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核仁因子Def负调控p53及其异构体A113p53/Δ133p53的功能和分子机制

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
缩略词表第10-15页
第一章 前言第15-39页
   ·肿瘤抑制因子p53第16-25页
     ·p53的功能与激活第17-19页
     ·p53负调控因子第19-21页
     ·p53蛋白家族、异构体及结构域第21-24页
     ·核仁与p53信号路径第24-25页
   ·肝脏结构功能与发育第25-32页
     ·肝脏的形态结构及斑马鱼作为肝脏发育研究模型的优势第26-27页
     ·斑马鱼成肝细胞的起源与特化第27-28页
     ·斑马鱼肝脏的发育过程第28页
     ·肝脏发育的细胞分子机制第28-32页
   ·def基因及def~(hi429)突变体第32-34页
   ·斑马鱼作为发育生物学和分子生物学研究模型的优势第34-38页
   ·本研究的内容、目的和意义第38-39页
第二章 材料和方法第39-68页
   ·斑马鱼第39-40页
     ·斑马鱼品系及饲养第39页
     ·斑马鱼的交配及受精卵的收集第39-40页
   ·人类细胞系及其培养和转染第40-41页
     ·细胞系及其培养和冻存第40-41页
     ·细胞转染第41页
   ·大肠杆菌菌株第41页
   ·Morpholino和siRNA第41-42页
   ·抗体第42-43页
   ·蛋白酶抑制剂第43页
   ·DNA相关操作方法第43-47页
     ·基因克隆第43-45页
     ·DNA测序第45页
     ·质粒定点突变和基因内部特定片段的删除第45-46页
     ·斑马鱼和人类细胞系基因组DNA的抽提第46页
     ·斑马鱼胚胎原位细胞凋亡分析第46-47页
   ·RNA相关操作方法第47-51页
     ·斑马鱼胚胎及人类细胞系总RNA提取第47页
     ·总RNA样品中基因组DNA的消化第47页
     ·两步法RT-PCR(Reverse Transcription PCR,反转录PCR)第47-48页
     ·带帽mRNA的体外合成第48页
     ·Northern印记分析第48-50页
     ·斑马鱼胚胎整胚原位杂交(WISH)第50-51页
   ·蛋白质相关操作方法第51-56页
     ·抗体的制备与纯化第51-53页
     ·Western印记分析第53-54页
     ·抗体免疫荧光染色第54-55页
     ·免疫共沉淀第55-56页
   ·流式细胞分析第56页
   ·斑马鱼显微注射第56-57页
   ·斑马鱼胚胎消化器官表型或p53蛋白水平拯救实验第57页
   ·斑马鱼胚胎存活率分析第57页
   ·序列比对及进化树分析第57页
   ·常规培养基及化学试剂配方第57-60页
   ·本课题所用引物、Morpholino、siRNA序列以及不同浓度的SDS-PAGE凝胶配方列表第60-68页
第三章 核仁蛋白Def影响斑马鱼18S rRNA前体剪接第68-74页
   ·Def蛋白系统进化分析第68页
   ·斑马鱼和人类Def均为核仁蛋白第68-71页
   ·斑马鱼def~(hi429)突变导致18S rRNA前体累积第71页
   ·小结与讨论第71-74页
第四章 斑马鱼def~(hi429)突变导致p53和△113p53蛋白大量上调并累积在核仁第74-81页
   ·p53抗体的制备第74-77页
     ·斑马鱼△113p53抗原的表达和纯化第74页
     ·抗原免疫和抗体纯化、特异性评价第74-77页
   ·斑马鱼def~(hi429)突变体中p53和△113p53蛋白表达大量上调第77页
   ·大量上调的p53和△113p53蛋白定位于斑马鱼def~(hi429)突变体核仁第77-78页
   ·小结与讨论第78-81页
第五章 斑马鱼Def选择性介导p53和△113p53蛋白的降解及其生物学意义第81-87页
   ·Def过表达选择性介导p53及其异构体△113p53蛋白的降解第81-84页
   ·Def介导p53蛋白降解的生物学意义第84-85页
   ·小结与讨论第85-87页
第六章 斑马鱼Def介导的p53蛋白降解不依赖于Mdm2和蛋白泛素化降解途径第87-94页
   ·斑马鱼Def介导的p53和△113p53蛋白降解不依赖于Mdm2第87-90页
   ·斑马鱼Def靶向p53 DNA结合域介导其降解第90-91页
   ·斑马鱼Def介导的p53蛋白降解不依赖于蛋白泛素化降解途径第91-92页
   ·小结与讨论第92-94页
第七章 人类Def多态性呈现对p53/△133p53不同的降解活性第94-98页
   ·人类def基因多态性分析第94页
   ·hu-Def多态性呈现对p53/△133p53不同的降解活性第94-96页
   ·小结与讨论第96-98页
第八章 Def与Calpain 3共同介导p53降解第98-114页
   ·hu-Def通过Calpain 3介导p53蛋白降解第98-101页
   ·hu-Def与CAPN3形成复合物第101-102页
   ·hu-Def或CAPN3表达下调介导的p53激活不依赖于RPL5和RPL11第102-103页
   ·CAPN3表达下调导致细胞G1期阻滞和细胞凋亡增加第103-105页
   ·斑马鱼CAPN3b与Def共同介导p53蛋白降解第105-111页
   ·小结与讨论第111-114页
第九章 Def通过CAPN3a调控斑马鱼胚胎早期肝脏发育第114-117页
   ·CAPN3a而不是CAPN3b过表达能拯救def-MO引起的小肝脏表型第114-115页
   ·CAPN3a而不是CAPN3b表达下调影响斑马鱼胚胎肝脏发育第115-116页
   ·小结与讨论第116-117页
第十章 结论与讨论第117-124页
   ·结论第117-119页
   ·讨论第119-124页
参考文献第124-137页
作者简介第137-138页
致谢第138-139页

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