| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 综述 | 第10-21页 |
| 1.1 LTR转座子 | 第10-14页 |
| 1.1.1 概述 | 第10页 |
| 1.1.2 结构 | 第10-11页 |
| 1.1.3 分类 | 第11-12页 |
| 1.1.4 转座机制 | 第12-13页 |
| 1.1.5 LTR转座子对宿主基因组的影响 | 第13-14页 |
| 1.2 LTR转座子的分离鉴定 | 第14-15页 |
| 1.3 LTR转座子在基因组研究中的运用 | 第15-17页 |
| 1.3.1 分子标记开发及应用 | 第15-17页 |
| 1.3.2 基因标签及基因功能分析 | 第17页 |
| 1.4 竹子LTR转座子研究进展 | 第17-18页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第18-19页 |
| 1.6 技术路线 | 第19-21页 |
| 2 LTR转座子PHRE3、PHRE4、PHRE5的鉴定及结构分析 | 第21-56页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-23页 |
| 2.1.1 材料 | 第21页 |
| 2.1.2 试剂 | 第21-22页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第22页 |
| 2.1.4 引物设计 | 第22-23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-28页 |
| 2.2.1 PHRE3、PHRE4和PHRE5的生物信息学分析 | 第23-24页 |
| 2.2.2 毛竹PHRE5转座子的克隆 | 第24-28页 |
| 2.3 结果分析 | 第28-54页 |
| 2.3.1 PHRE3、PHRE4和PHRE5的鉴定及结构分析 | 第28-41页 |
| 2.3.2 PHRE3、PHRE4和PHRE5在毛竹基因组中的分布及插入时间 | 第41-47页 |
| 2.3.3 PHRE3、PHRE4和PHRE5在毛竹基因组中的插入偏好性 | 第47-51页 |
| 2.3.4 PHRE3、PHRE4和PHRE5进化树的构建 | 第51-52页 |
| 2.3.5 毛竹PHRE5转座子的选取和克隆 | 第52-54页 |
| 2.4 讨论 | 第54-56页 |
| 3 PHRE5在毛竹非生物胁迫处理下拷贝数和插入多态性分析 | 第56-76页 |
| 3.1 实验材料 | 第56-59页 |
| 3.1.1 材料 | 第56页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第56-58页 |
| 3.1.3 主要仪器 | 第58页 |
| 3.1.4 引物设计 | 第58-59页 |
| 3.2 实验方法 | 第59-65页 |
| 3.2.1 实验材料的处理 | 第59-60页 |
| 3.2.2 不同处理毛竹中转座子拷贝数的检测 | 第60-62页 |
| 3.2.3 不同处理毛竹中转座子多态性的检测 | 第62-65页 |
| 3.3 结果分析 | 第65-74页 |
| 3.3.1 不同处理毛竹中转座子的拷贝数变化 | 第65-70页 |
| 3.3.2 不同处理毛竹中转座子的多态性 | 第70-74页 |
| 3.4 讨论 | 第74-76页 |
| 4 PHRE5在毛竹变种中的拷贝数和插入多态性分析 | 第76-83页 |
| 4.1 实验材料 | 第76-77页 |
| 4.1.1 材料 | 第76-77页 |
| 4.1.2 主要试剂及仪器 | 第77页 |
| 4.1.3 定量PCR引物与多态性引物设计 | 第77页 |
| 4.2 实验方法 | 第77-78页 |
| 4.3 结果分析 | 第78-81页 |
| 4.3.1 毛竹变种基因组提取 | 第78页 |
| 4.3.2 毛竹变种中PHRE5拷贝数分析 | 第78-79页 |
| 4.3.3 LA PCR扩增结果 | 第79-80页 |
| 4.3.4 多态性评价 | 第80-81页 |
| 4.4 讨论 | 第81-83页 |
| 5.结论与展望 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-90页 |
| 个人简介 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
