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丛枝菌根真菌钙信号相关基因的研究

Table of Contents第1-8页
摘要第8-9页
Abstract第9-10页
Abbreviations第10-11页
Chapter 1 General Introduction第11-26页
     ·The arbuscular mycorrhiza symbiosis第12-15页
       ·AM developmental stages第12-15页
     ·Molecular mechanisms regulating the AM symbiosis第15-19页
       ·Recognition and exchange of molecular signals for symbiosis establishment第15-16页
       ·Symbiosis-related transcriptional changes during AM formation第16-19页
     ·Calcium-regulated signalling events in cells第19-25页
     ·Ca~(2+) flux in organelles第20-23页
       ·Ca~(2+) related gene expression related to AM establishment第23-24页
       ·Ca~(2+) involvement in plant-biotrophic pathogen interactions第24-25页
     ·Thesis objectives第25-26页
Chapter 2 Material and Methods第26-50页
     ·Biological materials and growth conditions第27-31页
       ·Astragalus sinicus L.+Glomus mosseae(EG225)第27-28页
       ·Medicago truncatula+Glomus intraradices DAOM197198(syn.Rhizophagus irregularis Blaszk.,Wubet,Renker & Buscot)第28-29页
       ·Medicago truncatula+Glomus intraradices BEG141第29-30页
       ·Pisum sativum L.+Glomus intraradices BEG141第30-31页
     ·Estimation of mycorrhizal root colonization第31-32页
     ·Laser Capture Microdissection(LCM) of arbuscule-containing cortical root cells第32-33页
       ·Tissue preparation第32页
       ·Dissection of arbuscule-containing cells第32页
       ·RNA extraction from laser-dissected cells第32-33页
       ·One-step RT-PCR第33页
     ·Nucleic acid preparation from spores and roots第33-35页
       ·RNA extraction第33-34页
       ·cDNA synthesis第34-35页
     ·Genomic DNA extraction from fungal spores第35页
       ·Plasmid DNA preparation第35页
     ·Fungal gene selection and primer design第35-39页
       ·Gene selection第35-37页
       ·Primer design第37-39页
     ·Polymerase chain reaction (PCR)第39-44页
       ·Reverse-transcription (RT-PCR)第39页
       ·Relative quantitative real-time PCR第39-40页
       ·Absolute quantitative real-time PCR第40-41页
       ·In situ RT-PCR第41-42页
       ·Rapid Amplification of cDNA Ends (RACE)第42-44页
     ·PCR amplification on genomic DNA第44-47页
       ·Inverse PCR第45-46页
       ·TAIL-PCR第46-47页
     ·Yeast complementation第47-49页
       ·Yeast strains第47-48页
       ·Plasmid construction and yeast transformation第48-49页
       ·Growth media and tests第49页
     ·Statistical analysis第49-50页
Chapter 3 Studies of G. mosseae genes expressed before root contact with A. sinicum第50-59页
     ·Fungal gene expression monitored by reverse-transcription (RT)-PCR第51-52页
     ·Full length gene sequences and analyses第52-55页
     ·Localization of G. mosseae Gm152 gene activity in mycorrhizal roots of A. sinicus第55-57页
     ·Discussion and conclusions第57-59页
Chapter 4 Growth and mycorrhiza development in wild-type and mycorrhiza-defective mutantplants第59-65页
     ·Medicago truncatula wild-type J5 and the mutant TRV25第60-62页
     ·Wild type Pisum sativum L. cv Finale and the mutant Pssym36第62-63页
     ·Discussion and conclusions第63-65页
Chapter 5 Selection of G. intraradices genes related to calcium homeostasis and signalling inarbuscular mycorrhiza interactions第65-75页
     ·Homology searches and primer design for fungal genes based on selected ESTs in G. intraradices DAOM 197198 (syn. R. irregularis)第66-70页
     ·Fungal gene expression monitored by reverse-transcription (RT)-PCR第70-74页
       ·Gene expression in G. intraradices DAOM197198 spores and mycorrhizal roots of M. truncatula第70-74页
     ·Discussion and conclusions第74-75页
Chapter 6 Expression of G. intraradices genes encoding Ca~(2+))-related proteins in interactions withwild-type or Myc-mutant roots of Medicago truncatula第75-87页
     ·Relative quantitative Real-time RT-PCR第76-81页
     ·Gene expression in G. intraradices DAOM197198 spores and mycorrhizal M. truncatula roots第76页
     ·Gene expression in G. intraradices BEG141 spores第76-77页
     ·Gene expression in G. intraradices BEG141 associated with wild-type and mutant M. truncatula roots第77-81页
     ·Absolute quantitative Real-time RT-PCR第81-83页
     ·Discussion and conclusions第83-87页
Chapter 7 Localization of gene activity in G. intraradices during presymbiotic stages anddevelopment with roots第87-96页
     ·In situ RT-PCR第88-89页
     ·Laser cryo-microdissection第89-91页
     ·G. intraradices gene expression in P. sativum L. wild-type and mutant genotypes第91-94页
     ·Discussion and conclusions第94-96页
Chapter 8 Functional characterization of three G. intraradices BEG141 genes第96-110页
     ·Full length gene sequencing and phylogenetic analyses第97-101页
     ·Yeast complementation assays第101-108页
       ·Growth tests第101-102页
     ·Complementation of vcx1 mutants第102-103页
     ·Complementation of a pmr1 mutant第103-108页
     ·Discussion and conclusions第108-110页
Chapter 9 General discussion and conclusions第110-119页
References第119-129页
Appendix第129-131页
Acknowledgements第131页

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