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拟态弧菌感染鱼肠组织差异蛋白组分析及OmpU互作蛋白鉴定

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
本论文常用中英文缩写词第11-12页
文献综述第12-17页
引言第17-18页
1 材料与方法第18-29页
    1.1 菌株第18页
    1.2 酶类与主要试剂(盒)第18页
    1.3 主要溶液与培养基(液)的制备第18-21页
        1.3.1 蛋白表达与纯化所需溶液第18-19页
        1.3.2 提取组织蛋白所用溶液第19页
        1.3.3 细菌培养基(液)第19页
        1.3.4 蛋白电泳检测所用溶液第19-20页
        1.3.5 Pull-down试验所用溶液第20页
        1.3.6 双向电泳所用溶液第20-21页
    1.4 主要仪器第21页
    1.5 实验动物第21页
    1.6 拟态弧菌感染草金鱼实验模型建立第21-22页
        1.6.1 拟态弧菌培养及其浓度测定第21页
        1.6.2 草金鱼的饲养第21页
        1.6.3 感染途径的选择第21-22页
        1.6.4 拟态弧菌对草金鱼最小致死量测定第22页
        1.6.5 拟态弧菌人工感染草金鱼及样品采集与保存第22页
    1.7 拟态弧菌感染鱼肠黏膜组织差异蛋白组学分析第22-27页
        1.7.1 鱼类肠黏膜组织蛋白提取方法建立第22-23页
        1.7.2 感染前后肠黏膜组织总蛋白的提取与浓度测定第23-24页
        1.7.3 肠黏膜组织总蛋白的双向电泳分离第24-26页
        1.7.4 凝胶染色、扫描及图像分析第26页
        1.7.5 差异蛋白质点的酶解及MOLDI-TOF-MS鉴定第26页
        1.7.6 差异表达蛋白的 GO 功能注释与 Pathway 通路富集分析第26-27页
        1.7.7 差异表达蛋白的互作网络分析第27页
    1.8 拟态弧菌 OmpU 蛋白在肠黏膜组织中互作蛋白的筛选鉴定第27-29页
        1.8.1 His-Omp U融合蛋白的诱导表达与纯化第27页
        1.8.2 肠黏膜组织总蛋白的提取与浓度测定第27页
        1.8.3 His-tag pull down 筛选 Omp U 黏附素互作蛋白第27-28页
        1.8.4 SDS-PAGE分离蛋白第28页
        1.8.5 互作蛋白的液质联用质谱鉴定第28页
        1.8.6 液质联用质谱鉴定数据分析与互作蛋白确定第28-29页
2 结果与分析第29-48页
    2.1 拟态弧菌感染草金鱼模型的建立第29页
    2.2 草金鱼感染后的发病情况及样品采集与保存第29-30页
    2.3 肠黏膜组织蛋白的最佳提取方法第30页
    2.4 感染前后肠黏膜组织总蛋白的 2-D凝胶电泳图谱比较分析第30-31页
    2.5 差异蛋白点的质谱鉴定第31-32页
    2.6 差异蛋白的GO功能注释分析第32-34页
    2.7 差异蛋白的Pathway通路分析第34-44页
    2.8 差异表达蛋白的互作网络分析第44页
    2.9 His-Omp U融合蛋白的诱导表达与纯化第44-45页
    2.10 Omp U蛋白互作蛋白条带的筛选第45页
    2.11 互作蛋白的液质联用质谱鉴定结果第45-46页
    2.12 互作蛋白的GO功能注释分析第46-48页
3 讨论第48-52页
    3.1 双向凝胶电泳体系的优化第48-49页
    3.2 感染前后肠黏膜组织差异蛋白组的鉴定与生物信息学分析第49-50页
    3.3 肠黏膜组织中Omp U互作蛋白的分析第50-52页
结论第52-53页
参考文献第53-58页
附录第58-64页
致谢第64-65页
作者简介第65页

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