| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 结核分枝杆菌简介 | 第10页 |
| 1.2 结核分枝杆菌分泌蛋白简介 | 第10-11页 |
| 1.3 结核分枝杆菌分泌蛋白研究现状 | 第11-13页 |
| 1.4 论文主要内容 | 第13-14页 |
| 第二章 数据来源与处理方法 | 第14-19页 |
| 2.1 数据来源 | 第14页 |
| 2.2 数据预处理 | 第14-18页 |
| 2.2.1 BLAST软件介绍 | 第15页 |
| 2.2.2 CD-HIT软件介绍 | 第15-18页 |
| 2.3 小结 | 第18-19页 |
| 第三章 特征提取方法 | 第19-25页 |
| 3.1 特征提取 | 第19-24页 |
| 3.1.1 氨基酸频率特征 | 第19-20页 |
| 3.1.2 伴有g-gapped二肽的伪氨基酸组分 | 第20-23页 |
| 3.1.3 蛋白质的物化性质参数：亲水性和疏水性 | 第23-24页 |
| 3.2 小结 | 第24-25页 |
| 第四章 模型构建与评价体系 | 第25-33页 |
| 4.1 分类算法 | 第25-30页 |
| 4.1.1 支持向量机简介 | 第25-27页 |
| 4.1.2 LIBSVM软件包的使用流程 | 第27-30页 |
| 4.2 分类结果的评价体系 | 第30-31页 |
| 4.2.1 灵敏度、特异度、平均准确度 | 第30-31页 |
| 4.2.3 ROC曲线 | 第31页 |
| 4.3 模型的验证方法 | 第31-32页 |
| 4.4 小结 | 第32-33页 |
| 第五章 结果与讨论 | 第33-46页 |
| 5.1 结核分枝杆菌分泌蛋白的预测结果 | 第33-36页 |
| 5.1.1 参数寻优方法与结果 | 第33-34页 |
| 5.1.2 特征选择方法与结果 | 第34-36页 |
| 5.2 预测结果分析 | 第36-41页 |
| 5.2.1 与其他算法比较 | 第36-41页 |
| 5.3 在线服务软件介绍 | 第41-44页 |
| 5.4 在线服务的应用范例与分析 | 第44-45页 |
| 5.5 小结 | 第45-46页 |
| 第六章 总结与展望 | 第46-49页 |
| 6.1 本文工作总结 | 第46-47页 |
| 6.2 未来工作展望 | 第47-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-56页 |
| 攻读硕士期间研究成果 | 第56-57页 |