析结果 | 第116-117页 |
| ·启动子区域1在不同肌肉的甲基化分析结果 | 第117页 |
| ·外显子区域2在不同组织的甲基化分析结果 | 第117-118页 |
| ·外显子区域2在不同肌肉的甲基化分析结果 | 第118页 |
| ·猪Six1基因亚细胞定位分析结果 | 第118-126页 |
| ·生物信息学分析基因片段的亚细胞定位结果 | 第118-119页 |
| ·猪Six1基因全长CDS克隆测序结果 | 第119页 |
| ·亚细胞定位基因缺失片段定位载体构建结果 | 第119-121页 |
| ·荧光共聚焦观察基因片段定位结果 | 第121-126页 |
| ·过表达试验结果 | 第126-136页 |
| ·瞬时转染试验结果 | 第126-131页 |
| ·小鼠Six1基因全长CDS克隆结果 | 第126页 |
| ·阳性TA克隆载体的检测结果 | 第126页 |
| ·重组载体pcDNA3.1+MSix1双酶切鉴定结果 | 第126-127页 |
| ·重组载体pcDNA3.1+EGFP双酶切鉴定结果 | 第127-128页 |
| ·瞬时转染预试验结果 | 第128页 |
| ·Real-time PCR分析Six1基因生肌网络中对相关基因的表达变化的影响 | 第128-130页 |
| ·Western blot验证Six1基因在生肌网络中对相关基因表达变化的影响 | 第130-131页 |
| ·稳定转染试验结果 | 第131-136页 |
| ·G418筛选浓度确定结果 | 第131-132页 |
| ·过表达载体pcDNA3.1+MSix1线性化结果 | 第132页 |
| ·G418筛选稳定克隆结果 | 第132-133页 |
| ·多克隆富集结果 | 第133-134页 |
| ·阳性克隆的鉴定结果 | 第134-135页 |
| ·Real-time PCR分析Six1基因生肌网络中对相关基因的表达主化的影响 | 第135-136页 |
| ·MTT与细胞周期试验结果 | 第136-140页 |
| ·MTT试验结果 | 第136-137页 |
| ·试验前阳性细胞的鉴定结果 | 第136-137页 |
| ·同步化24h对阴性对照组细胞进行观察结果 | 第137页 |
| ·MTT分析细胞增殖结果 | 第137页 |
| ·细胞周期试验结果 | 第137-140页 |
| ·流式细胞仪检测稳定转染Six1基因对细胞周期影响的结果 | 第137-139页 |
| ·流式细胞仪检测瞬时转染Six1基因对细胞周期的影响结果 | 第139-140页 |
| 4 讨论 | 第140-165页 |
| ·猪Six1基因序列及生物信息学分析 | 第140-141页 |
| ·猪Six1基因组织表达谱分析 | 第141-142页 |
| ·猪Six1基因表达模式分析 | 第142-145页 |
| ·猪Six1基因在大白猪与梅山猪背最长肌不同发育阶段表达模式比较 | 第142-143页 |
| ·猪Six1基因在大白猪背最长肌不同发育阶段的表达模式 | 第143-144页 |
| ·猪Six1基因在梅山猪不同肌肉组织中的表达模式 | 第144-145页 |
| ·猪Six1基因遗传多样性与遗传效应分析 | 第145-147页 |
| ·猪Six1基因内含子1595(A/G)转换突变多态性与生产性状关联分析 | 第145页 |
| ·猪Six1基因启动子136(C/T)转换突变多态性与生产性状关联分析 | 第145-146页 |
| ·猪Six1基因启动子1363(C/T)转换突变多态性与生产性状关联分析 | 第146-147页 |
| ·猪Six1基因启动子活性分析 | 第147-151页 |
| ·启动子生物信息学分析 | 第147-148页 |
| ·启动子在三种不同真核细胞中的活性分析结果 | 第148-150页 |
| ·小鼠成肌细胞分化前后Six1基因启动子活性与表达的相关分析 | 第150页 |
| ·启动子共转染活性比较分析 | 第150-151页 |
