甘蓝型油菜耐湿差异性表达基因的筛选及分析
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 1 前言 | 第9-17页 |
| ·湿害对植物生长的危害机理 | 第10-12页 |
| ·根系缺氧伤害 | 第10-11页 |
| ·光合能力下降 | 第11页 |
| ·细胞能量代谢效率下降 | 第11页 |
| ·代谢中间产物产生毒害作用 | 第11-12页 |
| ·湿害对油菜生长的影响 | 第12-13页 |
| ·湿害显著抑制油菜生长 | 第12页 |
| ·湿害造成油菜产量、品质显著下降 | 第12页 |
| ·湿害导致油菜生理生化紊乱 | 第12-13页 |
| ·油菜耐湿性相关机理 | 第13-14页 |
| ·油菜耐湿性的遗传多样性 | 第13页 |
| ·油菜耐湿性的遗传机理 | 第13-14页 |
| ·油菜耐湿性与生理生化的关系 | 第14页 |
| ·转录组测序(RNA-seq)技术研究进展 | 第14-16页 |
| ·转录组测序技术的涵义 | 第14-15页 |
| ·数字化表达谱技术的应用现状 | 第15页 |
| ·RNA-Seq技术优势 | 第15-16页 |
| ·转录组测序技术的应用 | 第16页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第16-17页 |
| 2 实验材料与方法 | 第17-25页 |
| ·实验材料 | 第17页 |
| ·器皿准备 | 第17页 |
| ·TotalRNA的提取 | 第17-18页 |
| ·RNA的纯度测定和电泳检测 | 第18页 |
| ·RNA纯化及cDNA的合成 | 第18-20页 |
| ·PCR检测反转录的cDNA的完整性 | 第20页 |
| ·实时荧光定量PCR(qPCR)检测 | 第20-22页 |
| ·转录组文库生物信息学分析 | 第22-25页 |
| ·差异表达量的统计 | 第22页 |
| ·差异表达基因筛选 | 第22-23页 |
| ·Gene ontology功能显著性富集分析 | 第23-25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-42页 |
| ·水淹处理后的表型 | 第25页 |
| ·RNA提取结果与分析 | 第25-28页 |
| ·RNA-Seq转录组测序结果与分析 | 第28-42页 |
| ·测序结果评估 | 第28-31页 |
| ·基因覆盖深度检测 | 第31-32页 |
| ·随机性评估 | 第32-33页 |
| ·差异表达基因筛选 | 第33-36页 |
| ·Gene ontology功能显著性富集分析 | 第36-40页 |
| ·Pathway显著性富集分析 | 第40-41页 |
| ·荧光定量PCR | 第41-42页 |
| 4 讨论与小结 | 第42-45页 |
| ·创新与不足 | 第42-43页 |
| ·耐湿相关基因 | 第43-44页 |
| ·结论 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-51页 |
| 致谢 | 第51页 |
