| 中文摘要 | 第1-10页 |
| 英文摘要 | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第12-32页 |
| ·胶质类芽孢杆菌研究现状 | 第12-17页 |
| ·胶质类芽孢杆菌简介 | 第12页 |
| ·胶质类芽孢杆菌的分类地位 | 第12-13页 |
| ·胶质类芽孢杆菌形态特征及生理生化性质 | 第13页 |
| ·胶质类芽孢杆菌的增产机理 | 第13-17页 |
| ·微生物基因组学研究进展 | 第17-25页 |
| ·DNA 测序和基因组学新型技术 | 第17-23页 |
| ·微生物基因组学 | 第23-25页 |
| ·基于PCR 技术的菌种检测 | 第25-29页 |
| ·特异PCR 检测方法 | 第26-27页 |
| ·常用靶基因的比较 | 第27-29页 |
| ·研究目的和意义 | 第29-30页 |
| ·研究内容和技术路线 | 第30-32页 |
| ·研究内容及方法 | 第30-31页 |
| ·技术路线 | 第31-32页 |
| 2 材料与方法 | 第32-61页 |
| ·高效多功能胶质类芽孢杆菌的筛选及生物学功能分析 | 第32-46页 |
| ·菌株 | 第32页 |
| ·试验药品及试剂 | 第32-34页 |
| ·主要仪器 | 第34-35页 |
| ·培养基 | 第35-36页 |
| ·菌种的纯化和保存 | 第36页 |
| ·生理生化实验 | 第36-38页 |
| ·总DNA 的提取与纯度检测 | 第38-39页 |
| ·16S rDNA 序列及gyr B 基因序列PCR 扩增及产物纯化 | 第39-41页 |
| ·目的产物的测序 | 第41-42页 |
| ·类芽孢杆菌属16S rDNA 特异性片段扩增 | 第42-43页 |
| ·菌株生物学功能分析 | 第43-46页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016 全基因组测序 | 第46-54页 |
| ·菌株 | 第46页 |
| ·质粒载体 | 第46页 |
| ·工具酶及DNA 分子量标准 | 第46-47页 |
| ·试剂盒 | 第47页 |
| ·主要试剂及材料 | 第47页 |
| ·主要溶液 | 第47-48页 |
| ·主要仪器及设备 | 第48页 |
| ·培养基 | 第48页 |
| ·鸟枪法基因组文库的构建 | 第48-49页 |
| ·基因组文库的大规模测序 | 第49-51页 |
| ·基因组454 高通量测序 | 第51-54页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016 菌株基因组拼接 | 第54页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016 菌株基因组初步注释 | 第54页 |
| ·胶质类芽孢杆菌菌种水平特异性分子标识的筛选和鉴定 | 第54-61页 |
| ·菌株 | 第54-55页 |
| ·试验药品及试剂 | 第55-56页 |
| ·主要仪器 | 第56页 |
| ·培养基 | 第56页 |
| ·菌种的纯化和保存 | 第56页 |
| ·总DNA 的提取与纯度检测 | 第56页 |
| ·特异性引物的设计和筛选 | 第56-57页 |
| ·最优PCR 条件的建立及验证 | 第57-59页 |
| ·应用于土壤样品的特异性检测 | 第59-61页 |
| 3 结果与分析 | 第61-81页 |
| ·高效多功能胶质类芽孢杆菌的筛选及生物学功能分析结果 | 第61-70页 |
| ·形态学与生理生化特征 | 第61-62页 |
| ·供试菌株总DNA 提取 | 第62页 |
| ·基于16S rDNA 序列的系统进化分析 | 第62-65页 |
| ·基于gyr B 基因序列的系统进化分析 | 第65-67页 |
| ·类芽孢杆菌特异性片段扩增 | 第67页 |
| ·菌株解钾、溶磷、固氮能力的研究结果 | 第67-70页 |
| ·菌株3016 发酵液中植物激素和有机酸的测定结果 | 第70页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016 全基因组测序结果 | 第70-72页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016 基因组序列破译 | 第70页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016 基因组注释 | 第70-72页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016 基因组环形图谱 | 第72页 |
| ·胶质类芽孢杆菌菌种水平特异性分子标识的筛选及鉴定结果 | 第72-81页 |
| ·参考菌株总DNA 的提取结果 | 第72-73页 |
| ·PCR 条件的优化和验证 | 第73-77页 |
| ·应用于土壤样品的特异性检测结果 | 第77-81页 |
| 4 讨论 | 第81-85页 |
| ·高效多功能胶质类芽孢杆菌的筛选及生物学功能分析 | 第81-82页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016 全基因组测序 | 第82页 |
| ·胶质类芽孢杆菌菌种水平特异性分子标识的筛选及鉴定 | 第82-85页 |
| ·引物设计 | 第82-83页 |
| ·PCR 特异性与灵敏度 | 第83-85页 |
| 5 结论 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第98页 |
