| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-9页 |
| 英文缩略词 | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-28页 |
| ·犬肛周腺的介绍 | 第10-13页 |
| ·犬肛周腺肿瘤的介绍 | 第11页 |
| ·犬肛周腺肿瘤分型 | 第11-12页 |
| ·犬肛周肿瘤的临床诊断 | 第12-13页 |
| ·肛周腺肿瘤的治疗 | 第13页 |
| ·犬肛周腺肿瘤发病原因 | 第13-14页 |
| ·犬肛周腺瘤研究进展 | 第14-18页 |
| ·肿瘤分子标记物研究进展 | 第14-16页 |
| ·非编码RNA研究进展 | 第16-17页 |
| ·紧密连接蛋白(Claudins,CLDNs)研究进展 | 第17-18页 |
| ·犬肿瘤的转录组分析方法 | 第18-26页 |
| ·表达序列标签(Expressed Sequence tags,EST) | 第19页 |
| ·基因表达序列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE) | 第19-20页 |
| ·DNA微阵列(DNA microarray) | 第20-22页 |
| ·RNA测序技术(RNA-seq) | 第22-25页 |
| ·转录组研究方法的比较 | 第25-26页 |
| ·研究目的与意义 | 第26-27页 |
| ·实验技术路线 | 第27-28页 |
| 第二章 应用高通量测序技术对犬肛周腺瘤转录组的研究 | 第28-68页 |
| ·试验材料 | 第28-33页 |
| ·试验动物及样品采集 | 第28页 |
| ·样本的组织病理学鉴定 | 第28-31页 |
| ·石蜡切片主要试剂与仪器 | 第31-32页 |
| ·测序用主要试剂 | 第32页 |
| ·实验设备 | 第32页 |
| ·溶液配制 | 第32-33页 |
| ·试验方法 | 第33-39页 |
| ·总RNA提取 | 第33页 |
| ·测序文库的建立 | 第33-36页 |
| ·测序 | 第36-37页 |
| ·测序数据的处理 | 第37-38页 |
| ·转录本表达水平的确定及标准化 | 第38页 |
| ·差异表达转录本、新转录本,可变剪切以及SNP/InDel的鉴定 | 第38-39页 |
| ·差异表达基因GO富集分析 | 第39页 |
| ·差异表达基因KEGG富集分析 | 第39页 |
| ·结果与分析 | 第39-62页 |
| ·样品的分类及RNA质量检测结果 | 第39-41页 |
| ·Reads数据质量统计 | 第41-42页 |
| ·基因表达及差异分析 | 第42-47页 |
| ·差异基因表达基因GO及KEGG富集分析 | 第47-61页 |
| ·插入/缺失的筛查 | 第61-62页 |
| ·可变剪切的筛查 | 第62页 |
| ·讨论 | 第62-68页 |
| ·MMP-1(基质金属蛋白酶-1)在肛周腺肿瘤和正常组织中的差异表达 | 第62-63页 |
| ·FGF(成纤维细胞生长因子)在肛周腺肿瘤和正常组织中的差异表达 | 第63-64页 |
| ·KEGG富集通路中与肛周腺肿瘤发生的关系 | 第64-65页 |
| ·非编码RNA与肛周腺肿瘤 | 第65-66页 |
| ·H19基因与肛周腺肿瘤的关系 | 第66-67页 |
| ·Ig lambda链基因与肿瘤免疫 | 第67-68页 |
| 第三章 实时定量PCR对犬肛周腺肿瘤转录组差异基因的验证 | 第68-73页 |
| ·材料和方法 | 第68-70页 |
| ·样品收集 | 第68页 |
| ·试验用品与设备 | 第68页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第68-70页 |
| ·结果 | 第70-71页 |
| ·讨论 | 第71-73页 |
| 第四章 差异表达基因的免疫组化研究 | 第73-85页 |
| ·免疫组化切片材料 | 第73页 |
| ·主要试剂 | 第73-74页 |
| ·主要仪器与耗材 | 第74页 |
| ·主要仪器 | 第74页 |
| ·主要耗材 | 第74页 |
| ·主要试剂配制 | 第74-75页 |
| ·免疫组织化学切片制作方法 | 第75页 |
| ·切片观察 | 第75-76页 |
| ·结果 | 第76-83页 |
| ·讨论 | 第83-85页 |
| 总结 | 第85-88页 |
| 1 结论 | 第85-86页 |
| 2 创新点 | 第86页 |
| 3 未来研究方向 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-100页 |
| 附录 | 第100-108页 |
| 致谢 | 第108-110页 |
| 作者简历 | 第110-111页 |
