| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-29页 |
| 1.1 引言 | 第12-13页 |
| 1.2 微生物耐盐机制的研究进展 | 第13-21页 |
| 1.2.1 微生物渗透保护机制 | 第14-19页 |
| 1.2.2 微生物渗透感应及调节 | 第19-21页 |
| 1.3 细菌转录组学研究的进展 | 第21-25页 |
| 1.3.1 RNA-Seq技术应用及进展 | 第21-23页 |
| 1.3.2 细菌耐盐转录组学的研究进展 | 第23-24页 |
| 1.3.3 根瘤菌耐盐转录组学的研究进展 | 第24-25页 |
| 1.4 利用根瘤菌提高豆科植物抗逆性 | 第25-27页 |
| 1.5 选题依据及研究内容 | 第27-29页 |
| 1.5.1 本文选题依据 | 第27页 |
| 1.5.2 本文研究内容 | 第27页 |
| 1.5.3 本文技术路线 | 第27-29页 |
| 第二章 RNA-Seq测序及转录组分析 | 第29-52页 |
| 2.1 前言 | 第29页 |
| 2.2 实验材料及仪器 | 第29-30页 |
| 2.2.1 菌株及培养基 | 第29页 |
| 2.2.2 主要仪器设备及试剂 | 第29-30页 |
| 2.3 实验方法 | 第30-34页 |
| 2.3.1 供试菌株的纯化及检测 | 第30页 |
| 2.3.2 M.alhagi CCNWXJ12-2~T生长曲线测定 | 第30-31页 |
| 2.3.3 M.alhagi CCNWXJ12-2~T RNA提取 | 第31页 |
| 2.3.4 M.alhagi CCNWXJ12-2~T RNA质量检测 | 第31-32页 |
| 2.3.5 M.alhagi CCNWXJ12-2~T转录组测序及分析 | 第32-34页 |
| 2.4 结果与分析 | 第34-50页 |
| 2.4.1 菌株纯化检测 | 第34页 |
| 2.4.2 生长曲线测定 | 第34-35页 |
| 2.4.3 RNA样品制备及检测 | 第35-37页 |
| 2.4.4 转录组测序结果 | 第37-49页 |
| 2.4.5 测序结果验证 | 第49-50页 |
| 2.5 讨论 | 第50-52页 |
| 第三章 proVWX对M.alhagi CCNWXJ12-2~T抗逆性的影响 | 第52-62页 |
| 3.1 前言 | 第52页 |
| 3.2 实验材料及仪器 | 第52-54页 |
| 3.2.1 菌株及培养基 | 第52-53页 |
| 3.2.2 实验所用酶及试剂 | 第53-54页 |
| 3.2.3 主要仪器设备 | 第54页 |
| 3.3 实验方法 | 第54-56页 |
| 3.3.1 基因组DNA提取 | 第54页 |
| 3.3.2 基因敲除载体构建 | 第54-55页 |
| 3.3.3 根瘤菌基因敲除流程 | 第55-56页 |
| 3.3.4 突变体表型检测 | 第56页 |
| 3.4 结果与分析 | 第56-60页 |
| 3.4.1 M.alhagi CCNWXJ12-2~T中的GB/Proline转运系统 | 第56-57页 |
| 3.4.2 基因敲除载体构建 | 第57-58页 |
| 3.4.3 GB转运系统敲除结果 | 第58-59页 |
| 3.4.4 突变体表型检测结果 | 第59-60页 |
| 3.5 讨论 | 第60-62页 |
| 第四章 prkA对M.alhagi CCNWXJ12-2~T抗逆性的影响 | 第62-73页 |
| 4.1 前言 | 第62页 |
| 4.2 实验材料及仪器 | 第62-63页 |
| 4.2.1 菌株及培养基 | 第62-63页 |
| 4.2.2 实验所用酶及试剂 | 第63页 |
| 4.2.3 主要仪器设备 | 第63页 |
| 4.3 实验方法 | 第63-65页 |
| 4.3.1 基因组DNA提取 | 第63页 |
| 4.3.2 基因敲除及互补载体构建 | 第63-64页 |
| 4.3.3 根瘤菌基因敲除及互补实验流程 | 第64页 |
| 4.3.4 突变体表型检测 | 第64-65页 |
| 4.3.5 抗氧化酶基因表达差异 | 第65页 |
| 4.4 结果与分析 | 第65-71页 |
| 4.4.1 M.alhagi CCNWXJ12-2~T中的prkA | 第65-66页 |
| 4.4.2 基因敲除载体及互补载体构建 | 第66-67页 |
| 4.4.3 prkA基因敲除及突变体互补结果 | 第67页 |
| 4.4.4 突变体表型检测结果 | 第67-70页 |
| 4.4.5 抗氧化酶基因实时定量检测结果 | 第70-71页 |
| 4.5 讨论 | 第71-73页 |
| 第五章 T3SS对M.alhagi CCNWXJ12-2~T抗逆性的影响 | 第73-87页 |
| 5.1 前言 | 第73页 |
| 5.2 实验材料及仪器 | 第73-74页 |
| 5.2.1 菌株及培养基 | 第73-74页 |
| 5.2.2 实验所用酶及试剂 | 第74页 |
| 5.2.3 主要仪器设备 | 第74页 |
| 5.3 实验方法 | 第74-76页 |
| 5.3.1 基因组DNA提取 | 第74-75页 |
| 5.3.2 载体构建 | 第75-76页 |
| 5.3.3 突变体，互补菌，启动子检测菌株构建流程 | 第76页 |
| 5.3.4 突变体表型检测 | 第76页 |
| 5.3.5 启动子活性检测 | 第76页 |
| 5.4 结果与分析 | 第76-85页 |
| 5.4.1 M.alhagi CCNWXJ12-2~T中的T3SSs | 第76-77页 |
| 5.4.2 载体构建 | 第77-80页 |
| 5.4.3 突变体，互补菌，启动子检测菌株筛选结果 | 第80-81页 |
| 5.4.4 突变体表型检测结果 | 第81-84页 |
| 5.4.5 启动子活性检测结果 | 第84-85页 |
| 5.5 讨论 | 第85-87页 |
| 第六章 结论与创新 | 第87-89页 |
| 6.1 结论 | 第87-88页 |
| 6.1.1 不同条件下M.alhagi CCNWXJ12-2~T的转录组差异 | 第87页 |
| 6.1.2 proVWX对M.alhagi CCNWXJ12-2~T的耐盐性没有影响 | 第87页 |
| 6.1.3 prkA对M.alhagi CCNWXJ12-2~T的耐盐性有抑制作用 | 第87-88页 |
| 6.1.4 T3SS1对M.alhagi CCNWXJ12-2~T抗逆性的影响 | 第88页 |
| 6.2 创新点 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-101页 |
| 附录 | 第101-115页 |
| 缩略词(Abbreviations） | 第115-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 作者简介 | 第117页 |
