基于全基因组关联研究技术筛选鸡产肉和肉品质性状相关候选基因
| 中文摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 符号说明 | 第9-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-29页 |
| 1 肉品质性状的分子机制及分子营养研究进展 | 第11-13页 |
| ·肉品质性状形成的分子机制 | 第11-12页 |
| ·肉品质性状的分子营养研究进展 | 第12-13页 |
| 2 鸡基因定位技术的发展 | 第13-14页 |
| ·连锁分析 | 第13-14页 |
| ·关联分析 | 第14页 |
| 3 产肉和肉品质性状QTL定位研究进展 | 第14-19页 |
| ·产肉性状QTL定位研究进展 | 第15-16页 |
| ·脂肪性状QTL定位研究进展 | 第16-17页 |
| ·肉品质性状QTL定位研究进展 | 第17-19页 |
| 4 全基因组关联研究(GWAS)研究进展 | 第19-27页 |
| ·GWAS分析方法 | 第20-24页 |
| ·试验群体和群体分层 | 第20-21页 |
| ·样本和表型 | 第21-22页 |
| ·SNP基因分型芯片 | 第22-24页 |
| ·鸡重要性状的GWAS研究进展 | 第24-25页 |
| ·后GWAS分析策略 | 第25-27页 |
| 5 本研究目的、意义和技术路线 | 第27-29页 |
| ·研究目的与意义 | 第27-28页 |
| ·技术路线 | 第28-29页 |
| 第二章 材料与方法 | 第29-38页 |
| 1 试验材料 | 第29-31页 |
| ·试验动物 | 第29页 |
| ·主要试剂与溶液配制 | 第29-30页 |
| ·主要的仪器设备 | 第30-31页 |
| 2 试验方法 | 第31-38页 |
| ·组织样本采集与保存 | 第31-34页 |
| ·SNP分型及其质量控制 | 第34页 |
| ·数据处理与关联研究 | 第34-36页 |
| ·荧光定量验证GWAS结果 | 第36-38页 |
| 第三章 结果与分析 | 第38-73页 |
| 1 鸡产肉和肉品质性状表型数据的分析结果 | 第38-41页 |
| ·描述性统计 | 第38页 |
| ·正态性检验 | 第38-41页 |
| 2 基因组DNA检测结果 | 第41-42页 |
| 3 SNP的分型及质量控制 | 第42-43页 |
| 4 群体结构 | 第43-44页 |
| 5 全基因组关联分析结果 | 第44-73页 |
| ·鸡产肉性状的全基因组关联研究结果 | 第46-58页 |
| ·鸡肉品质性状的全基因组关联研究结果 | 第58-67页 |
| ·GWAS中候选基因的荧光定量验证 | 第67-73页 |
| 第四章 讨论 | 第73-80页 |
| 1 CAAS鸡F2资源群体 | 第73页 |
| 2 群体分层的校正 | 第73-74页 |
| 3 GWAS和荧光定量结果的讨论 | 第74-80页 |
| ·产肉性状 | 第74-76页 |
| ·肉品质性状 | 第76-80页 |
| 第五章 结论 | 第80-81页 |
| 1 结论 | 第80页 |
| 2 创新点 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 附录 | 第96-103页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第103-104页 |
