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禾谷镰孢菌TOR信号途径中关键基因的功能研究

致谢第6-7页
摘要第7-10页
ABSTRACT第10-12页
引言第19-21页
第一章 文献综述第21-41页
    1.1 小麦赤霉病简介第21-22页
    1.2 小麦赤霉菌病的地理分布以及真菌毒素的化学型第22-23页
    1.3 禾谷镰孢菌的生物学特性以及侵染循环第23-24页
    1.4 禾谷镰孢菌侵染寄主机制研究进展第24-25页
    1.5 小麦赤霉病的综合防治第25页
    1.6 雷帕霉素的合成和临床作用机制第25-32页
        1.6.1 抗生素发展简史及链霉菌的生物学特性第25-26页
        1.6.2 雷帕霉素合成基因以及影响雷帕霉素合成的因素第26-28页
        1.6.3 雷帕霉素的临床效果第28-29页
        1.6.4 雷帕霉素作用机制的研究第29-30页
        1.6.5 FK506结合蛋白家族成员的生物学功能第30-32页
    1.7 TOR信号途径研究进展第32-40页
        1.7.1 酵母TOR途径探究进展第32-35页
            1.7.1.1 酵母中Tor蛋白的结构第32-33页
            1.7.1.2 酵母中Tor蛋白复合体以及功能第33-35页
        1.7.2 果蝇中TOR途径研究第35-36页
        1.7.3 拟南芥中TOR途径研究第36-37页
        1.7.4 哺乳动物TOR途径研究第37-39页
        1.7.5 丝状真菌中TOR途径研究第39-40页
    1.8 本研究的内容和意义第40-41页
第二章 实验材料与方法第41-68页
    2.1 所用菌株和质粒第41页
    2.2 致病性实验寄主植物第41页
    2.3 实验方法第41-68页
        2.3.1 禾谷镰孢菌保存方法第42页
        2.3.2 PCR技术第42页
        2.3.3 DNA的琼脂糖电泳第42-43页
        2.3.4 PCR产物纯化第43页
        2.3.5 DNA克隆技术第43-44页
            2.3.5.1 连接反应第43页
            2.3.5.2 大肠杆菌转化第43-44页
        2.3.6 重组质粒的鉴定与提取第44页
            2.3.6.1 重组质粒的鉴定第44页
            2.3.6.2 重组质粒的提取第44页
        2.3.7 质粒双酶切第44页
        2.3.8 禾谷镰孢菌基因敲除载体和基因回补载体的构建第44-46页
        2.3.9 FLAG和GFP标签融合蛋白载体构建第46页
        2.3.10 酵母感受态的制备第46页
        2.3.11 酵母质粒的提取第46-47页
        2.3.12 FLAG标签融合蛋白载体构建第47-48页
        2.3.13 GFP标签融合蛋白载体构建第48页
        2.3.14 禾谷镰孢菌遗传转化第48-49页
            2.3.14.1 分生孢子的收集第48-49页
            2.3.14.2 幼殖体制备第49页
            2.3.14.3 幼殖体裂解第49页
            2.3.14.4 原生质体转化第49页
        2.3.15 禾谷镰孢菌基因组DNA的小量制备第49-50页
        2.3.16 禾谷镰孢菌紫外诱变第50页
        2.3.17 基因组DNA的大量提取(CTAB法)第50-51页
        2.3.18 禾谷镰孢菌基因组DNA Southern blot分析第51页
        2.3.19 杂交样品准备第51页
        2.3.20 禾谷镰孢菌基因组DNA的消化、电泳及变性第51-52页
        2.3.21 DNA转膜第52-53页
        2.3.22 DNA探针的制备第53页
        2.3.23 预杂交和杂交第53-54页
        2.3.24 印迹膜的冲洗和化学发光检测信号第54页
        2.3.25 禾谷镰孢菌总RNA的提取以及第一链cDNA合成第54-55页
            2.3.25.1 禾谷镰孢菌总RNA的提取第54-55页
            2.3.25.2 第一链cDNA合成第55页
        2.3.26 生长速率测定第55-56页
        2.3.27 菌丝和孢子的组织学分析第56页
            2.3.27.1 菌丝脂肪体染色第56页
            2.3.27.2 菌丝、孢子细胞壁和隔膜染色第56页
            2.3.27.3 菌丝和孢子的细胞核染色第56页