| ·体外甲基化模拟试验分析启动子活性 | 第151页 |
| ·猪Six1基因启动子与第一外显子甲基化谱的分析 | 第151-153页 |
| ·猪Six1基因亚细胞定位分析 | 第153-154页 |
| ·过表达试验分析 | 第154-161页 |
| ·瞬时转染试验 | 第155-157页 |
| ·稳定转染试验 | 第157-161页 |
| ·MTT与细胞周期试验分析 | 第161-165页 |
| ·MTI法分析细胞增殖 | 第161-163页 |
| ·流式细胞分析细胞周期 | 第163-165页 |
| 第三章 猪Pitx2c基因的分离鉴定与表达模式分析 | 第165-192页 |
| 1 引言 | 第165页 |
| 2 材料与方法 | 第165-173页 |
| ·材料 | 第165-166页 |
| ·试验材料 | 第165页 |
| ·主要仪器设备 | 第165-166页 |
| ·主要试剂与试剂盒 | 第166页 |
| ·分子生物学软件与生物信息学网站 | 第166页 |
| ·方法 | 第166-173页 |
| ·猪Pitx2c基因的克隆及生物信息学分析 | 第166-167页 |
| ·猪Pitx2c基因组织表达谱分析 | 第167-168页 |
| ·猪Pitx2c基因表达模式分析 | 第168页 |
| ·猪Pitx2c基因遗传多样性与遗传效应分析 | 第168-173页 |
| ·猪Pitx2c基因SNP的寻找 | 第168-169页 |
| ·基因分型方法 | 第169-173页 |
| ·统计分析 | 第173页 |
| 3 结果与分析 | 第173-186页 |
| ·猪Pitx2c基因的克隆与生物信息学分析结果 | 第173-176页 |
| ·猪Pitx2c基因cDNA全长克隆结果 | 第173-174页 |
| ·猪Pitx2c基因内含子克隆结果 | 第174页 |
| ·猪Pitx2c基因生物信息学分析结果 | 第174-176页 |
| ·猪Pitx2c基因组织表达谱分析结果 | 第176页 |
| ·猪Pitx2c基因表达模式分析结果 | 第176-178页 |
| ·猪Pitx2c基因在大白猪与梅山猪背最长肌不同发育阶段表达模式比较 | 第176-177页 |
| ·猪Pitx2c基因在梅山猪背最长肌不同发育阶段的表达模式 | 第177-178页 |
| ·猪Pitx2c基因在梅山猪不同肌肉组织中的表达模式 | 第178页 |
| ·猪Pitx2c基因遗传多样性与遗传效应分析结果 | 第178-186页 |
| ·猪Pitx2c基因多态性检测结果 | 第178页 |
| ·猪Pitx2c基因外显子两个SNPs位点的多态性与生产性状的关联分析 | 第178-181页 |
| ·猪Pitx2c基因3’非翻译区两个SNPs位点的多态性与生产性状关联分析 | 第181-183页 |
| ·SNP连锁不平衡与单倍型分析,以及单倍型与生产性状的关联分析 | 第183-186页 |
| 4 讨论 | 第186-192页 |
| ·猪Pitx2c基因序列及生物信息学分析 | 第186页 |
| ·猪Pitx2c基因组织表达谱分析 | 第186-187页 |
| ·猪Pitx2c基因表达模式分析 | 第187-189页 |
| ·猪Pitx2c基因在大白猪与梅山猪背最长肌不同发育阶段表达模式比较 | 第187-188页 |
| ·猪Pitx2c基因在梅山猪背最长肌不同发育阶段的表达模式 | 第188-189页 |
| ·猪Pitx2c基因在梅山猪不同肌肉组织中的表达模式 | 第189页 |
| ·猪Pitx2c基因遗传多样性与遗传效应分析 | 第189-192页 |
| 第四章 结论 | 第192-195页 |
| 1 论文试验总结 | 第192-193页 |
| 2 下一步工作计划 | 第193-195页 |
| 参考文献 | 第195-210页 |
| 在读期间发表文章题录 | 第210-211页 |
| 致谢 | 第211-212页 |
