| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-15页 |
| ·研究背景及意义 | 第9页 |
| ·国内外研究现状 | 第9-10页 |
| ·分子生物学基础知识 | 第10-14页 |
| ·本文的主要工作及结构安排 | 第14-15页 |
| 2 生物序列比较算法的研究概述 | 第15-25页 |
| ·比对算法 | 第15-18页 |
| ·双序列比对 | 第16-17页 |
| ·多序列比对 | 第17-18页 |
| ·非比对算法 | 第18-23页 |
| ·字统计模型 | 第19-21页 |
| ·几何图形法 | 第21-23页 |
| ·本章小结 | 第23-25页 |
| 3 基于 LZ-WORD 分布的序列比较算法 | 第25-42页 |
| ·引言 | 第25页 |
| ·LZ 复杂度算法 | 第25-28页 |
| ·算法设计 | 第25-26页 |
| ·相似性度量 | 第26-28页 |
| ·改进的 LZ 复杂度算法 | 第28-31页 |
| ·改进的算法设计 | 第28页 |
| ·基于改进算法的相似性度量 | 第28-31页 |
| ·结果与讨论 | 第31-40页 |
| ·LZ-WORD 与 RLZ-WORD 的分布比较 | 第31-33页 |
| ·分割方法对度量效率的影响 | 第33-38页 |
| ·冠状病毒的进化分析 | 第38-40页 |
| ·本章小结 | 第40-42页 |
| 4 基于相关矩阵和马尔可夫模型的序列比较算法 | 第42-53页 |
| ·引言 | 第42页 |
| ·马尔可夫模型 | 第42-43页 |
| ·特定核苷酸的局部信息描述模型 | 第43-45页 |
| ·DNA 相关矩阵的构建 | 第44-45页 |
| ·碱基分布的均匀性度量 | 第45页 |
| ·混合 模型的构建 | 第45-46页 |
| ·结果与讨论 | 第46-51页 |
| ·物种 1 号染色体碱基分布的均匀性分析 | 第46-47页 |
| ·人类编码与非编码序列碱基分布的均匀性分析 | 第47-50页 |
| ·进化分析 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 5 总结与展望 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 攻读学位期间研究成果 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |