| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-32页 |
| ·生物信息学简介 | 第10-14页 |
| ·生物信息学产生的背景 | 第10-11页 |
| ·常用生物学数据库 | 第11-13页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第13-14页 |
| ·顺式作用元件研究概况 | 第14-21页 |
| ·转录水平调控的特点 | 第15-16页 |
| ·顺式作用元件常用研究方法 | 第16-20页 |
| ·顺式作用元件常用试验方法 | 第16-17页 |
| ·顺式作用元件理论预测方法 | 第17-20页 |
| ·顺式作用元件研究常用数据库 | 第20-21页 |
| ·PLACE( Plant ci52acting regulatory DNA elements) | 第20页 |
| ·TRRD( Transcription regulatory regions database) | 第20-21页 |
| ·TRANSFAC( Transcriptional regulation ,from patterns to profiles) | 第21页 |
| ·SRF 的结构与功能 | 第21-26页 |
| ·MADS-box 转录因子家族 | 第21-24页 |
| ·MADS-box 基因的序列特性 | 第22页 |
| ·MADS-box 基因的分类 | 第22-23页 |
| ·DNA 结合位点 | 第23-24页 |
| ·SRF 的克隆与表达 | 第24页 |
| ·SRF 的结构 | 第24-25页 |
| ·SRF 的生物学功能 | 第25-26页 |
| ·CARG 元件的结构与功能 | 第26-30页 |
| ·CArG 元件的结构 | 第26-27页 |
| ·CArG 元件与SRF 的相互作用 | 第27-29页 |
| ·CArG 元件的保守性 | 第29-30页 |
| ·研究的目的及意义 | 第30-32页 |
| 第二章 小鼠中功能CARG 元件在基因转录起始位点附近的分布及其与功能的关系 | 第32-43页 |
| ·前言 | 第32-33页 |
| ·材料与方法 | 第33-35页 |
| ·实验数据下载 | 第33页 |
| ·小鼠中功能CArG 元件的搜集与整理 | 第33页 |
| ·小鼠中背景序列的确定 | 第33-34页 |
| ·CArG-like 序列在小鼠染色体上的分布 | 第34页 |
| ·CArG 元件基因转录起始位点周围的分布 | 第34页 |
| ·同一基因中相邻CArG 元件的距离分析 | 第34-35页 |
| ·结果与分析 | 第35-39页 |
| ·CArG 元件在小鼠染色体上的分布 | 第35-37页 |
| ·功能CArG 元件分布 | 第37-38页 |
| ·相邻CArG 元件距离的分布 | 第38-39页 |
| ·讨论 | 第39-43页 |
| ·CArG-like 序列与基因在小鼠染色体上分布的关系 | 第40-41页 |
| ·功能CArG 元件在小鼠基因启动子区的分布 | 第41-42页 |
| ·功能CArG 元件的数目及相邻距离与功能的关系 | 第42-43页 |
| 第三章 小鼠与人中功能CARG 元件序列特征对比分析及进化研究 | 第43-57页 |
| ·前言 | 第43页 |
| ·材料与方法 | 第43-46页 |
| ·实验数据下载 | 第43-44页 |
| ·人中功能CArG 元件的搜集与整理 | 第44页 |
| ·人中背景序列的确定 | 第44页 |
| ·小鼠与人CArG 元件的序列特征对比分析 | 第44-45页 |
| ·小鼠与人中CArG 元件的单倍型对比分析 | 第45页 |
| ·小鼠与人中CArG 元件的进化及保守性分析 | 第45-46页 |
| ·结果与分析 | 第46-53页 |
| ·功能CArG 元件的替换率规律 | 第46-47页 |
| ·功能CArG 元件中心位点的高替换率 | 第47-48页 |
| ·功能CArG 元件的TATA 互补 | 第48-50页 |
| ·功能CArG 元件的优势单倍型 | 第50-51页 |
| ·功能CArG 元件的同源分析 | 第51-53页 |
| ·讨论 | 第53-57页 |
| ·功能CArG 元件各个位点的替换率研究 | 第53页 |
| ·功能CArG 元件中心位点的进化分析 | 第53-54页 |
| ·功能CArG 元件中心位点的互补排列 | 第54-55页 |
| ·功能CArG 元件的单倍型与功能的关系 | 第55页 |
| ·小鼠与人中功能CArG 元件的同源关系研究 | 第55-57页 |
| 第四章 结论 | 第57-59页 |
| ·研究的主要结论 | 第57页 |
| ·主要创新点 | 第57-58页 |
| ·不足 | 第58页 |
| ·展望 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 作者简介 | 第72-73页 |
| 附件 | 第73-102页 |
