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西尼罗病毒核酸及抗体检测体系的建立与评价

摘要第1-13页
Abstract第13-16页
缩略语表(Abbreviation)第16-18页
第一部分 西尼罗病毒流行病学及检测技术研究现状(综述)第18-37页
 1 西尼罗病毒生物学特性的研究第18-22页
   ·西尼罗病毒的分类第18-19页
   ·西尼罗病毒的形态学特征第19-20页
   ·西尼罗病毒的基因组结构第20-21页
   ·西尼罗病毒基因组编码的蛋白及功能第21-22页
     ·结构蛋白与功能第21-22页
     ·非结构蛋白与功能第22页
 2 西尼罗病毒的流行病学特征及防制现状第22-28页
   ·西尼罗病毒的传染源第22页
   ·西尼罗病毒的传播途径第22-23页
   ·西尼罗病毒的易感者第23-24页
     ·易感人群第23-24页
     ·易感动物第24页
   ·西尼罗病毒近年流行特点分析第24-28页
     ·发病率与死亡率的上升第24页
     ·流行地域的扩展第24-25页
     ·广泛的鸟类动物宿主第25-26页
     ·广泛的蚊虫媒介第26-27页
     ·多种哺乳动物被感染发病死亡第27-28页
   ·防止西尼罗病毒感染的预防措施第28页
 3 西尼罗病毒检测技术研究进展第28-36页
   ·病毒分离接种法第28-29页
   ·空斑形成试验第29页
   ·免疫学检测方法第29-32页
     ·免疫荧光法第29-30页
     ·酶联免疫吸附法第30页
     ·免疫组织化学法第30页
     ·生物条形码检测法第30-32页
   ·核酸检测方法第32-36页
     ·常规RT-PCR第32页
     ·巢式RT-PCR第32页
     ·实时荧光定量PCR第32-34页
     ·核酸序列扩增分析第34-35页
     ·环介导的恒温扩增技术第35-36页
 4 展望第36-37页
第二部分 西尼罗病毒易感性研究现状(综述)第37-44页
 1 WNV主要突变位点与易感性之间的关系第37-40页
   ·结构蛋白功能与突变第37-39页
   ·非结构蛋白功能与突变第39-40页
     ·NS2蛋白的突变第39页
     ·NS5蛋白的突变第39页
     ·NS1蛋白基因相对保守第39-40页
     ·NS2B和NS3蛋白第40页
 2 WNV易感性与感染机体状态及相关因子之间的关系第40-42页
   ·WNV易感性与年龄之间的关系第40页
   ·WNV易感性与OAS及CCR5之间的关系第40-42页
   ·WNV易感性与CXCL10之间的关系第42页
 3 展望第42-44页
第三部分 西尼罗病毒荧光定量PCR检测体系的建立与评价第44-58页
 1 研究目的与意义第45页
 2 材料与方法第45-49页
   ·试剂第45页
   ·病毒与样本第45页
   ·主要仪器第45-46页
   ·靶序列选择及引物的设计第46页
   ·WNV基因组RNA的提取及cDNA的合成第46页
   ·标准品对照片段的扩增、克隆与定量第46-47页
   ·引物浓度的优化第47-48页
   ·标准品的扩增及标准扩增曲线的绘制第48页
   ·检测体系特异性的确定第48页
   ·检测体系的灵敏度及定量线性分析第48页
   ·重复性检测第48-49页
 3 结果第49-55页
   ·引物的Blast比对结果第49-50页
   ·标准品对照扩增结果第50-51页
   ·对照PCR扩增结果第51-52页
   ·引物使用浓度的确定第52页
   ·标准品对照质粒扩增曲线及标准回归曲线的分析第52-53页
   ·标准品熔解曲线分析第53-54页
   ·检测体系灵敏感度及特异性分析第54页
   ·重复性检测结果第54-55页
 4 讨论第55-56页
   ·基于SYBR Green Ⅰ建立的检测体系特点分析第55-56页
   ·本研究建立的体系优缺点分析第56页
   ·建立的RT-PCR检测体系应用前景分析第56页
 5 结论第56-58页
第四部分 西尼罗病毒E蛋白结构域Ⅲ在S2细胞中的表达与鉴定第58-76页
 1 研究目的与意义第59页
 2 材料与方法第59-68页
   ·材料第59-60页
     ·细胞株第59页
