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水稻产量相关基因Ghd7的分离与鉴定

中文摘要第1-10页
Abstract第10-13页
缩略词表第13-14页
1 前言第14-39页
   ·水稻产量构成第14页
   ·分子标记在水稻数量遗传学中的应用第14-16页
   ·水稻成花光周期调控的分子生物学机理第16-26页
     ·光周期的简单概念第16页
     ·水稻中抽穗期QTLs的定位与互作研究第16-17页
     ·拟南芥中的Constans和水稻中的Hd1第17-18页
     ·拟南芥中的FT和水稻中Hd3a作为成花素控制植物开花第18-20页
     ·拟南芥中GIGANTEA和水稻中同源基因OsGI第20-21页
     ·由Ehd1控制的水稻中独特的开花途径第21页
     ·编码蛋白激酶亚基的基因Hd6和CK2第21-22页
     ·控制CO基因表达的FKF1和水稻中的同源基因OsFKF1第22-23页
     ·直接控制CO表达的CDF1和与水稻中的同源基因OsCDF1第23页
     ·水稻和拟南芥中一类与生物钟相关的基因OsPRRs和APRRs第23-24页
     ·光敏色素蛋白在水稻光周期成花途径中作用第24-25页
     ·拟南芥和水稻中MADS基因家族第25-26页
   ·拟南芥和水稻光周期控制开花时间途径的调控比较第26-27页
   ·水稻株高调控的分子生物学机理第27-33页
     ·SD1对水稻株高发育的调控第27-28页
     ·gid2突变体植株矮化第28页
     ·SLR1蛋白调控GA信号在水稻体内的传递第28-29页
     ·GID2和SLR1在体内互作第29页
     ·GID1编码GA可溶性受体蛋白第29-30页
     ·eui1突变促进水稻穗茎节伸长第30-31页
     ·D35编码GA合成酶ent-kaurene氧化酶第31页
     ·蔗糖磷酸化酶调控水稻的株高第31-32页
     ·Dwarf1同时控制水稻的株高、粒形和穗大小第32页
     ·OsBRI1编码BR受体激酶,控制节间细胞伸长和叶片角度第32-33页
   ·水稻中产量性状相关基因的分子遗传学研究第33-37页
     ·对水稻中产量相关基QTLs的初步定位第33-35页
     ·产量QTLs的精细定位第35页
     ·Gnla的图位克隆第35-36页
     ·水稻穗部性状的相关突变第36页
     ·RCN1和RNC2过量表达影响水稻抽穗期和穗形第36-37页
     ·控制水稻粒形和分蘖的基因的克隆第37页
   ·植株激素和水稻产量第37-38页
   ·研究的背景与意义第38-39页
2 材料与方法第39-48页
   ·供试水稻材料第39页
   ·近等基因系的构建第39页
   ·BAC文库第39-40页
   ·遗传转化的载体与菌株第40页
   ·田间试验第40-41页
   ·性状考查第41页
   ·短日照试验第41页
   ·分子标记分析与转基因植株拷贝数检测第41页
   ·Shotgun测序方法第41-42页
   ·基因预测方法第42页
   ·遗传转化方法第42页
   ·亚细胞定位第42-43页
   ·RNA的提取,RACE,RT-PCR和Realtime PCR第43-44页
   ·组织学切片和RNA原位杂交分析第44页
   ·节律性表达材料种植第44-45页
   ·数据分析第45页
   ·比较测序第45页
   ·芯片材料第45页
   ·自然群体的结构分析第45-46页
   ·Ghd7的核酸多样性和关联分析第46-47页
   ·本实验中所用的部分引物第47-48页
3 结果与分析第48-94页
   ·近等基因系的建立第48-51页
   ·对来自特青供体的近等基因系遗传效应分析第51页
   ·基因的精细定位第51-53页
   ·近等基因系的光周期反应第53-54页
   ·Ghd7的分离与遗传转化载体的构建第54-58页
     ·候选基因的预测第54-55页
     ·候选基因在珍汕97与明恢63中的比较测序第55-57页
     ·明恢63中Ghd7的分离第57-58页
   ·互补测验第58-64页
   ·全长cDNA的分离与基因结构分析第64-65页
   ·水稻和拟南芥中CO基因家族的聚类分析第65-72页
   ·GHD7的亚细胞定位第72-73页
   ·Ghd7表达部位分析第73-75页
   ·Ghd7对茎秆结构和形态的影响第75-77页
   ·Ghd7与相关基因的节律性表达分析第77-79页
   ·Ghd7独立于Hd1调控水稻开花第79-81页
   ·使用DNA芯片技术对Ghd7调控基因的初步分析第81-84页
   ·Ghd7的基因型和水稻地理分布相关第84-86页
   ·Ghd7的核酸多样性和关联分析的初步研究第86-94页
     ·群体结构分析第86-90页
     ·Ghd7核酸多样性分析第90-92页
     ·关联分析的初步结果第92-94页
4 讨论第94-99页
   ·图位克隆和候选基因方法的比较第94-95页
   ·数量性状基因Ghd7—因多效、效应巨大第95-96页
   ·CO-like基因家族的进化和Ghd7在地区适应性中的功能第96-97页
   ·Ghd7独立于Hd1调控水稻抽穗时间第97页
   ·Ghd7调控茎秆和穗部性状的分子机理探讨第97-99页
参考文献第99-119页
附录Ⅰ 部分实验的操作流程第119-127页
附录Ⅱ 在读博士期间发表的论文第127-128页
致谢第128页

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