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靶向基因shRNA干扰家蚕及猪若干病毒的复制和增殖研究

摘要第1-19页
Abstract第19-21页
主要英文縮写与译名第21-22页
第一章 文献综述第22-59页
 1 猪圆环病毒第22-32页
   ·猪圆环病毒的发现第22-24页
   ·猪圆环病毒的形态学和理化性质第24-25页
   ·猪圆环病毒的基因组结构及其编码蛋白第25-29页
     ·Rep蛋白第27-28页
     ·Cap蛋白第28页
     ·ORF3蛋白第28-29页
     ·其他ORFs编码蛋白第29页
   ·与猪圆环病毒相关的疾病第29-30页
   ·猪圆环病毒病的疫苗研究第30-31页
   ·猪圆环病毒研究的展望第31-32页
 2 猪繁殖与呼吸综合征病毒第32-41页
   ·猪繁殖与呼吸综合征病毒的发现第32-33页
   ·猪繁殖与呼吸综合征病毒的形态学和理化性质第33-34页
   ·猪繁殖与呼吸综合征病毒的基因组结构及其编码蛋白第34-37页
     ·ORF5编码蛋白第36页
     ·ORF6编码蛋白第36-37页
   ·猪繁殖与呼吸综合征病毒的受体与病毒复制第37-38页
   ·猪繁殖与呼吸综合征疫苗研究第38-40页
     ·猪繁殖与呼吸综合征疫苗研究特殊性第38页
     ·猪繁殖与呼吸综合征弱毒疫苗第38-39页
     ·猪繁殖与呼吸综合征灭活疫苗第39页
     ·猪繁殖与呼吸综合征DNA疫苗第39-40页
     ·猪繁殖与呼吸综合征活载体疫苗第40页
   ·猪繁殖与呼吸综合征研究的展望第40-41页
 3 家蚕核型多角体病毒第41-47页
   ·杆状病毒概况第41页
   ·杆状病毒的分类和理化性质第41-42页
   ·家蚕核型多角体病毒基因组及其表达第42-44页
   ·家蚕核型多角体病毒RNA干扰研究进展第44-46页
   ·shRNA干扰家蚕核型多角体病毒研究的展望第46-47页
 4 RNA干扰第47-55页
   ·RNA干扰现象的发现第47-50页
     ·共抑制现象的发现第47-48页
     ·RNA干扰现象的发现第48-50页
   ·shRNA干扰基本原理第50-53页
     ·shRNA干扰第50-51页
     ·shRNA靶序列的选择第51页
     ·shRNA靶序列的设计第51页
     ·shRNA介导的沉默机制第51-53页
   ·RNAi技术应用于病毒性疾病治疗研究现状第53-54页
   ·RNA干扰的局限性第54-55页
 5 PiggyBac转座子第55-57页
   ·转座子第55页
   ·piggyBac转座子第55-56页
   ·piggyBac转座子的应用第56-57页
 6 技术路线第57-59页
   ·shRNA的设计合成与活性筛选第57页
   ·转基因细胞系建立与鉴定第57-59页
第二章 一般材料与方法第59-75页
 1 试验材料第59-60页
   ·生物材料第59页
   ·工具酶和主要试剂第59-60页
   ·试剂盒第60页
 2 主要试剂配制第60-62页
 3 主要试验仪器第62-63页
 4 常用试验方法第63-75页
   ·连接产物转化第63页
   ·小量质粒DNA的制备第63-64页
   ·重组质粒琼脂糖凝胶电泳鉴定第64页
   ·目的片段的分离回收第64-65页
   ·细胞的培养与保存第65-66页
   ·细胞活化第66页
   ·细胞转染第66-67页
   ·细胞基因组DNA提取第67-68页
   ·培养细胞总RNA提取第68-70页
   ·反转录第70页
   ·Real-Time PCR第70-72页
   ·Splinkerette-PCR第72-75页
第三章 shRNA干扰猪圆环状病毒增殖和复制研究第75-98页
 第一节 针对PVC2型病毒的shRNA的设计与合成第75-85页
  摘要第75页
  1 材料与方法第75-76页
   ·材料第75页
   ·方法第75-76页
     ·针对PVC2病毒的shRNA的设计第75页
     ·双链shRNA合成方法第75-76页
  2 结果与分析第76-85页
   ·抗猪圆环病毒病shRNA的设计原则第76页
   ·针对PVC2病毒-Rep蛋白基因的shRNA设计第76-80页
   ·针对PVC2病毒-Cap蛋白基因的shRNA设计第80-84页
   ·针对PVC2病毒-ORF3/ORF4基因的shRNA设计第84-85页
 第二节 针对PVC2病毒shRNA的活性筛选第85-98页
  摘要第85-86页
  1 材料与方法第86-89页
   ·材料第86页
   ·方法第86-89页
     ·PK15细胞的复苏与培养第86页