     ·载体与基因第59页
     ·酶类及试剂第59-60页
     ·细胞培养用品第60页
     ·DNA和蛋白标准参照物第60页
     ·主要仪器、设备第60页
   ·表达载体pMT/DⅢ的构建第60-63页
     ·E DomainⅢ基因的PCR扩增第60-61页
     ·DomainⅢ基因的亚克隆第61页
     ·载体构建第61-62页
     ·质粒的提取第62-63页
   ·重组质粒的鉴定第63页
     ·双酶切鉴定第63页
     ·PCR鉴定第63页
     ·序列分析第63页
   ·果蝇S2细胞的培养第63-64页
     ·生长条件第63-64页
     ·冻存细胞第64页
     ·传代第64页
     ·果蝇S2细胞对Blasticidin抗性分析第64页
   ·脂质体转染果蝇S2细胞第64-65页
     ·果蝇S2细胞的准备第64-65页
     ·脂质体DNA的准备第65页
     ·细胞的转染第65页
   ·抗性细胞的筛选第65页
   ·抗性细胞的诱导表达第65-66页
   ·细胞表达上清的鉴定第66页
   ·细胞表达产物的鉴定第66-68页
     ·样品收集第66页
     ·样品的浓缩处理第66-67页
     ·SDS-PAGE和Western Blotting检测第67-68页
 3 结果第68-72页
   ·E DomainⅢ基因的PCR扩增第68-69页
   ·E DomainⅢ氨基酸全序列及空间结构预测第69-70页
   ·pMT/DⅢ重组子的菌落PCR鉴定第70页
   ·pMT/DⅢ重组质粒的酶切鉴定第70页
   ·细胞表达上清SDS-PAGE检测结果第70-71页
   ·细胞表达上清Western Blotting检测结果第71-72页
   ·抗性细胞基因组DNA的PCR检测结果第72页
 4 讨论第72-75页
   ·E DomainⅢ蛋白功能与特点分析第72-73页
   ·EDS表达系统特点介绍第73-74页
   ·基于DES表达的E DomainⅢ蛋白及应用情况分析第74-75页
 5 结论第75-76页
第五部分 WNV抗体检测体系的初步建立与评价第76-90页
 1 研究目的与意义第77页
 2 材料与方法第77-82页
   ·材料第77-78页
     ·WNV病毒株和培养用细胞株第77页
     ·重组WNV E DomainⅢ第77页
     ·主要用品及仪器第77页
     ·主要试剂及溶液配制第77-78页
   ·表达的WNV E DomainⅢ蛋白表达量的测定第78页
   ·免疫抗原的制备第78-79页
   ·阴性与阳性抗WNV血清的制备第79-80页
   ·阳性抗WNV血清的纯化第80页
   ·间接ELISA法确定E DomainⅢ的特异性第80页
   ·制备的WNV E DomainⅢ抗血清与WNV其它同源病毒反应性的检测第80页
   ·抗原最佳包被浓度与对照血清最佳稀释度的确定第80-81页
   ·封闭试剂与封闭条件的选择第81页
   ·酶标抗体工作浓度的确定第81页
   ·Cutoff值的确定第81页
   ·检测体系特异性的评价第81-82页
   ·批内、批间重复性的评价第82页
 3 结果第82-87页
   ·表达的WNV E DomainⅢ蛋白表达量检测结果第82-83页
   ·抗WNV血清与E DomainⅢ蛋白反应的特异性第83页
   ·WNV DomainⅢ蛋白抗血清纯化结果第83-84页
   ·WNV DomainⅢ蛋白ELISA使用浓度检测结果第84页
   ·检测体系封闭试剂与封闭条件的确定第84-85页
   ·封闭时间确定结果第85页
   ·酶标抗体工作浓度检测结果第85-86页
   ·Cutoff值的确定结果第86页
   ·体系特异性的检测结果第86-87页
   ·批内、批间重复性的检测结果第87页
 4 讨论第87-89页
   ·西尼罗病毒抗体检测体系的特点与应用领域第87-88页
   ·建立的抗体检测体系的优缺点分析与评价第88-89页
 5 结论第89-90页
参考文献第90-104页
致谢第104-106页
附录第106-113页
作者简历第113-114页

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