细菌代谢物浓度的化学信息学预测及在杀菌剂发现中的应用
| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-28页 |
| ·药物研发现状概述 | 第12-13页 |
| ·抗菌药物的发展及现状 | 第13-15页 |
| ·抗菌药物靶标发现的方法 | 第15-24页 |
| ·基于基因组学的靶标发现 | 第15-18页 |
| ·基于蛋白组学的靶标发现 | 第18-21页 |
| ·基于代谢组学的靶标发现 | 第21-24页 |
| ·本课题的研究目的及意义 | 第24-28页 |
| 第二章 细菌代谢物浓度的化学信息学预测 | 第28-56页 |
| ·引言 | 第28-29页 |
| ·硬件与软件 | 第29-30页 |
| ·主要硬件 | 第29页 |
| ·主要软件 | 第29-30页 |
| ·材料与方法 | 第30-43页 |
| ·代谢物分子描述符的计算 | 第30-31页 |
| ·数据来源 | 第31页 |
| ·代谢网络构建 | 第31-34页 |
| ·基于线性模型的代谢物浓度预测 | 第34-36页 |
| ·基于支持向量回归模型的代谢物浓度预测 | 第36-43页 |
| ·结果与讨论 | 第43-55页 |
| ·代谢网络组织的化学基础 | 第43-46页 |
| ·代谢物浓度预测的线性模型 | 第46-48页 |
| ·代谢物浓度预测的SVR模型 | 第48-53页 |
| ·代谢物浓度的相关特征分析 | 第53-55页 |
| ·小结 | 第55-56页 |
| 第三章 基于SVR代谢物浓度预测模型的网络服务 | 第56-65页 |
| ·引言 | 第56-57页 |
| ·材料与方法 | 第57-58页 |
| ·十种动植物致病菌全基因组数据 | 第57页 |
| ·十种动植物致病菌的代谢物参数计算 | 第57-58页 |
| ·硬件与软件 | 第58页 |
| ·主要硬件 | 第58页 |
| ·主要软件 | 第58页 |
| ·结果与分析 | 第58-64页 |
| ·十种动植物致病菌的代谢物浓度预测 | 第58-60页 |
| ·细菌代谢物浓度预测网站构建 | 第60-64页 |
| ·小结 | 第64-65页 |
| 第四章 代谢物浓度在杀菌剂发现中的应用 | 第65-71页 |
| ·引言 | 第65页 |
| ·材料与方法 | 第65-66页 |
| ·数据来源 | 第65-66页 |
| ·研究方法 | 第66页 |
| ·结果与分析 | 第66-70页 |
| ·小结 | 第70-71页 |
| 第五章 代谢物浓度在黄酮类杀菌剂靶标发现中的应用 | 第71-85页 |
| ·引言 | 第71-73页 |
| ·材料和方法 | 第73-76页 |
| ·数据收集 | 第73-74页 |
| ·研究方法 | 第74-76页 |
| ·结果与分析 | 第76-84页 |
| ·黄酮类杀菌剂潜在靶标发现 | 第76-81页 |
| ·黄酮类杀菌剂与靶标对接分析 | 第81-83页 |
| ·代谢物浓度分析 | 第83-84页 |
| ·小结 | 第84-85页 |
| 第六章 总结与展望 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-99页 |
| 附表 | 第99-111页 |
| 攻读博士期间发表的论文 | 第111-112页 |
| 致谢 | 第112页 |
