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嗜热真菌蛋白激酶基因的克隆、表达与打靶载体构建

中文摘要第1-11页
英文摘要第11-13页
1 前言第13-32页
   ·蛋白激酶概述第13-17页
     ·蛋白激酶在细胞信号转导中的作用和意义第13-14页
     ·蛋白激酶的分类研究第14-15页
     ·蛋白激酶的共同特征第15-16页
     ·蛋白激酶一级结构的特征第16-17页
     ·蛋白激酶的生化特征第17页
   ·蛋白激酶的调控机制第17-18页
     ·蛋白激酶对靶底物的调控方式第17-18页
     ·蛋白激酶活性的激活和抑制第18页
   ·真菌蛋白激酶的研究现状第18-30页
     ·蛋白激酶在真菌信号传导中的作用第18-19页
     ·丝状真菌蛋白激酶的种类及研究现状第19-30页
   ·本研究的立题依据、研究内容及技术路线第30-32页
     ·立题依据第30页
     ·研究内容第30-31页
     ·技术路线第31-32页
2 材料与方法第32-54页
   ·材料第32-35页
     ·供试菌株第32页
     ·质粒第32页
     ·酶和生化试剂第32页
     ·仪器第32-33页
     ·溶液配制第33-34页
     ·培养基配制第34-35页
   ·嗜热真菌蛋白激酶CDNA 的克隆和序列分析第35-42页
     ·引物设计第35页
     ·疏绵状嗜热丝孢菌总RNA 的提取第35-36页
     ·RNA 中DNA 的消化第36页
     ·紫外检测RNA 产率和纯度第36页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第36-37页
     ·菌丝体DNA 的抽提第37-38页
     ·目的基因全长cDNA 的克隆第38-42页
     ·丝/苏氨酸蛋白激酶(Ser/Thr-PK)基因全长序列的生物信息学分析第42页
   ·嗜热真菌蛋白激酶基因在毕赤酵母中的表达第42-50页
     ·蛋白激酶基因成熟肽序列的分离第42-43页
     ·酵母表达载体的构建第43-44页
     ·线性化质粒DNA 的制备第44页
     ·酵母转化第44-46页
     ·酵母转化子的筛选与鉴定第46-48页
     ·外源基因多拷贝整合转化子筛选第48-49页
     ·工程菌的培养和丝/苏氨酸蛋白激酶的诱导分泌表达第49页
     ·pPIC3.5K/pk 酵母工程菌 PS-PK-18 的细胞破壁第49-50页
     ·酵母工程菌 PS-PK-16 和 PS-PK-18 表达产物的 SDS-PAGE 分析第50页
     ·目的蛋白的回收第50页
   ·嗜热真菌 Thermomyces lanuginosus 蛋白激酶基因在毕赤酵母及原始菌 株中的表达量差异分析第50-52页
     ·酵母工程菌总RNA 的提取第50-51页
     ·Thermomyces lanuginosus 连续七天总 RNA 的提取第51页
     ·RNA 中DNA 的消化第51页
     ·紫外检测RNA 产率和纯度第51页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第51页
     ·RT-PCR 检测第51页
     ·荧光定量PCR 的反应体系第51-52页
     ·荧光定量PCR 的反应程序第52页
   ·打靶载体 pUCATPB/PK 的构建第52-54页
     ·引物设计第52页
     ·片段的扩增第52页
     ·质粒提取第52页
     ·双酶切反应第52-53页
     ·酶切产物的纯化第53页
     ·酶切产物的链接第53页
     ·重组质粒的鉴定第53-54页
3 结果与分析第54-87页
   ·嗜热真菌蛋白激酶CDNA 的克隆和序列分析第54-63页
     ·疏绵状嗜热丝孢菌总RNA 的提取第54页
     ·疏绵状嗜热丝孢菌DNA 的分离第54-55页
     ·疏绵状嗜热丝孢菌蛋白激酶基因全长cDNA 的分离第55-56页
     ·疏绵状嗜热丝孢菌蛋白激酶基因的核苷酸和氨基酸序列分析第56-63页
   ·疏绵状嗜热丝孢菌蛋白激酶基因在毕赤酵母中的表达第63-72页
     ·蛋白激酶基因成熟肽基因序列的限制性酶切位点分析第63-64页
     ·蛋白激酶成熟肽基因序列的分离第64页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第64-66页
     ·重组酵母表达质粒pPIC9K/pk 和pPIC3.5K/pk 的酵母转化第66页
     ·酵母转化子的甲醇利用表型的筛选第66-67页
     ·酵母转化子的PCR 鉴定第67-68页
     ·蛋白激酶基因多拷贝整合子的筛选第68页
     ·蛋白激酶基因在毕赤酵母中的表达及表达产物的检测第68-72页
   ·荧光定量PCR 对蛋白激酶基因表达差异的分析第72-80页
     ·RNA 的提取第72-73页
     ·RT-PCR 分析第73-75页
     ·引物的设计第75页
     ·PCR 对基因的检测第75-76页
     ·标准曲线的建立第76-77页
     ·Ct 值法对表达差异的分析第77-80页
   ·打靶载体的构建第80-87页
     ·酶切位点分析第80-81页
     ·引物设计第81-82页
     ·SPK 和XPK 的分离第82-83页
     ·打靶载体pUCATPB/PK 的构建第83页
     ·打靶载体pUCATPB/PK 的验证第83-87页
4 讨论第87-95页
   ·嗜热真菌 Thermomyces lanuginosus 蛋白激酶 cDNA 的克隆第87-88页
     ·RNA 的提取第87页
     ·关于引物设计第87-88页
   ·疏绵状嗜热丝孢菌 th-ps1 基因在毕赤酵母中的表达第88-90页
     ·表达系统比较第88-89页
     ·表达载体构建第89页
     ·表达产物的分析第89-90页
   ·荧光定量PCR 对蛋白激酶基因表达差异的分析第90-93页
     ·酵母RNA 提取的难点第90-91页
     ·不同破胞方法与RNA 的完整性第91页
     ·DNA 污染的去除第91页
     ·内参基因的选择第91-92页
     ·实时荧光定量PCR 方法的选择第92页
     ·引物设计第92-93页
     ·模板质量与浓度第93页
     ·循环数第93页
     ·重复实验和阴性、阳性对照实验第93页
   ·打靶载体的构建第93-95页
5 结论第95-96页
参考文献第96-104页
致谢第104页

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