        2.3.28 禾谷镰孢菌的产孢以及产子囊壳实验第56页
        2.3.29 禾谷镰孢菌对不同氮源、各种细胞胁迫压力、杀菌剂敏感性分析第56-58页
            2.3.29.1 氮源测定第57页
            2.3.29.2 细胞胁迫以及杀菌剂敏感性测定第57-58页
        2.3.30 禾谷镰孢菌麦穗致病性分析第58页
        2.3.31 禾谷镰孢菌DON毒素和麦角甾醇含量测定第58-59页
            2.3.31.1 禾谷镰孢菌DON毒素提取方法第58-59页
            2.3.31.2 禾谷镰孢菌DON毒素HPLC测定方法第59页
        2.3.32 禾谷镰孢菌麦角甾醇的提取和含量测定第59-60页
            2.3.32.1 禾谷镰孢菌麦角甾醇提取方法第59-60页
            2.3.32.2 禾谷镰孢菌麦角甾醇测定方法第60页
        2.3.33 酵母双杂交分析第60-62页
            2.3.33.1 酵母双杂载体的构建第60-61页
            2.3.33.2 酵母感受态细胞的制备以及质粒共转化第61页
            2.3.33.3 酵母转化子β-半乳糖苷酶活性检测第61-62页
        2.3.34 酵母回补载体的构建第62页
        2.3.35 Western blot印迹分析第62-65页
            2.3.35.1 禾谷镰孢菌总蛋白的提取以及样品处理第62-63页
            2.3.35.2 分离胶和浓缩胶的制备第63-64页
            2.3.35.3 上样电泳第64页
            2.3.35.4 湿法转膜第64页
            2.3.35.5 化学发光第64-65页
        2.3.36 免疫共沉淀第65-66页
            2.3.36.1 菌株的构建和转化第65页
            2.3.36.2 菌丝总蛋白提取第65页
            2.3.36.3 总蛋白的孵育第65页
            2.3.36.4 与FLAG结合的蛋白的洗脱第65-66页
            2.3.36.5 Western Blotting检测互作蛋白第66页
        2.3.37 亲和捕捉实验第66-68页
            2.3.37.1 总蛋白的提取第66页
            2.3.37.2 总蛋白的孵育第66页
            2.3.37.3 与FLAG结合的蛋白的洗脱第66-68页
第三章 结果与分析第68-110页
    3.1 禾谷镰孢菌中雷帕霉素作用机制研究第68-78页
        3.1.1 雷帕霉素能够显著抑制禾谷镰孢菌的生长第68-69页
        3.1.2 雷帕霉素能够抑制禾谷镰孢菌产孢、诱导细胞自噬第69-70页
        3.1.3 FgFkbp12特异性地与雷帕霉素结合并介导雷帕霉素的毒性第70-75页
            3.1.3.1 禾谷镰孢菌中FKBP同源基因的敲除第70-72页
            3.1.3.2 FgFKBP12敲除突变体雷帕霉素抗性增强第72-73页
            3.1.3.3 ΔFgFKBP12对其他药剂敏感性无明显变化第73-74页
            3.1.3.4 FgFKBP12回补载体的构建以及DNA杂交分析第74-75页
            3.1.3.5 ΔFgFKBP12-C恢复对雷帕霉素和FK506的敏感性第75页
        3.1.4 FgTor是禾谷镰孢菌生长所必须的,发生点突变的FgTor(FgTor~(S1866L),FgTor~(S1866L))对雷帕霉素产生抗性第75-78页
            3.1.4.1 FgTor的氨基酸序列分析第75-76页
            3.1.4.2 FgTOR敲除载体的构建以及转化子的鉴定第76-77页
            3.1.4.3 发生点突变的FgTor对雷帕霉素抗性增强第77页
            3.1.4.4 雷帕霉素和FgFkbp12形成的复合体不能结合到点突变的FgTor上第77-78页
    3.2 小结第78-79页
    3.3 TOR途径下游元件功能研究第79-108页
        3.3.1 FgTAP42功能研究第79-84页
            3.3.1.1 FgTap42的多序列比对分析第79-80页
            3.3.1.2 FgTAP42的敲除载体构建以及转化子鉴定第80-81页
            3.3.1.3 FgTAP42能够部分恢复酵母tap42-11的表型第81-82页
            3.3.1.4 FgTap42在酵母和禾谷镰孢菌中的定位不同第82-83页