     ·表达特异性含猪圆环病病毒靶向基因shRNA重组质粒的构建第86-87页
     ·重组质粒酶切鉴定第87页
     ·重组质粒测序鉴定第87-88页
     ·转染第88页
     ·病毒感染第88页
     ·表达特异性shRNA载体对PCV2复制增殖的干扰效果第88-89页
  2 结果与分析第89-96页
   ·载体构建与鉴定第89页
   ·pSIREN-shRNA重组质粒转染PK15细胞效率检测第89-90页
   ·针对PVC2病毒-Rep蛋白基因的shRNA的活性筛选第90-93页
   ·针对PVC2病毒-Cap蛋白基因的shRNA的活性筛选第93-95页
   ·针对PVC2病毒-ORF3/ORF4基因的shRNA的效果检测第95-96页
  3 讨论第96-98页
第四章 shRNA干扰猪繁殖与呼吸综合症病毒增殖和复制的研究第98-126页
 第一节 针对PRRSV靶向基因的shRNA的设计与合成第98-101页
  摘要第98页
  1 材料与方法第98-99页
   ·材料第98页
   ·方法第98-99页
     ·针对PRRSV靶向基因shRNA的设计第98-99页
     ·双链shRNA合成方法第99页
  2 结果与分析第99-101页
   ·抗猪蓝耳病病毒病shRNA的设计原则第99页
   ·针对PRRSV-ORF5的shRNA设计第99-100页
   ·针对PRRSV-ORF6的shRNA设计第100-101页
 第二节 抗猪蓝耳病病毒shRNA活性的检测第101-106页
  摘要第101页
  1 材料与方法第101-104页
   ·材料第101页
   ·方法第101-104页
     ·Marc-145细胞的复苏与培养第101-102页
     ·表达特异性含猪蓝耳病病毒靶向基因shRNA重组质粒的构建第102页
     ·重组质粒酶切鉴定第102页
     ·重组质粒测序鉴定第102-103页
     ·病毒的培养第103页
     ·转染第103页
     ·病毒感染第103页
     ·表达特异性shRNA载体对PRRSV复制增殖的干扰效果第103-104页
  2 结果与分析第104-106页
   ·载体构建与鉴定第104-105页
   ·pSIREN-shRNA重组质粒转染Marc-145细胞效率检测第105页
   ·抗猪蓝耳病病毒shRNA活性的检测第105-106页
 第三节 转基因载体构建第106-111页
  摘要第106页
  1 材料与方法第106-109页
   ·材料第106-107页
   ·方法第107-109页
     ·PXL-BAC Ⅱ-ZsGFP载体构建第107-108页
     ·PXL-BAC Ⅱ-ZsGFP-Neo载体构建第108页
     ·PXL-BAC Ⅱ-FRT-ZsGFP-Neo-shRNA载体构建第108-109页
  2 结果与分析第109-111页
   ·PXL-BAC Ⅱ-FRT-ZsGFP-Neo-shRNA(6e)重组质粒载体构建第109-110页
   ·PXL-BAC Ⅱ-FRT-ZsGFP-Neo-6e酶切鉴定第110-111页
 第四节 抗PRRSV转基因细胞系的建立第111-115页
  摘要第111页
  1 材料与方法第111-113页
   ·材料第111页
   ·方法第111-113页
     ·通过不同浓度的G418筛选培养基确定Marc-145对G418的敏感度第111-112页
     ·质粒稳定转染第112页
     ·单克隆细胞的筛选第112-113页
  2 结果与分析第113-115页
   ·Marc-145细胞最佳筛选浓度第113页
   ·转基因载体转染Marc-145细胞的效率检测第113-114页
   ·转基因细胞系筛选第114-115页
 第五节 Marc-145转基因细胞的鉴定第115-126页
  摘要第115-116页
  1 材料与方法第116-120页
   ·材料第116页
   ·方法第116-120页
     ·单克隆细胞基因组PCR第117页
     ·单克隆细胞RT-PCR第117-118页
     ·Dot Blotting第118-119页
     ·插入位点检测-Splinkerette-PCR第119页
     ·转基因细胞系的抗病毒能力第119-120页
  2 结果与分析第120-125页
   ·细胞基因组PCR标记基因和筛选基因的检测第120-121页
   ·逆转录PCR第121-122页
   ·Dot blotting第122-123页
   ·Splinkerette-PCR分析外源基因插入位点第123-124页
   ·转基因细胞抗病毒能力第124-125页
  3 讨论第125-126页
