摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-9页 |
插图索引 | 第9-10页 |
附表索引 | 第10-11页 |
第1章 绪论 | 第11-17页 |
·研究背景和意义 | 第11-12页 |
·国内外的研究现状 | 第12-15页 |
·本文主要工作 | 第15页 |
·本文结构 | 第15-17页 |
第2章 上位性检测算法概述 | 第17-26页 |
·引言 | 第17页 |
·基本概念 | 第17-19页 |
·上位性 | 第17-18页 |
·全基因组关联研究 | 第18-19页 |
·上位性检测算法 | 第19-25页 |
·基于统计的方法 | 第19-21页 |
·基于机器学习的方法 | 第21-23页 |
·基于贝叶斯理论的方法 | 第23-25页 |
·小结 | 第25-26页 |
第3章 基于马尔可夫覆盖两步法的致病 SNPS 检测算法 | 第26-44页 |
·引言 | 第26页 |
·马尔可夫覆盖 | 第26-31页 |
·贝叶斯网络 | 第26-28页 |
·条件独立 | 第28-29页 |
·马尔可夫覆盖 | 第29-31页 |
·基于马尔可夫覆盖两步法的致病 SNPs 检测算法 | 第31-34页 |
·G2统计 | 第31-32页 |
·IMBED 算法 | 第32-34页 |
·数据集 | 第34-38页 |
·模拟数据集 | 第34-36页 |
·真实数据集 | 第36-38页 |
·仿真实验及分析 | 第38-43页 |
·实验数据 | 第38-39页 |
·实验结果及分析 | 第39-43页 |
·小结 | 第43-44页 |
第4章 基于马尔可夫覆盖分治法的致病 SNPS 检测算法 | 第44-57页 |
·引言 | 第44页 |
·马尔可夫覆盖分治法 | 第44-48页 |
·基本思想 | 第44-45页 |
·基于分治法的马尔可夫覆盖算法 | 第45-48页 |
·基于马尔可夫覆盖分治法的致病 SNPs 检测算法——PCED | 第48-51页 |
·仿真实验及分析 | 第51-55页 |
·实验数据 | 第51页 |
·实验结果及分析 | 第51-55页 |
·小结 | 第55-57页 |
结论 | 第57-59页 |
本文工作总结 | 第57-58页 |
进一步研究工作展望 | 第58-59页 |
参考文献 | 第59-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
附录 A 攻读硕士学位期间所发表的学术论文 | 第66-67页 |
附录 B 攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第67页 |