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小麦条锈菌中国鉴别寄主尤皮Ⅱ号抗条锈病基因的精细定位

中国农业科学院博士学位论文评阅人、答辩委员会签名表第1-5页
摘要第5-7页
Abstract第7-15页
英文缩略表第15-16页
第一章 引言第16-36页
   ·小麦条锈病的发生与危害第16-18页
     ·小麦条锈病起源第16页
     ·小麦条锈病菌生物学特性第16页
     ·小麦条锈病症状第16-17页
     ·小麦条锈病的危害第17-18页
     ·小麦条锈病防治策略第18页
   ·小麦抗条锈病遗传研究进展第18-33页
     ·小麦抗条锈病遗传研究历史第18-21页
     ·小麦抗条锈病遗传研究现状第21-23页
     ·小麦抗条锈病遗传研究方法第23-33页
   ·小麦条锈菌鉴别寄主抗性遗传研究历史及现状第33-35页
   ·研究目的和意义第35-36页
第二章 尤皮Ⅱ号抗条锈病基因的分子标记筛选及定位第36-66页
   ·材料第36-39页
     ·供试小麦材料第36-37页
     ·遗传分析的供试条锈菌系及繁殖第37页
     ·目的基因精细定位群体的构建第37-39页
   ·主要仪器设备第39页
   ·酶及生化试剂第39-40页
   ·方法第40-46页
     ·DNA 的提取第40-41页
     ·PCR 扩增反应第41-43页
     ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析第43-44页
     ·基因型记录第44页
     ·基因型统计及遗传距离计算第44-45页
     ·目的基因 SSR 标记的遗传连锁性分析第45页
     ·目的基因的 SSR 标记定位第45页
     ·尤皮Ⅱ号携带抗条锈病基因可传递性验证第45-46页
   ·结果与分析第46-61页
     ·小麦抗条锈性的遗传连锁性分析及目的基因的标记定位第46-57页
     ·目的基因的 SSR 标记定位第57-58页
     ·铭贤 169*6/YrJu4 与铭贤 169 杂交的 F2代基因精细定位遗传群体的构建第58-60页
     ·尤皮Ⅱ号携带抗条锈病基因可传递性验证第60-61页
   ·小结第61-62页
     ·鉴别寄主尤皮Ⅱ号抗条锈病基因 YrJu4 的标记定位第61页
     ·铭贤 169*6/YrJu4 与铭贤 169 杂交组合 F2代基因精细定位群体构建第61-62页
   ·讨论第62-66页
     ·尤皮Ⅱ号抗条锈病基因 YrJu4 的标记定位第62页
     ·尤皮Ⅱ号抗条锈病基因 YrJu4 按国际标准命名的重要性第62-63页
     ·标记筛选所用材料的选择第63页
     ·尤皮Ⅱ号携带抗条锈病基因可传递性验证第63-64页
     ·小麦与水稻基因组的共线性研究第64页
     ·目的基因显隐性变化原因分析第64-66页
第三章 基于 RNA-seq 技术的转录组测序及基因表达差异分析第66-98页
   ·供试材料准备第66页
     ·供试小麦材料的准备第66页
     ·供试条锈菌生理小种的准备第66页
   ·实验所用仪器和试剂第66-67页
     ·主要仪器第66页
     ·主要试剂第66-67页
   ·方法第67-71页
     ·Total RNA 的提取第67页
     ·Total RNA 的质检第67-68页
     ·转录组文库的制备第68-71页
     ·文库的质检第71页
   ·转录组数据的处理第71-74页
     ·转录组数据处理及质控第71页
     ·Reads 污染检测第71页
     ·Reads 的 de novo 拼接第71-72页
     ·Unigene 的注释第72-73页
     ·unigene 表达丰度计算及不同组差异比较第73页
     ·差异表达 unigene 的富集分析第73页
     ·铭贤 169 和近等基因系 N9 不同时间点表达差异分析第73-74页
   ·结果与分析第74-94页
     ·Total RNA 的提取第74-75页
     ·转录组测序数据处理第75-94页
   ·小结第94-95页
     ·转录组测序数据处理第94页
     ·铭贤 169 和近等基因系 169*6/YrJu4 表达差异分析第94-95页
   ·讨论第95-98页
     ·铭贤 169*6/YrJu4 与铭贤 169 的基因表达在 GO 库和 KEGG 库的富集对比第95-96页
     ·铭贤 169*6/YrJu4 与铭贤 169 在不同时间点的基因表达差异第96页
     ·本研究测序结果与近缘物种测序结果的比较第96-97页
     ·取样时间点的选择第97-98页
第四章 全文结论第98-99页
   ·尤皮Ⅱ号抗条锈病基因的 SSR 分子标记筛选第98页
   ·近等基因系铭贤 169*6/YrJu4 精细定位群体遗传分析第98页
   ·基于 RNA-seq 技术的转录组测序及基因表达差异分析第98-99页
参考文献第99-114页
附录第114-141页
致谢第141-142页
作者简历第142页

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