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我国圈养小熊猫种群遗传多样性分析与亲权鉴定

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
缩略词表第12-13页
第一章 文献综述第13-31页
    1 小熊猫概况第13-18页
        1.1 小熊猫的发现第13-14页
        1.2 小熊猫的分类第14页
        1.3 小熊猫的繁殖特性第14-15页
        1.4 小熊猫资源现状与保护第15-16页
        1.5 小熊猫圈养历史及现状第16-18页
            1.5.1 全球小熊猫圈养历史及现状第16-17页
            1.5.2 中国小熊猫圈养历史及现状第17-18页
    2 小熊猫分子遗传学研究现状第18-21页
        2.1 DNA指纹图谱第18-19页
        2.2 限制性片段长度多态性第19页
        2.3 随机扩增多态性DNA第19页
        2.4 线粒体DNA第19-20页
        2.5 微卫星DNA第20-21页
    3 微卫星标记及其在濒危动物研究中的应用第21-28页
        3.1 微卫星DNA及其多态性分析原理第21-22页
        3.2 微卫星标记的特点第22页
        3.3 微卫星标记技术的应用方法第22-24页
            3.3.1 微卫星序列的获得第22页
            3.3.2 微卫星引物的设计第22-23页
            3.3.3 微卫星PCR扩增第23页
            3.3.4 微卫星扩增产物检测第23页
            3.3.5 微卫星数据处理与分析第23-24页
        3.4 微卫星标记在濒危动物保护研究中的应用第24-28页
            3.4.1 种群遗传学第24-25页
            3.4.2 种群动态与物种进化史第25-26页
            3.4.3 亲缘关系鉴定第26页
            3.4.4 交配系统第26-27页
            3.4.5 物种鉴定第27页
            3.4.6 个体识别与辅助种群调查第27-28页
    4 亲权鉴定第28-30页
        4.1 濒危野生动物亲权鉴定的意义第28页
        4.2 动物亲权鉴定的方法第28-30页
            4.2.1 DNA指纹图谱第29页
            4.2.2 微卫星DNA第29-30页
            4.2.3 线粒体DNA第30页
    5 本研究的目的及意义第30-31页
第二章 小熊猫微卫星DNA标记筛选与鉴定第31-44页
    1 前言第31页
    2 材料与方法第31-39页
        2.1 试验材料第31-33页
            2.1.1 试验对象第31页
            2.1.2 主要仪器第31-32页
            2.1.3 主要试验试剂第32页
            2.1.4 主要溶液配制第32-33页
        2.2 试验方法第33-38页
            2.2.1 血样的采集第33页
            2.2.2 小熊猫血液DNA提取第33-34页
            2.2.3 引物选择第34-36页
            2.2.4 PCR反应体系及其条件优化第36页
            2.2.5 PCR扩增产物的琼脂糖检测第36-37页
            2.2.6 聚丙烯酰胺凝胶电泳与硝酸银染色检测第37页
            2.2.7 荧光引物的筛选与组合第37-38页
            2.2.8 荧光标记引物的PCR扩增第38页
            2.2.9 多色PCR扩增产物ABI-3730XL DNA Analyzer检测第38页
        2.3 数据的统计分析第38-39页
            2.3.1 统计原理第38-39页
            2.3.2 统计软件第39页
    3 结果第39-42页
        3.1 基因组DNA提取第39页
        3.2 PAGE电泳检测介导的微卫星DNA标记的筛选第39-42页
        3.3 ABI-3730XL DNA Analyzer介导的微卫星DNA标记鉴定第42页
            3.3.1 荧光PCR扩增产物的STR分型第42页
    4 讨论第42-44页
第三章 我国圈养小熊猫遗传多样性研究第44-58页
    1 前言第44页
    2 材料与方法第44-49页
        2.1 试验材料第44-45页
            2.1.1 试验对象第44页
            2.1.2 主要仪器、试剂及溶液配制第44-45页
        2.2 试验方法第45-47页
            2.2.1 血样的采集第45页
            2.2.2 皮肤与毛发的采集方法第45页
            2.2.3 小熊猫血液DNA提取第45页
            2.2.4 小熊猫皮肤DNA提取第45-46页
            2.2.5 小熊猫毛发DNA提取第46-47页
            2.2.6 选择引物及PCR反应条件第47页
            2.2.7 PCR扩增产物的琼脂糖检测第47页
            2.2.8 荧光PCR引物合成、扩增及产物分型第47页
        2.3 数据的统计分析第47-49页
            2.3.1 统计原理第47-49页
            2.3.2 统计分析第49页
    3 结果第49-53页
        3.1 总群体遗传多样性第49-53页
            3.1.1 11个群体遗传多样性第49-50页
            3.1.2 14个种群平均期望杂合度第50页
            3.1.3 圈养种群与野生种群遗传多样性比较第50-51页
            3.1.4 Hardy-Weinberg平衡定律检验第51页
            3.1.5 种群遗传分化第51-52页
            3.1.6 Structure动态分析第52-53页
    4 讨论第53-58页
        4.1 种群遗传多样性第53-56页
            4.1.1 等位基因数量第54页
            4.1.2 多态信息含量第54页
            4.1.3 基因丰富度第54-55页
            4.1.4 圈养群体与野生群体遗传多样性第55页
            4.1.5 Hardy-Weinberg平衡第55-56页
        4.2 种群遗传分化第56-57页
        4.3 Structure动态分析第57-58页
第四章 应用微卫星标记进行小熊猫亲权鉴定第58-69页
    1 前言第58页
    2 材料与方法第58-61页
        2.1 试验材料第58-59页
            2.1.1 试验对象第58页
            2.1.2 主要仪器、试剂及溶液配制第58-59页
        2.2 试验方法第59页
        2.3 引物选择第59-60页
        2.4 统计分析第60-61页
            2.4.1 统计学原理第60页
            2.4.2 统计软件应用第60-61页
    3 结果第61-67页
        3.1 各微卫星位点的特征第61页
        3.2 父权鉴定排除概率第61页
        3.3 经典亲子鉴定法第61-63页
        3.4 应用Cervus 3.0软件验证已知双亲后代的鉴定结果第63页
            3.4.1 19个STR标记的鉴定结果第63页
            3.4.2 STR标记组合的鉴定结果第63页
        3.5 应用Cervus 3.0软件鉴定未知父权后代的结果第63页
            3.5.1 应用7个STR标记的亲权鉴定结果第63页
            3.5.2 应用19个STR标记的亲权鉴定结果第63页
        3.6 福州圈养群体遗传谱系第63-65页
        3.7 群体内亲缘关系第65-67页
    4 讨论第67-69页
        4.1第67-69页
            4.1.1 亲权鉴定第67页
            4.1.2 双生子卵型鉴定第67页
            4.1.3 遗传谱系第67-68页
            4.1.4 种群内亲缘关系第68-69页
第五章 结论与保护策略建议第69-71页
参考文献第71-80页
附录第80-95页
致谢第95-96页
攻读博士期间发表的论文第96-97页

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