第五章 shRNA干扰家蚕BmNPV增殖与复制的研究第126-158页
 第一节 针对BmNPV靶向基因shRNA的设计与合成第126-130页
  摘要第126页
  1 材料与方法第126-127页
   ·材料第126页
   ·方法第126-127页
     ·针对BmNPV靶向基因shRNA的设计第126-127页
     ·双链shRNA的合成第127页
  2 结果与分析第127-130页
   ·针对BmNPV极早期表达因子ie-1基因的shRNA设计第127-128页
   ·针对BmNPV晚期表达因子lef-1基因的shRNA设计第128-129页
   ·针对BmNPV晚期表达因子lef-2基因的shRNA设计第129页
   ·针对BmNPV晚期表达因子lef-3基因的shRNA设计第129-130页
 第二节 针对BmNPV的shRNA的活性筛选第130-139页
  摘要第130页
  1 材料与方法第130-134页
   ·材料第130页
   ·方法第130-134页
     ·BmN的复苏与培养第130页
     ·PXL-BACⅡ-GFP载体的构建第130-131页
     ·PXL-BACⅡ-GFP-BmU6载体构建第131-132页
     ·PXL-BACⅡ-GFP-BmU6-shRNA重组质粒构建第132页
     ·BmNPV病毒的复苏与增殖第132页
     ·BmNPV的CCID50测定第132-133页
     ·表达特异性shRNA重组质粒PXL-BACⅡ-GFP-BmU6-shRNA活性筛选第133-134页
  2 结果与分析第134-139页
   ·GFP基因扩增第134页
   ·BmU6扩增第134-136页
   ·PXL-BACⅡ-GFP-BmU6-shRNA重组质粒第136-137页
   ·转染与病毒接种第137-138页
   ·针对BmNPV靶基因的shRNA的活性筛选第138-139页
 第三节 单联与双联转基因载体构建第139-145页
  摘要第139-140页
  1 材料与方法第140-142页
   ·材料第140页
   ·方法第140-142页
     ·Neomycin筛选基因的获取第140页
     ·PXL-BACⅡ-GFP-BmU6-shRNA-Neo的构建第140-141页
     ·双联载体的构建第141-142页
  2 结果与分析第142-145页
   ·Neomycinr基因的扩增第142-143页
   ·PXL-BACⅡ-GFP-BmU6-shRNA-Neo重组质粒酶切鉴定第143-144页
   ·双联载体构建第144-145页
 第四节 抗BmNPV转基因细胞系的建立第145-148页
  摘要第145页
  1 材料与方法第145-147页
   ·材料第145页
   ·方法第145-147页
     ·通过不同浓度的G418筛选培养基确定BmN对G418的敏感度第145-146页
     ·质粒稳定转染第146页
     ·单克隆细胞的筛选第146-147页
  2 结果与分析第147-148页
   ·BmN细胞最佳筛选浓度第147页
   ·转基因细胞系筛选第147-148页
 第五节 BmN转基因细胞的鉴定第148-158页
  摘要第148-149页
  1 材料与方法第149-151页
   ·材料第149页
   ·方法第149-151页
     ·双联重组转座载体PXL-BACⅡ-GFP-double(ielc/lef3e2)-Neo抗病毒能力第149页
     ·PXL-BACⅡ-GFP-BmU6-shRNA(ielc)-Neo转基因细胞的抗病毒能力第149-150页
     ·单克隆细胞基因组PCR第150页
     ·单克隆细胞RT-PCR第150-151页
     ·转座插入位点检测-Splinkerette-PCR第151页
  2 结果与分析第151-156页
   ·PXL-BACⅡ-GFP-BmU6-shRNA(ielc)-Neo转基因细胞抗病毒能力第151-152页
   ·双联重组转座质粒抗病毒能力第152-153页
   ·细胞基因组PCR第153-154页
   ·逆转录PCR第154页
   ·Splinkerette-PCR分析外源基因插入位点第154-156页
  3 讨论第156-158页
第六章 总结第158-161页
 1 主要结论第158-159页
 2 创新点第159页
 3 后续研究展望第159-161页
参考文献第161-180页
攻读博士期间发表论文第180-182页
申请国家发明专利第182-184页
攻读博士期间参加课题第184-185页
致谢第185页

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