| 摘要 | 第2-3页 |
| Abstract | 第3-4页 |
| 本文所用缩略符号及中文对照 | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-17页 |
| 1.1 小麦赤霉病 | 第8页 |
| 1.2 小麦抗赤霉病主效QTL Fhb1精确定位和克隆 | 第8-9页 |
| 1.3 Fhb1的抗病机制分析 | 第9-17页 |
| 1.3.1 通过转录组学分析Fhb1的抗病机制 | 第9-12页 |
| 1.3.2 通过蛋白质组学分析Fhb1的抗病机制 | 第12-13页 |
| 1.3.3 通过代谢组学分析Fhb1的抗病机制 | 第13-17页 |
| 第二章 小麦抗赤霉病近等基因系转录组分析 | 第17-35页 |
| 2.1 引言 | 第17页 |
| 2.2 材料与方法 | 第17-19页 |
| 2.2.1 植物材料和赤霉病接种 | 第17页 |
| 2.2.2 RNA文库构建和测序 | 第17-18页 |
| 2.2.3 De novo组装和功能注释 | 第18页 |
| 2.2.4 基因表达量计算和差异基因的筛选 | 第18-19页 |
| 2.3 结论 | 第19-31页 |
| 2.3.1 RNA纯度检测 | 第19页 |
| 2.3.2 De novo初步组装结果 | 第19-20页 |
| 2.3.3 基因功能注释结果 | 第20-22页 |
| 2.3.4 在无参考序列条件下组装差异表达的基因 | 第22-25页 |
| 2.3.5 有参考序列比对差异表达的基因 | 第25-30页 |
| 2.3.6 与ctg0954b比对结果 | 第30-31页 |
| 2.4 讨论 | 第31-34页 |
| 2.4.1 无参组装和有参比对条件下差异表达基因的比较 | 第31-32页 |
| 2.4.2 无参组装和有参比对条件下差异表达基因与小麦ctg0954b的比对 | 第32-34页 |
| 2.5 结论 | 第34-35页 |
| 第三章 小麦赤霉病感病基因TaS410的克隆及分析 | 第35-50页 |
| 3.1 引言 | 第35-36页 |
| 3.2 材料与方法 | 第36-38页 |
| 3.2.1 植物材料和赤霉病接种 | 第36页 |
| 3.2.2 转录组测序分析和De novo组装 | 第36页 |
| 3.2.3 基因克隆和标记开发 | 第36-37页 |
| 3.2.4 进化分析 | 第37页 |
| 3.2.5 空间和时间表达模式 | 第37-38页 |
| 3.2.6 启动子顺式调控元件 | 第38页 |
| 3.3 结果 | 第38-47页 |
| 3.3.1 在Fhb1近等基因系NIL75和NIL98中不转录本差异分析 | 第38页 |
| 3.3.2 开发与Fhb1等位基因相关的TaS410标记 | 第38-41页 |
| 3.3.3 在重组自交系群体中TaS410和赤霉病感病性的关系 | 第41-42页 |
| 3.3.4 接种赤霉菌后TaS410的表达模式 | 第42-43页 |
| 3.3.5 TaS410在谷类作物中的分布 | 第43-45页 |
| 3.3.6 TaS410在小麦微核心种质中的分布以及与各个性状之间的关联 | 第45-47页 |
| 3.4 讨论 | 第47-49页 |
| 3.4.1 Fhb1位点的基因注释 | 第47-48页 |
| 3.4.2 TaS410与赤霉病感病性的关系 | 第48页 |
| 3.4.3 TaS410在被子植物中的保守性 | 第48-49页 |
| 3.5 结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 文章和专利 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
