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禽类Piwill基因与piRNAs生物学功能的初步研究

中文摘要第1-7页
Abstract第7-12页
目录第12-15页
第一章 文献综述第15-39页
 1 Piwi基因的研究进展第15-22页
   ·Argonaute蛋白家族第15页
   ·Piwi基因的发现第15-16页
   ·Piwi基因的生物学功能第16-19页
   ·PIWI蛋白与非编码小RNA第19-22页
 2 鸡基因组转座子概述第22-24页
 3 禽类精子发生第24-25页
   ·禽类的生殖器官第24页
   ·精子发生第24-25页
 4 真核生物基因的转录调控研究第25-28页
   ·真核生物基因的转录调控元件第25-27页
   ·真核生物基因的转录调控研究第27-28页
 5 RNA干扰技术第28-31页
   ·RNAi的发现第29页
   ·RNAi的作用机制第29-30页
   ·RNAi技术第30-31页
 6 实时定量PCR技术第31-37页
   ·Real-Time qPCR的几个常用术语第32-34页
   ·Real-Time qPCR的检测方法第34-36页
   ·Real-Time qPCR的数据分析方法第36-37页
 7 本研究的目的和意义第37-39页
第二章 鸡Piwil1基因的克隆及其时空表达分析第39-61页
 1 引言第39页
 2 实验材料第39-40页
   ·实验动物第39页
   ·主要仪器第39页
   ·主要试剂第39-40页
 3 实验方法第40-50页
   ·样品采集与保存第40页
   ·鸡原始生殖细胞(PGCs)的分离与鉴定第40-41页
   ·鸡精原干细胞(SSCs)的分离与鉴定第41页
   ·鸡睾丸生精细胞的分离与鉴定第41页
   ·鸡成熟精子的纯化第41-42页
   ·基因组DNA提取与质量检测第42页
   ·性别鉴定第42-43页
   ·总RNA提取与质量检测第43页
   ·RT-PCR第43-44页
   ·TA克隆第44-45页
   ·RACE第45-47页
   ·Real-Time qPCR第47-48页
   ·生物信息学分析第48-49页
   ·数据分析第49-50页
 4 结果与分析第50-59页
   ·鸡PGCs的鉴定结果第50页
   ·鸡SSCs的鉴定结果第50-51页
   ·鸡睾丸精原(母)细胞的鉴定结果第51-52页
   ·鸡Piwil1基因的克隆及其生物信息学分析第52-54页
   ·鸡Piwil1基因的组织、细胞表达特异性第54-56页
   ·Piwil1基因在狼山鸡不同发育阶段不同组织的表达量分析第56-58页
   ·Piwil1基因在狼山鸡胚胎期性腺组织中的表达量分析第58-59页
 5 讨论第59-61页
第三章 鸡Piwil1基因的转录调控分析第61-74页
 1 引言第61页
 2 实验材料第61-62页
   ·实验动物第61页
   ·主要仪器第61页
   ·主要试剂第61-62页
 3 实验方法第62-67页
   ·基因组DNA提取与质量检测第62页
   ·Piwil1基因启动子区系列缺失片段的扩增第62-63页
   ·克隆测序第63页
   ·Piwil1基因启动子区系列缺失片段表达载体的构建第63-65页
   ·定点突变表达载体的构建第65-66页
   ·无内毒素质粒的提取第66页
   ·细胞转染第66-67页
   ·荧光素酶活性检测第67页
   ·数据处理第67页
 4 结果与分析第67-72页
   ·Piwil1基因启动子区系列缺失片段表达载体的鉴定第67-68页
   ·细胞转染条件的优化第68-70页
   ·Piwil1基因启动子活性分析第70页
   ·CCAAT box和TCCC box转录元件的定点突变分析第70-72页
 5 讨论第72-74页
第四章 体外抑制鸡Piwil1基因的表达对转座子活性的影响第74-97页
 1 引言第74页
 2 实验材料第74-75页
   ·实验动物第74页
   ·主要仪器第74页
   ·主要试剂第74-75页
 3 实验方法第75-86页
   ·pcDNA3.1(+)-Piwil1表达载体的构建第75页
   ·Piwil1基因shRNA干扰表达载体的构建第75-77页
   ·Piwil1基因miRNA干扰慢病毒表达载体的构建第77-81页
   ·无内毒素质粒的提取第81页
   ·慢病毒包装第81-82页
   ·慢病毒滴度测定第82页
   ·miRNA干扰质粒和高表达质粒共转染HEK293细胞第82-83页
   ·质粒转染及慢病毒侵染HEK293细胞第83页
   ·shRNA干扰质粒瞬时转染鸡PGCs细胞第83页
   ·Western Blot检测第83-85页
   ·细胞间接免疫荧光检测第85页
   ·Real-Time qPCR第85-86页
   ·数据分析第86页
 4 结果与分析第86-94页
   ·pcDNA3.1(+)-Piwil1表达载体的鉴定第86页
   ·PIWIL1蛋白的细胞内表达第86-88页
   ·miRNA干扰表达载体干扰效果的筛选第88-90页
   ·慢病毒包装与滴度测定第90-92页
   ·慢病毒干扰效果的初步验证第92页
   ·体外抑制鸡Piwil1基因的表达对CR1转座子活性的影响第92-94页
 5 讨论第94-97页
第五章 鹌鹑Piwil1基因克隆和piRNAs的表达谱研究第97-114页
 1 引言第97页
 2 实验材料第97-98页
   ·实验动物第97页
   ·主要仪器第97页
   ·主要试剂第97-98页
 3 实验方法第98-103页
   ·样品采集与保存第98页
   ·总RNA提取与质量检测第98页
   ·RT-PCR第98页
   ·RACE第98页
   ·Northern Blot检测第98-101页
   ·Western Blot检测第101页
   ·免疫沉淀反应第101-102页
   ·Small RNA cDNA文库的制备与Solexa测序第102-103页
   ·生物信息学分析第103页
 4 结果与分析第103-112页
   ·鹌鹑Piwil1基因的克隆与生物信息学分析第103-105页
   ·鹌鹑Piwil1基因的组织表达特异性第105-106页
   ·Small RNAs深度测序数据概述第106-108页
   ·piRNAs比对分析第108-112页
 5 讨论第112-114页
全文结论第114-115页
参考文献第115-128页
致谢第128-129页
攻读学位期间发表的学术论文目录第129-131页

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