| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-8页 |
| 目录 | 第8-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-27页 |
| 1 分子系统学研究进展 | 第11-18页 |
| ·分子系统学 | 第11-12页 |
| ·模型的发展 | 第12-13页 |
| ·DNA 替代模型 | 第13-14页 |
| ·推论方法 | 第14-16页 |
| ·系统发育的统计检验 | 第16页 |
| ·分子系统学分析软件 | 第16-18页 |
| 2 鲇形目鱼类系统发育研究进展 | 第18-20页 |
| ·鲇类系统发育研究进展 | 第19-20页 |
| 3 物种分化时间估计 | 第20-22页 |
| ·分子进化和分子钟的原理与方法 | 第20-21页 |
| ·分子钟检验与molecular-dating 策略 | 第21-22页 |
| 4 本研究的目的 | 第22-27页 |
| 第二章 欧亚大陆鲇形目鱼类系统发育关系研究 | 第27-71页 |
| 1 前言 | 第27-29页 |
| ·现生鲇形目鱼类的分布 | 第27-28页 |
| ·鲇形目鱼类系统发育关系 | 第28-29页 |
| 2 材料与方法 | 第29-38页 |
| ·实验材料 | 第29-30页 |
| ·材料采集及实验样品 | 第29页 |
| ·外类群选择 | 第29页 |
| ·分子标记的选择 | 第29-30页 |
| ·实验步骤 | 第30-35页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第30-34页 |
| ·PCR 扩增 | 第34-35页 |
| ·DNA 纯化和回收 | 第35页 |
| ·测序 | 第35页 |
| ·数据分析方法 | 第35-38页 |
| ·序列的对位排列 | 第35页 |
| ·序列的初步分析 | 第35-36页 |
| ·系统发育分析 | 第36-37页 |
| ·鲇形目鱼类祖先分布区域的重建 | 第37-38页 |
| 3 结果 | 第38-42页 |
| ·序列变异情况 | 第38-39页 |
| ·鲇形目鱼类系统发育关系分析 | 第39-41页 |
| ·Cyt b 基因所有位点序列 | 第40页 |
| ·Cyt b 基因去除第三密码子位点序列 | 第40-41页 |
| ·RAG2 基因序列 | 第41页 |
| ·鲇形目鱼类祖先分布区域 | 第41-42页 |
| 4 讨论 | 第42-47页 |
| ·基因的序列变异及其系统发育意义 | 第42-43页 |
| ·欧亚大陆鲇形目鱼类的系统发育关系 | 第43-47页 |
| 5 小结 | 第47-71页 |
| 第三章 骨鳔下区鱼类分化时间估计及其起源与演化过程研究 | 第71-101页 |
| 1 前言 | 第71-73页 |
| 2 材料与方法 | 第73-78页 |
| ·样品采集 | 第73-74页 |
| ·线粒体基因组长片段PCR 扩增及测序 | 第74-75页 |
| ·序列分析 | 第75页 |
| ·系统发育分析 | 第75-76页 |
| ·Molecular-dating | 第76-77页 |
| ·模拟分析 | 第77-78页 |
| 3 结果 | 第78-81页 |
| ·长臀鮠线粒体基因组的特征 | 第78-79页 |
| ·非编码区 | 第78页 |
| ·rRNA 和tRNA 基因 | 第78-79页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第79页 |
| ·分化时间估计 | 第79-80页 |
| ·Global clock 与relaxed clock 估算的比较 | 第80-81页 |
| 4 讨论 | 第81-86页 |
| ·主要骨鳔下区鱼类的系统发育关系 | 第81-82页 |
| ·利用molecular rates 估计物种分化时间 | 第82-83页 |
| ·化石记录与分化时间 | 第83-86页 |
| 5 小结 | 第86-101页 |
| 参考文献 | 第101-123页 |
| 发表论文目录 | 第123-125页 |
| 致谢 | 第125-127页 |
| 个人简介 | 第127页 |