            3.3.1.5 FgTap42能够与FgKogl、FgPp2A和类Pp2A磷酸酶互作第83-84页
        3.3.2 FgSIT4、FgPPG1功能研究第84-99页
            3.3.2.1 FgPp2A、FgSit4、FgPpg1序列与酵母同源蛋白比对分析第84-85页
            3.3.2.2 FgPp2A、FgSit4、FgPpg1能够与FgTap42互作第85-86页
            3.3.2.3 FgPP2A、FgSIT4、FgPPG1均能够部分恢复酵母sit4的生长缺陷第86-87页
            3.3.2.4 FgPP2A、FgSIT4、FgPPG1敲除载体构建以及转化第87-89页
            3.3.2.5 ΔFgSIT4、ΔFgPPG1回补载体构建第89页
            3.3.2.6 ΔFgSIT4、ΔFgPPG1在PDA上生长缓慢第89-90页
            3.3.2.7 ΔFgSIT4、ΔFgPPG1菌丝脂肪体含量减少第90页
            3.3.2.8 ΔFgSIT4的孢子产量无显著变化、ΔFgPPG1孢子产量显著减少,但是ΔFgSIT4和ΔFgPPG1的孢子隔膜都减少第90-91页
            3.3.2.9 ΔFgSIT4、ΔFgPPG1的有性生殖受阻第91-92页
            3.3.2.10 ΔFgSIT4、ΔFgPPG1在麦穗上致病力显著降低第92-93页
            3.3.2.11 ΔFgSIT4、ΔFgPPG1对药剂、离子胁迫、氧化压力无明显变化第93-95页
            3.3.2.12 ΔFgSIT4、ΔFgPPG1对细胞壁胁迫物质敏感性增加第95-96页
            3.3.2.13 ΔFgSIT4、ΔFgPPG1中FgMgv1磷酸化水平下降第96-97页
            3.3.2.14 FgPpg1能够与FgMsg5互作第97页
            3.3.2.15 FgMsg5能够与FgSit4、FgPpg1和FgMgv1互作第97-98页
            3.3.2.16 FgMSG5敲除突变体对细胞壁胁迫物质荧光白抗性增强第98-99页
        3.3.3 FgTIP41功能研究第99-104页
            3.3.3.1 FgTIP41能够部分回补酵母TIP41敲除突变体第99页
            3.3.3.2 FgTIP41敲除载体构建以及转化子鉴定第99-100页
            3.3.3.3 ΔFgTIP41回补载体构建以及转化第100页
            3.3.3.4 ΔFgTIP41在PDA上生长缓慢第100-101页
            3.3.3.5 ΔFgTIP41在有性生殖和无性生殖方面无显著影响第101-102页
            3.3.3.6 ΔFgTIP41对各类药剂、金属离子、氧化胁迫明显敏感性变化第102页
            3.3.3.7 ΔFgTIP41在麦穗上的致病力减弱第102-103页
            3.3.3.8 FgTip41能够与FgPpg1互作,但是不能够与FgTap42互作第103-104页
        3.3.4 FgAREA功能研究第104-108页
            3.3.4.1 FgAREA与酵母GLN3存在功能同源第104-105页
            3.3.4.2 FgAREA敲除载体构建以及转化子鉴定第105页
            3.3.4.3 ΔFgAREA回补载体构建以及转化第105-106页
            3.3.4.4 ΔFgAREA在PDA上菌丝变稀疏第106页
            3.3.4.5 ΔFgAREA在绿豆中基本不能产孢,但是在CMC中能正常产孢第106-107页
            3.3.4.6 ΔFgAREA对各类药剂敏感性无变化第107页
            3.3.4.7 ΔFgAREA不能利用只含有硝酸盐的氮源第107-108页
            3.3.4.8 ΔFgAREA致病力下降第108页
    3.4 小结第108-110页
第四章 全文总结讨论与展望第110-118页
    4.1 全文总结第110-112页
    4.2 全文讨论第112-115页
    4.3 后续工作设想第115-118页
参考文献第118-130页
附录第130-149页
    附录一 实验中所涉及的引物第130-140页
    附录二 常用的培养基、试剂和溶液配方第140-148页
    附录三 常用试验仪器第148-149页
作者简历及攻读博士期间发表论文第149页

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