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螺旋藻藻蓝蛋白裂合酶cpcE-F基因的克隆、表达及进化分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-13页
第一章 序言第13-31页
   ·蓝藻分子遗传学的研究概况第13-16页
     ·蓝藻基因组的研究概况第13-14页
     ·螺旋藻基因的克隆第14-16页
       ·核糖体蛋白基因及蛋白合成延长因子基因的克隆第14-15页
       ·与螺旋藻信号转导有关的基因的克隆第15页
       ·与氨基酸代谢有关的基因的克隆第15-16页
         ·丝氨酸酯酶第15-16页
         ·谷氨酰胺合成酶第16页
       ·与螺旋藻光合作用及色素合成有关基因的克隆第16页
   ·蓝藻分子系统学研究进展第16-21页
     ·蓝藻分子系统学第16-18页
       ·分子系统学第16-17页
       ·蓝藻第17-18页
       ·蓝藻分子系统学第18页
     ·蓝藻分子系统学研究方法及应用第18-21页
       ·同工酶电泳分析第18-19页
       ·藻胆蛋白组成第19页
       ·免疫学的研究第19页
       ·DNA 碱基组成第19页
       ·DNA 指纹图谱第19-20页
       ·DNA-DNA 杂交第20页
       ·限制性内切酶片断长度多态性(RFLP)第20页
       ·随机扩增多态性DNA(RAPD)第20页
       ·16SrRNA 基因分析第20-21页
       ·其他分析方法第21页
   ·系统发育重建方法第21-24页
     ·距离法第22页
     ·最大简约法第22页
     ·最大似然法第22-23页
     ·贝叶斯推测第23-24页
   ·藻胆蛋白及裂合酶基因的研究进展第24-28页
     ·藻胆蛋白研究进展第24-26页
     ·藻胆蛋白的光谱及荧光性质第26页
     ·藻胆色素的性质第26-27页
     ·藻胆蛋白裂合酶基因研究进展第27-28页
   ·课题提出的目的和意义第28-31页
     ·螺旋藻的分类第28-29页
     ·课题提出的意义第29-31页
第二章 螺旋藻裂合酶 cpcE-F 基因的克隆、分析和系统进化研究第31-72页
   ·实验材料第32-35页
     ·菌种及质粒第32页
     ·常用仪器统计第32-33页
     ·常用试剂统计第33-34页
     ·常用的培养基配方及试剂配制第34-35页
   ·实验方法第35-45页
     ·藻丝的培养和收集第35页
     ·CTAB 新法提取螺旋藻总DNA第35-36页
     ·提取的总DNA 的检测第36-37页
       ·低熔点琼脂糖凝胶电泳检测第36-37页
         ·低熔点琼脂糖凝胶电泳胶的制备第36页
         ·电泳检测第36-37页
       ·测定OD 值第37页
         ·浓度的检测第37页
         ·纯度的检测第37页
     ·进化分析所用基因的获得第37-38页
     ·凝胶回收步骤第38-39页
     ·纯化的PCR 产物与T-载体的连接第39-41页
       ·pMD18-T simple vector 简介第39-41页
       ·纯化的PCR 产物与载体的连接第41页
     ·热击法转化大肠杆菌DH5α第41-42页
       ·热击法感受态细胞的制备第41-42页
       ·热击法转化大肠杆菌DH5α第42页
     ·阳性克隆的挑选第42-43页
       ·质粒提取第42-43页
       ·阳性克隆的检测第43页
       ·电泳检测第43页
     ·序列测定第43页
     ·序列分析第43-45页
   ·结果与讨论第45-72页
     ·微藻总DNA 的提取第45-46页
     ·进化分析所用目的基因的结果第46-48页
     ·PCR 产物(cpcE-F 基因)与T 载体的连接与检测第48-49页
     ·质粒PMD18-T-cpcE-F 的提取第49页
     ·序列测定和分析第49-72页
       ·cpcE-F 基因的核苷酸序列第49-51页
       ·cpcE-F 基因开放读码框(ORF)和GC 含量分析第51-54页
       ·cpcE-F 基因的氨基酸序列推导及密码子使用情况第54-59页
       ·序列的相似性和同源性第59-67页
       ·二级结构预测及分析第67-69页
       ·系统发育分析第69-72页
第三章 藻蓝蛋白裂合酶基因在大肠杆菌中的表达研究第72-94页
   ·实验材料第72-76页
     ·菌种及质粒第72-73页
     ·常用仪器统计第73页
     ·常用试剂统计第73页
     ·常用的培养基配方及试剂配制第73-76页
   ·实验方法第76-86页
     ·藻丝的培养和收集第76页
     ·CTAB 新法提取螺旋藻总DNA第76页
     ·提取的总DNA 的电泳检测第76页
     ·质粒构建所用目的基因的获得第76-80页
       ·结构基因cpcA 的获得第77页
       ·藻胆色素合成所需酶的基因pcyA 的获得第77-78页
       ·藻胆色素合成所需酶的基因hox1 的获得第78页
       ·Spirulina platensis FACH8314 裂合酶cpcE_(314) 基因的获得第78-79页
       ·Spirulina platensis FACH8314 裂合酶cpcF_(314) 基因的获得第79页
       ·Spirulina subsalsa FACH8351 裂合酶cpcE_(351) 基因的获得第79-80页
       ·Spirulina subsalsa FACH8351 裂合酶cpcF_(351) 基因的获得第80页
     ·目的片段的电泳检测、回收和连接检测第80页
     ·电击法转化大肠杆菌BL21(DE3)第80-82页
       ·电击小杯的预处理第81页
       ·电转化法大肠杆菌感受态的制备第81页
       ·电击法转化大肠杆菌BL21(DE3)第81-82页
     ·裂合酶cpcE_(314/351)、cpcF_(314/351) 基因在大肠杆菌中的功能认证第82-86页
       ·表达载体的构建第82-84页
       ·蛋白的表达第84-85页
       ·重组蛋白的破碎第85页
       ·SDS-PAGE 电泳、Western Blotting 及光谱检测第85-86页
   ·结果与讨论第86-94页
     ·藻蓝蛋白α亚基cpcA 基因的获得第86页
     ·铁氧蛋白氧化还原酶pcyA 基因的获得第86-87页
     ·血红素氧化酶hox1 基因的获得第87-88页
     ·裂合酶cpcE_(314) 基因的获得第88页
     ·裂合酶cpcF_(314) 基因的获得第88-89页
     ·裂合酶cpcE_(351) 基因的获得第89页
     ·裂合酶cpcF_(351) 基因的获得第89-90页
     ·基因表达结果第90-94页
       ·表达质粒pET-hox1-pcyA 的检测第90页
       ·表达质粒pACYCDuet-cpcA-cpcE-cpcF 的检测第90-91页
       ·蛋白表达结果第91-92页
       ·表达蛋白的荧光光谱分析第92-94页
全文结论第94-95页
参考文献第95-101页
附录第101-105页
致谢第105-106页
攻读学位期间发表的学术论文第106-107页

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