中国农业科学院博士学位论文评阅人、答辩委员会签名表 | 第1-5页 |
摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-15页 |
英文缩略表 | 第15-16页 |
第一章 引言 | 第16-36页 |
·小麦条锈病的发生与危害 | 第16-18页 |
·小麦条锈病起源 | 第16页 |
·小麦条锈病菌生物学特性 | 第16页 |
·小麦条锈病症状 | 第16-17页 |
·小麦条锈病的危害 | 第17-18页 |
·小麦条锈病防治策略 | 第18页 |
·小麦抗条锈病遗传研究进展 | 第18-33页 |
·小麦抗条锈病遗传研究历史 | 第18-21页 |
·小麦抗条锈病遗传研究现状 | 第21-23页 |
·小麦抗条锈病遗传研究方法 | 第23-33页 |
·小麦条锈菌鉴别寄主抗性遗传研究历史及现状 | 第33-35页 |
·研究目的和意义 | 第35-36页 |
第二章 尤皮Ⅱ号抗条锈病基因的分子标记筛选及定位 | 第36-66页 |
·材料 | 第36-39页 |
·供试小麦材料 | 第36-37页 |
·遗传分析的供试条锈菌系及繁殖 | 第37页 |
·目的基因精细定位群体的构建 | 第37-39页 |
·主要仪器设备 | 第39页 |
·酶及生化试剂 | 第39-40页 |
·方法 | 第40-46页 |
·DNA 的提取 | 第40-41页 |
·PCR 扩增反应 | 第41-43页 |
·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析 | 第43-44页 |
·基因型记录 | 第44页 |
·基因型统计及遗传距离计算 | 第44-45页 |
·目的基因 SSR 标记的遗传连锁性分析 | 第45页 |
·目的基因的 SSR 标记定位 | 第45页 |
·尤皮Ⅱ号携带抗条锈病基因可传递性验证 | 第45-46页 |
·结果与分析 | 第46-61页 |
·小麦抗条锈性的遗传连锁性分析及目的基因的标记定位 | 第46-57页 |
·目的基因的 SSR 标记定位 | 第57-58页 |
·铭贤 169*6/YrJu4 与铭贤 169 杂交的 F2代基因精细定位遗传群体的构建 | 第58-60页 |
·尤皮Ⅱ号携带抗条锈病基因可传递性验证 | 第60-61页 |
·小结 | 第61-62页 |
·鉴别寄主尤皮Ⅱ号抗条锈病基因 YrJu4 的标记定位 | 第61页 |
·铭贤 169*6/YrJu4 与铭贤 169 杂交组合 F2代基因精细定位群体构建 | 第61-62页 |
·讨论 | 第62-66页 |
·尤皮Ⅱ号抗条锈病基因 YrJu4 的标记定位 | 第62页 |
·尤皮Ⅱ号抗条锈病基因 YrJu4 按国际标准命名的重要性 | 第62-63页 |
·标记筛选所用材料的选择 | 第63页 |
·尤皮Ⅱ号携带抗条锈病基因可传递性验证 | 第63-64页 |
·小麦与水稻基因组的共线性研究 | 第64页 |
·目的基因显隐性变化原因分析 | 第64-66页 |
第三章 基于 RNA-seq 技术的转录组测序及基因表达差异分析 | 第66-98页 |
·供试材料准备 | 第66页 |
·供试小麦材料的准备 | 第66页 |
·供试条锈菌生理小种的准备 | 第66页 |
·实验所用仪器和试剂 | 第66-67页 |
·主要仪器 | 第66页 |
·主要试剂 | 第66-67页 |
·方法 | 第67-71页 |
·Total RNA 的提取 | 第67页 |
·Total RNA 的质检 | 第67-68页 |
·转录组文库的制备 | 第68-71页 |
·文库的质检 | 第71页 |
·转录组数据的处理 | 第71-74页 |
·转录组数据处理及质控 | 第71页 |
·Reads 污染检测 | 第71页 |
·Reads 的 de novo 拼接 | 第71-72页 |
·Unigene 的注释 | 第72-73页 |
·unigene 表达丰度计算及不同组差异比较 | 第73页 |
·差异表达 unigene 的富集分析 | 第73页 |
·铭贤 169 和近等基因系 N9 不同时间点表达差异分析 | 第73-74页 |
·结果与分析 | 第74-94页 |
·Total RNA 的提取 | 第74-75页 |
·转录组测序数据处理 | 第75-94页 |
·小结 | 第94-95页 |
·转录组测序数据处理 | 第94页 |
·铭贤 169 和近等基因系 169*6/YrJu4 表达差异分析 | 第94-95页 |
·讨论 | 第95-98页 |
·铭贤 169*6/YrJu4 与铭贤 169 的基因表达在 GO 库和 KEGG 库的富集对比 | 第95-96页 |
·铭贤 169*6/YrJu4 与铭贤 169 在不同时间点的基因表达差异 | 第96页 |
·本研究测序结果与近缘物种测序结果的比较 | 第96-97页 |
·取样时间点的选择 | 第97-98页 |
第四章 全文结论 | 第98-99页 |
·尤皮Ⅱ号抗条锈病基因的 SSR 分子标记筛选 | 第98页 |
·近等基因系铭贤 169*6/YrJu4 精细定位群体遗传分析 | 第98页 |
·基于 RNA-seq 技术的转录组测序及基因表达差异分析 | 第98-99页 |
参考文献 | 第99-114页 |
附录 | 第114-141页 |
致谢 | 第141-142页 |
作者简历 | 第142页 |